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2012 Fiscal Year Research-status Report

天然物をモデルとした機能性分子プローブの創製研究

Research Project

Project/Area Number 24580168
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

高橋 俊哉  独立行政法人理化学研究所, 物質構造解析チーム, 専任研究員 (00202151)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords機能性分子プローブ
Research Abstract

本年度は、強力なTNF-α発現制御活性を持つバイナリンBのターゲット分子解明に向けて、バイナリンBの活性を保持しながら化学的にも安定なバイオプローブのデザインと合成を検討した。これに先立ち、既に申請者は、バイナリンBの構造類縁体でありほぼ同様の生物活性を有するバイナリンAのアドバンストアナログとして、フェニルアセトキシル基をメチル基に置き換えた化合物を創製した。さらに最近、生化学者と共同で、そのターゲット分子の一つとしてユビキチナーゼの一種USP5を同定する事に成功した。この知見を基に、バイナリンBのアナログとしても同様にジメチル化された化合物の合成を行った。バイナリンBはバイナリンAと異なりベンゾフラン環を有することが構造上の特徴である。そこで、バイナリンAアナログの合成の時とは異なり、p-テルフェニル骨格構築の際にジメチルカテコール誘導体に左右異なるベンゼン環の導入が必要であった。まず、フラン環形成のため塩素原子を持つボロン酸を調製し、市販のp-アルキルオキシボロン酸と共に鈴木ー宮浦カップリングを検討した。その結果、市販のボロン酸とのカップリングは酢酸パラジウムーBuchwaldリガンド、あるいは炭酸セシウムーテトラキストリフェニルホスフィンパラジウムともに良好な結果を与えたが、塩素原子を持つボロン酸の場合は、後者の組み合わせの方が良い結果を与えた。そこで、この条件下ワンポットでカップリング反応を行い、左右異なるベンゼン環を持ったp-テルフェニル化合物を合成した。カテコール部分をフリーとした後、Ullmann反応を行うと、目的とするジフェニルベンゾフラン骨格が構築できた。さらに、保護基をすべて除去するとバイナリンBアドバンストアナログの合成に成功した。また、プロパルギル基の導入と続くクリック反応によりビオチニル基を導入し、2種の分子プローブの創製を達成した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は、バイリニンAを構造モチーフにデザインした分子プローブを活用して、そのターゲットの一つとしてユビキチナーゼの一種USP5を同定する事に成功した。バイナリンBターゲットを探索するためのプローブも、この知見を基にデザインされ、ジブロモジメチルカテコール誘導体と2種のボロン酸との鈴木ー宮浦カップリングと分子内Ullmannカップリングを経て、ジメチル化されたバイナリンBアナログを合成した。プローブのコア部分を形成する分子の合成に成功した事は極めて重要であり、多彩な機能性分子プローブの創製に展開が可能である。さらに、リンカーの導入並びにクリックケミストリーを使ったビオチンのカップリングにまで成功しており、現在、得られた位置異性体混合物の分離精製を行っている段階である。生成物の各種溶媒への溶解性の低い点が、予想しなかった問題点であり、各種溶媒への溶解性を向上させるためベンゼン環上の修飾等の検討が目下の課題となっている。これらのアナログがバイナリンAのアナログと同様に、有効な機能性分子プローブとなるかどうかは、活性試験による評価が必要である。

Strategy for Future Research Activity

合成された分子プローブが各種溶媒へ溶けにくい事に加えて、熱や酸素などにやや不安定な高極性の分子であることから、現在行っているシリカゲルクロマトグラフィーを使う方法ではなく、HPLCを用いる精製により高純度のプローブを調製する予定である。そのため、生成物の各種溶媒への溶解性を種々検討するが、溶解性の向上が見られない場合は、末端ベンゼン環へ官能基の導入を行ったり、ビオチン部位と結合させるリンカーの長さを変えることで、分子の取り扱い易さを変化させる予定である。プローブ分子が高純度で精製できれば、共同研究者による生物試験が行われ、バイリニンAの時と同様に、ターゲット分子の探索を行う。生物試験もまず、酵素阻害活性から検討を行っていく。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

