2012 Fiscal Year Research-status Report
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24590489
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Research Institution | Iwate Medical University |
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Principal Investigator |
柴崎 晶彦 岩手医科大学, 医学部, 助教 (20445109)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
前沢 千早 岩手医科大学, 医学部, 教授 (10326647)
赤坂 俊英 岩手医科大学, 医学部, 教授 (30137525)
杉山 徹 岩手医科大学, 医学部, 教授 (40162903)
柏葉 匡寛 岩手医科大学, 医学部, 講師 (80326660)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 腫瘍 / 非翻訳RNA |
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| Research Abstract |
エピジェネティックによる遺伝子発現制御には、DNAに結合して近傍クロマチンの修飾状態を制御する数多くのたんぱく質が関与しており、古くからタンパク質間相互作用でクロマチン制御複合体を形成することが知られていた。しかし近年、ポリコーム複合体などの抑制因子がリクルートする新たな機構として、非翻訳RNAの一種lincRNAsが足場として関与することが明らかとなった。現在、lincRNAは約8,000種類存在することが知られているが、linc RNAの機能と標的遺伝子が明らかになっているものは僅かである。既知lincRNAのうち、X染色体の不活化に関与するXistや、インプリンティングに関与するAir、Kcnq1は、それらが転写された近傍に存在する遺伝子（シス領域）の転写制御に関与している。
我々は上記の背景をもとに、腫瘍としての生物学的特性を獲得・維持する過程で、何らかのlincRNAの発現変化が関与していると考え、次世代シークエンサーを用いlincRNAの網羅的解析を行った。その結果、正常細胞といくつかの腫瘍細胞間で変化が著しい数種類のlincRNAを見出しており、腫瘍特異的なlincRNAの存在を予想している。現在、正常細胞が腫瘍化する過程においてクロマチンのリプログラミングに関与しうるlincRNAをスクリーニングするために、形質転換細胞の樹立を行っている。今後、前述の形質転換細胞を用いて造腫瘍性を指標としてクロマチンレベルでの遺伝子発現の解析、さらには腫瘍形質における関与や手術検体を用いた機能的解析を順次行う予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
腫瘍化の過程でクロマチンのリプログラミングに関与するlincRNAを効率的にスクリーニングするために形質転換細胞を用いた実験系を構築している。これは正常細胞に既知遺伝子を導入することで腫瘍細胞に形質転換する実験系であり、形質転換前の正常細胞を比較対象に用いることが出来る点が優れている。昨年度は形質転換するための遺伝子群の組み合わせや遺伝子の導入方法を検討した。現在、形質転換細胞の造腫瘍性等の検討を始める段階である。これはlincRNAの機能解析に至る前段階であり、上記の自己評価とした。
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| Strategy for Future Research Activity |
腫瘍に関わる因子は腫瘍の種類に特異的である場合が多い。既知lincRNAのうち、現在腫瘍との関連が知られるHOTAIRは乳がんや大腸がんで特に高発現がみられる。我々がこれまでに乳がん細胞株においてスクリーニングした機能が未知なlincRNA群が、他の腫瘍において共通のものか、または特異的なものかを検討する。また形質転換細胞を用い、次世代シークエンサーを用いたトランスクリプトーム解析を行い、lincRNAの発現差異を各細胞間で比較検討する。それにより各種腫瘍間で特異的なもの、さらには共通なものをスクリーニングし、以降の詳細な解析に賦す。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
主に汎用試薬、次世代シーケンサー用試薬等、消耗品費として支出予定である。
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