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2012 Fiscal Year Research-status Report

有害・有毒プランクトンへの高効率な新奇遺伝子導入系の開発

Research Project

Project/Area Number 24580268
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionKochi University

Principal Investigator

足立 真佐雄  高知大学, 教育研究部自然科学系, 教授 (70274363)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大西 浩平  高知大学, 教育研究部総合科学系, 教授 (50211800)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords有害・有毒プランクトン / 形質転換 / ウイルスプロモーター
Research Abstract

1、プランクトン感染性ウイルス由来のプロモーターの分離  ノリの色落ちの原因藻の1種として知られる珪藻Rhizosolenia属に感染するウイルスさらには魚類の斃死を引き起こすラフィド藻Heterosigma akashiwoに感染するウイルスに注目し、連携研究者から分譲を受けたこれらのウイルス粒子より、ゲノムDNAをそれぞれ抽出した。同時に、提供を受けたウイルスのゲノムDNAの部分配列を解析した。その際、DNA配列の精度を高めるために繰り返し配列決定を行った後に、これらに含まれる遺伝子領域を特定することに成功した。これを踏まえて、プロモーター(遺伝子のスイッチの役割を果たす)を含むその上流領域を、PCR法により増幅することに成功した。
2、各種ウイルスプロモーターを組み込んだ遺伝子導入用プラスミドの構築  遺伝子導入用プラスミドの構築のために、MultiSite Gateway Proシステム(invitrogen社製)を用いることにより、抗生物質耐性遺伝子と、上記のウイルス由来のプロモーターとターミネーターをそれぞれプラスミドに組み込むことに成功した。
3、有毒・有毒プランクトンの抗生物質感受性試験  上述したプランクトンについて感受性試験を行った結果、いずれの藻も抗生物質ノールセオスリシンに対して感受性を示すことが明らかとなった。
以上の結果により、これまで全く報告の無い上記の有害藻への遺伝子導入を行う際に必須となるツールならびに情報が取得出来た。よって、これら有害プランクトンへの遺伝子導入法を世界に先駆けて確立するための基盤が整った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

「1、プランクトン感染性ウイルス由来のプロモーターの分離」に関しては、交付申請書に記載したノリの色落ちの原因藻の1種として知られる珪藻Rhizosolenia属に感染するウイルス、魚類の斃死を引き起こすラフィド藻Heterosigma akashiwoに感染するウイルス、さらに貝類の斃死を引き起こす渦鞭毛藻Heterocapsa circularisquamaに感染するウイルスのうち、前2者についてそのプロモーターを含む領域の分離に成功した。また、「2、各種ウイルスプロモーターを組み込んだ遺伝子導入用プラスミドの構築」についても、得られた2種のプロモーターのいずれについても、これらを組み込んだ遺伝子導入用ベクターの構築に成功することが出来た。さらに、「3、有毒・有毒プランクトンの抗生物質感受性試験」についても、いずれの藻についてもその感受性を明らかにすることが出来た。以上のことから、研究はおおむね順調に進展していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

今年度得られた結果に基づき、次年度は以下の研究項目について検討する。
1、有害・有毒プランクトンの固相培養系の確立  Rhizosolenia属藻ならびにHeterosigma属藻の固相培養法を検討する。その際、寒天培地を用いた一般的な塗抹培養法に加えて、近年報告された超低濃度のアガロースを用いた混釈固相培養法(Lakeman & Cattolico 2007)についても検討し、これらの培養系の確立を図る。
2、パーティクルガンを用いた有害・有毒プランクトンへの遺伝子導入法の検討  今年度作製した藻類ウイルスのプロモーターを含む遺伝子導入用プラスミドを用いて、上記2種を用いてパーティクルガン法(Miyagawa et al. 2009)により、遺伝子導入を試みる。その際、打ち込み時の諸条件について検討することにより、最も高い形質転換効率が得られる条件を解明する。
3、導入遺伝子の発現量解析ならびにプロモーターの適用範囲の検討
遺伝子導入した抗生物質耐性遺伝子の発現量をRT-qPCR法を用いて客観的に評価する。さらに、それぞれのウイルスプロモーターが、どの範囲の生物種に対し適用可能か、検討を試みる。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

該当なし

  • Research Products

    (13 results)

All 2013 2012

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Effects of temperature, salinity and their interaction on growth of toxic Ostreopsis sp. 1 and Ostreopsis sp. 6 (Dinophyceae) isolated from Japanese coastal waters.2013

    • Author(s)
      Yuko Tanimoto, Haruo Yamaguchi, Takamichi Yoshimatsu , Shinya Sato and Masao Adachi
    • Journal Title

      Fisheries Science

      Volume: 79 Pages: 285-291

    • DOI

      10.1007/s12562-013-0597-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantitative PCR Method for Enumeration of Cells of Cryptic Species of the Toxic Marine Dinoflagellate Ostreopsis spp. in Coastal Waters of Japan.2013

    • Author(s)
      Naohito Hariganeya, Yuko Tanimoto, Haruo Yamaguchi, Tomohiro Nishimura, Wittaya Tawong, Hiroshi Sakanari, Takamichi Yoshimatsu, Shinya Sato, Christina M. Preston, Masao Adachi
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 8 Pages: e57627

