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2014 Fiscal Year Annual Research Report

植物ゲノムに存在する非レトロウイルス様配列の挿入メカニズムと病理学的意義

Research Project

Project/Area Number 24580064
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

近藤 秀樹  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (40263628)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 信弘  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (70206514)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords非レトロRNAウイルス / ゲノム / 感染記録 / うどんこ病菌 / 化石配列 / ダラースポット病菌 / 系統進化 / モノネガウイルス
Outline of Annual Research Achievements

本研究では宿主ゲノム上に存在する非レトロRNAウイルス様配列(NRVS, 古のウイルス感染記)のさらなる探索を、植物ならびに関連の深い昆虫や菌類で展開し,それらと現代ウイルスとの関係を理解することを目指している。さらに、これらのNRVS配列のゲノム挿入メカニズムや配列の存在意義を理解するための基盤整備を目的とした。本年度の主な実績は以下の通り。

1.植物・昆虫類ゲノム上のNRVS検索では、植物RNAウイルス(アルファウイルス様スーパーファミリー)の複製酵素類似配列が数種昆虫種で見出されている。このうちマルハナバチ属の解析では、ゲノムPCRにより異なる種間で近似のNRVS配列が増幅され、挿入イベントがマルハナバチの種分化のタイミングまで遡ると想像された。また、他の昆虫類の転写物データベースに現代版の近縁ウイルスの存在も示唆された。分子系統解析の結果、これらのNRVSは既知植物ウイルス(ビルガ、ブロモ、クロステロウイルス科など)とは独立したクレードを形成した。

2. NRVS検索で発見した菌類モノネガウイルス(マイナス鎖RNAウイルス)の一種は,昨年度ダラースポット病菌に存在することを見出した。本年度は、新たに食用キノコに別種のモノネガウイルスの感染が示唆され、その部分配列を取得した。さらに、データベースの転写物やゲノム配列の再検索を行った結果、昆虫類に多様なモノネガウイルスの存在が示唆された。これらの配列を用いた分子系統解析により、既知のラブド、フィロ、パラミクソ、ボルナ、ニャミウイルス科とは独立した複数のクレードが確認され、未知のウイルス科を形成するグループの存在が示唆された。

  • Research Products

    (6 results)

All 2015 2014

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Transcriptional mapping of the messenger and leader RNAs of orchid fleck virus, a bisegmented negative-strand RNA virus.2014

    • Author(s)
      Kondo, H., Maruyama, K., Chiba, S., Andika, I. B., Tamada, T. and Suzuki, N.
    • Journal Title

      Virology

      Volume: 452-453 Pages: 166-174

    • DOI

      doi: 10.1016/j.virol.2014.01.007.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discovery of negative-strand RNA virus infection in fungi.2014

    • Author(s)
      Kondo, H., Chiba, S. and Suzuki, N.
    • Journal Title

      Proc. Symp. 9th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors

      Volume: 1 Pages: 55-57

  • [Presentation] Deep sequencing解析により明らかになったBotrytis tulipae の9種ウイルスによる混合感染2015

    • Author(s)
      近藤秀樹・久野 昌・林 諭昕・千葉壮太郎・鈴木信弘
    • Organizer
      平成27年度日本植物病理学会大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2015-03-28 – 2015-03-31
  • [Presentation] 近藤 秀樹・千葉 壮太郎・鈴木 信弘. 菌類に感染するマイナス鎖RNAウイルス2014

    • Author(s)
      近藤 秀樹・千葉 壮太郎・鈴木 信弘
    • Organizer
      29回中国四国ウイルス研究会
    • Place of Presentation
      山口
    • Year and Date
      2014-06-28 – 2014-06-29
  • [Presentation] 2分節マイナス鎖RNAウイルスであるランえそ斑紋ウイルス(OFV)のmRNAおよびleader RNAの特性2014

    • Author(s)
      近藤秀樹・丸山和之・千葉壮太郎・鈴木信弘
    • Organizer
      平成26年度日本植物病理学会大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-06-02 – 2014-06-04
  • [Book] Detection and analysis for non-retroviral RNA virus-like elements in plant, fungal and insect genomes. in Plant Virology Protocols (Methods in Molecular Biology 1236, Springer Protocol): New approaches to detect viruses and host responses. eds, Uyeda, I and Masuta C.2015

    • Author(s)
      Kondo, H., Chiba, S. and Suzuki, N.
    • Total Pages
      73-88
    • Publisher
      Humana Press Inc.

URL: 

Published: 2016-06-01  

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