合成された分子プローブが当初の予想に反して各種溶媒に溶けにくく、シリカゲルクロマトグラフィーのみでは精製できなかった。従って、プローブを作成するリンカーならびにビオチンユニット側の再デザインが必要となり、プローブの大量合成用として当初必要であった各種試薬の購入を見送ったため、次年度使用額が発生した。翌年度分として請求した助成金と合わせて、再デザインされたプローブのリンカーならびに第2のプロジェクトであるバンレイシアセトゲニンの蛍光標識プローブの合成を達成するための各種試薬代に用いられる。また、プローブ類の高純度精製に使用されるHPLCの展開溶媒代にも本助成金があてられる。

  • Research Products

    (9 results)

All 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Total synthesis of curvulone B and a proposed structure for dothiorelone B; determination of the configuration of curvulone B and structural revision of phomopsin A2012

    • Author(s)
      Takahashi S., Akita Y., Nakamura T., and Koshino H.
    • Journal Title

      Tetrahedron Asymmetry

      Volume: 23 Pages: 952-958

    • DOI

      10.1016/j.tetasy.2012.06.009

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis and biological activity of both enantiomers of kujigamberol isolated from 85-million-years-old Kuji amber2012

    • Author(s)
      Ye Y-Q., Koshino H., Hashizume D., Minamikawa Y., Kimura K., Takahashi S.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 22 Pages: 4529-4262

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.05.022

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inhibitory effects of vialinin A and its advanced analog on TNF-α release and production from RBL-2H3 cells2012

    • Author(s)
      Onose J., Yoshioka Y., Ye Y-Q., Sugaya K., Yajima A., Taniguchi K., Okada K., Yajima S., Takahashi S., Koshino H., Abe N.
    • Journal Title

      Cell. Immunol.

      Volume: 279 Pages: 140-144

    • DOI

      10.1016/j.cellimm.2012.10.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kujigamberol, a new dinorlabdane diterpenoid isolated from 85 million years old Kuji amber using a biotechnological assay2012

    • Author(s)
      Kimura K., Minamikawa Y., Ogasawara Y., Yoshida J., Saitoh K., Shinden H., Ye Y-Q., Takahashi S., Miyakawa T., Koshino H.
    • Journal Title

      Fitoterapia

      Volume: 83 Pages: 907-912

    • DOI

      10.1016/j.fitote.2012.03.024

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of a vialinin A analog with a potent inhibitory activity of TNF-α production and its transformation into a couple of bioprobes2012

    • Author(s)
      Ye Y-Q., Onose J., Abe N., Koshino H., and Takahashi S.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 22 Pages: 2385-2387

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.02.034

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] TNF-α放出阻害物質vialinin AのRBL-2H3細胞における標的分子の同定

    • Author(s)
      岡田潔、叶躍奇、吉岡泰淳、谷口佳代子、本橋寛子、菅谷紘一、小野瀬淳一、高橋俊哉、越野広雪、矢島新、矢嶋俊介、阿部尚樹
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス(仙台)
  • [Presentation] Vialinin A標的分子USP5の活性化抑制がTNF-α放出に与える影響

    • Author(s)
      吉岡泰淳、岡田潔、叶躍奇、谷口佳代子、菅谷紘一、小野瀬淳一、高橋俊哉、越野広雪、矢島新、矢嶋俊介、阿部尚樹
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス(仙台)
  • [Presentation] Vialinin Aアナログ誘導体を分子プローブとして用いた細胞内標的 タンパク質の同定とTNF-α放出阻害作用の解析

    • Author(s)
      阿部尚樹、吉岡泰淳、叶躍奇、岡田潔、谷口佳代子、菅谷紘一、小野瀬淳一、高橋俊哉、越野広雪、矢島新、矢嶋俊介
    • Organizer
      第54回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京)
  • [Presentation] ビオチン標識化Vialinin Aアナログによる細胞内標的分子の同定と TNF-α放出阻害作用の解析

    • Author(s)
      吉岡泰淳、叶躍奇、岡田潔、谷口佳代子、菅谷紘一、小野瀬淳一、高橋俊哉、越野広雪、矢島新、矢嶋俊介、阿部尚樹
    • Organizer
      2012年 日本ハーブ療法研究会 設立記念学術集会
    • Place of Presentation
      光の家会館(東京)

URL: 

Published: 2014-07-24  

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