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0057627

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Culture method and growth characteristics of the marine benthic dinoflagellate Ostreopsis spp. isolated from Japanese coastal waters.2012

    • Author(s)
      Haruo Yamaguchi, Yuko Tanimoto, Takamichi Yoshimatsu, Shinya Sato, Tomohiro Nishimura, Keita Uehara, Masao Adachi
    • Journal Title

      Fisheries Science

      Volume: 78 Pages: 993-1000

    • DOI

      10.1007/s12562-012-0530-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of temperature, salinity and their interaction on growth of the benthic dinoflagellate Ostreopsis cf. ovata (Dinophyceae) from Japanese coastal waters.2012

    • Author(s)
      Haruo Yamaguchi, Takamichi Yoshimatsu, Yuko Tanimoto, Shinya Sato, Tomohiro Nishimura, Keita Uehara, Masao Adachi
    • Journal Title

      Phycological Research

      Volume: 60 Pages: 297-304

    • DOI

      10.1111/j.1440-1835.2012.00660.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] LC-MS/MS analysis of novel ovatoxin isomers in several Ostreopsis strains collected in Japan.2012

    • Author(s)
      Toshiyuki Suzuki, Ryuichi Watanabe, Hajime Uchida, Ryoji Matsushima, Hiroshi Nagai, Takeshi Yasumoto, Takamichi Yoshimatsu, Shinya Sato, Masao Adachi
    • Journal Title

      Harmful Algae

      Volume: 20 Pages: 81-91

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Effect of temperature change on the dominant species of Gambierdiscus in Japan - from a non-toxic species to a toxic species2012

    • Author(s)
      Masao Adachi, Takamichi Yoshimatsu, Haruka Iwamoto, Tomohiro Nishimura and Haruo Yamaguchi
    • Organizer
      15th ICHA 2012 KOREA
    • Place of Presentation
      Gyeongnam, Korea
    • Year and Date
      20121029-20121102
  • [Presentation] Development of a quantitative PCR assay for the detection and enumeration of the ciguatera-causing dinoflagellate Gambierdiscus spp. in Japanese coastal areas.2012

    • Author(s)
      Tomohiro Nishimura, Naohito Hariganeya, Tawong Wittaya, Hiroshi Sakanari, Yuko Tanimoto, Haruo Yamaguchi and Masao Adachi
    • Organizer
      15th ICHA 2012 KOREA
    • Place of Presentation
      Gyeongnam, Korea
    • Year and Date
      20121029-20121102
  • [Presentation] Effects of temperature and salinity on growth of toxic dinoflagellate Ostreopsis spp. isolated from Japanese coastal area.2012

    • Author(s)
      Yuko Tanimoto, Haruo Yamaguchi, Takamichi Yoshimatsu and Masao Adachi
    • Organizer
      15th ICHA 2012 KOREA
    • Place of Presentation
      Gyeongnam, Korea
    • Year and Date
      20121029-20121102
  • [Presentation] The phylogeny of the dinoflagellate Ostreopsis spp. from Thailand.2012

    • Author(s)
      Wittaya Tawong, Tomohiro Nishimura, Hiroshi Sakanari, Haruo Yamaguchi and Masao Adachi
    • Organizer
      15th ICHA 2012 KOREA
    • Place of Presentation
      Gyeongnam, Korea
    • Year and Date
      20121029-20121102
  • [Presentation] Clarification of growth-irradiance relationships in the toxic Ostreopsis species cultures using the newly devised method.2012

    • Author(s)
      Haruo Yamaguchia, Yuya Tomoria, Yuko Tanimotoa, Masao Adachi
    • Organizer
      15th ICHA 2012 KOREA
    • Place of Presentation
      Gyeongnam, Korea
    • Year and Date
      20121029-20121102
  • [Presentation] Effect of temperature change on the dominant species of Gambierdiscus in Japan - From a non-toxic species to a toxic species?2012

    • Author(s)
      Masao Adachi, Takamichi Yoshimatsu, Haruka Iwamoto, Tomohiro Nishimura and Haruo Yamaguchi
    • Organizer
      PICES 2012 Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Hiroshima, Japan
    • Year and Date
      20121012-20121020
    • Invited
  • [Presentation] Transformation of the diatom Rhizosolenia setigera using diatom infecting viral promoters.2012

    • Author(s)
      Kazunari Fukunaga, Naoto Hariganeya, Haruo Yamaguchi, Yuji Tomaru, Keizo Nagasaki, Masao Adachi
    • Organizer
      The 9th APMBC2012
    • Place of Presentation
      Kochi, Japan
    • Year and Date
      20120713-20120715
  • [Presentation] Algal Viral Promoter Useful for Marine Diatom Transformation.2012

    • Author(s)
      Masao Adachi, Arisa Miyagawa-Yamaguchi, Yuji Tomaru, Keizo Nagasaki, Kazunari Fukunaga, Kohei Ohno, Takuma Okami, Nozomu Kira, Kohei Ohnishi and Haruo Yamaguchi
    • Organizer
      2nd International conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
    • Place of Presentation
      Westin San Diego, USA
    • Year and Date
      20120610-20120613

URL: 

Published: 2014-07-24  

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