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2013 Fiscal Year Research-status Report

1分子蛍光観察手法を用いた分化初期化の単一細胞エピジェネティクス

Research Project

Project/Area Number 24570191
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

藤田 英明  独立行政法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 客員研究員 (50318804)

Keywordsエピジェネティクス / 一分子観察 / ヒストン / 分化
Research Abstract

ヒストンのアセチル化を捉えることが出来るプローブHistacを1分子観察に適合させるため、蛍光ドナー側をphoto activatable GFP (PAGFP)に、アクセプター側を様々な色素に対応させるためにSNAP tagを付与したコンストラクトを作製した。Histacは理化学研究所の佐々木和樹博士が開発したFRETプローブであり、アセチル化したヒストンに結合するブロモドメインとHiston H4複合体が蛍光色素VenusとCFPで挟まれた構造をしている。このHistacを蛍光一分子観察に対応させるため、Venusを光誘起性のPAGFPに、CFPをSNAP tagに置き換えた。この遺伝子を発現させた細胞に外部からSNAPタグに結合する赤色蛍光色素を導入しPAGFPを誘起したところ、青色励起によって細胞核から赤色の蛍光を観察した。アクセプターを退色させるとPAGFPの蛍光が増加したことから、蛍光エネルギー移動が起きていることが確認された。非常に弱くPAGFPを誘起し青色励起光で観察したところ、緑色の蛍光を発する輝点と赤色の蛍光を発する輝点の双方が観察された。すなわち、緑色の蛍光を発する輝点は蛍光エネルギー移動が起きておらずヒストンがアセチル化されている部位、赤色の蛍光を発する輝点は蛍光エネルギー移動が起きていてヒストンがアセチル化されていない部位と考えられる。現在はモデル細胞であるHeLaを使い、また、固定細胞を使って観察を行っているが、今後はESを用い、生細胞で観察を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Histacを用いることにより、ヒストンのアセチル化を一分子で観察することに成功した。現在は実験の容易さからモデル細胞を用いており、観察も細胞を固定後に行っているがエピジェネティカルな変化のダイナミクスを見るためには生細胞観察が必須である。現在、作製したプローブを恒常的に発現するES細胞を準備中であり、準備でき次第生細胞観察を行う予定である。

Strategy for Future Research Activity

現在、レンチウイルスを用いてES細胞に恒常的にプローブを発現させるべく実験を行っているが、培養を続けるとプローブがサイレンシングされてしまうといった問題がある。これについては今後、導入方法を変える(Piggy bacシステムの使用など)ことで対処する。
ヒストンのアセチル化だけでは真にエピジェネティカルな変化を見たとは言いがたい。そのため、ヒストンのメチル化を可視化することも検討中である。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

購入試薬の多くをキャンペーン価格として安く購入できたため。
来年度は消費税増税とそれに伴う商品の値上げにより、支出の拡大が想定される。

  • Research Products

    (8 results)

All 2014 2013

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Four-Dimensional Spatial Nanometry of Single Particles in Living Cells Using Polarized Quantum Rods2013

    • Author(s)
      Tomonobu M. Watanabe, Fumihiko Fujii, Takashi Jin, Eiji Umemoto, Masayuki Miyasaka, Hideaki Fujita, Toshio Yanagida
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 105(3) Pages: 555-564

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2013.07.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Glycine Insertion Makes Yellow Fluorescent Protein Sensitive to Hydrostatic Pressure2013

    • Author(s)
      Tomonobu M. Watanabe, Katsumi Imada, Keiko Yoshizawa, Masayoshi Nishijima, Chiaki Kato, Fumiyoshi Abe, Takamitsu J. Morikawa, Miki Kinoshita, Hideaki Fujita, Toshio Yanagida
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 8(8) Pages: e73212

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0073212

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Evaluating intracellular crowded with a glycine-inserted mutant fluorescent protein2014

    • Author(s)
      Takamitsu Morikawa, Hiroaki Machiyama, Kazuko Okamoto, Keiko Yoshizawa, Hideaki Fujita, Taro Ichimura, Katsumi Imada, Takaharu Nagai, Tohio Yanagida, Tomonobu Watanabe
    • Organizer
      Biophysical Society Meeting, USA
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ・アメリカ合衆国
    • Year and Date
      20140215-20140219
  • [Presentation] Modeling for T cell-mediated immune regulation2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Yamaguchi, Hiroaki Machiyama, Shimon Sakaguchi, Hideaki Fujita
    • Organizer
      日本免疫学会総会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ
    • Year and Date
      20131211-20131213
  • [Presentation] Intracellular measurement of protein-crowding condition by a gene-encoded indicator2013

    • Author(s)
      Takamitsu Morikawa, Keiko Yoshizawa, Hideaki Fujita, Katsumi Imada, Takeharu Nagai, Toshio Yanagida, Tomonobu Watanabe
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      京都国際会館
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Actin filament remodeling in cell-sheet by mechanical stretch2013

    • Author(s)
      Madoka Suzuki, Keiko Kawauchi, Ee Chu Chai, Shota Yamauchi, Shin'ichi Ishiwata, Hideaki Fujita
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      京都国際会館
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Visualization of the molecular-crowding effects in living cell on cellular functions using a FRET-based biosensor2013

    • Author(s)
      Hiroaki Machiyama, Takamitsu Morikawa, Tomoyuki Yamaguchi, Toshio Yanagida, Tomonobu Watanabe, Hideaki Fujita
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      京都国際会館
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Describing the ES cell differentiation pathway using Raman microscopy2013

    • Author(s)
      Taro Ichimura, Liang-da Chiu, Katsumasa Fujita, Satoshi Kawata, Tomonobu M. Watanabe, and Hideaki Fujita
    • Organizer
      EMBO meeting
    • Place of Presentation
      アムステルダム・オランダ
    • Year and Date
      20130921-20130924

URL: 

Published: 2015-05-28  

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