2012 Fiscal Year Research-status Report

胆道がんの分子標的治療を目指した包括的ゲノム解析の応用

Research Project

Project/Area Number	24591006
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	木暮宏史東京大学, 医学部附属病院, 助教 (60568921)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	立石敬介東京大学, 医学部附属病院, 助教 (20396948)
Project Period (FY)	2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords	胆道がん
Research Abstract	がんの発生・進展において、遺伝子上のヒストン修飾制御状態の異常を介した遺伝子発現変化の重要性が注目を集めつつあるが、胆道がんにおけるその関与には不明な点が多い。細胞のゲノム上では、特定の遺伝子領域で増幅や欠失が起こることが知られている。大規模SNPタイピングを目的として開発された高密度オリゴヌクレオチドアレイが、染色体コピー数変化およびLOHを同時に解析できることから、当研究室ではこのアレイを用いて数種類の胆道がんを含めた消化器癌細胞株のゲノム異常の網羅的解析を行ってきた解析の結果、胆道がんにおいて新規に増幅および欠失あるいはLOHを認めた染色体領域の中に、ヒストン修飾酵素遺伝子も含まれていた。また、胆道がんにて手術が行われた症例に対し、倫理委員会ですでに承認の得られている同意説明文書にて十分に説明し、文書同意を得た後、血清、膵液、胆汁、癌部・非癌部の組織を取得してきた。これらの患者の臨床情報については個人情報保護を遵守しつつ詳細な情報を記録するデータベースを構築してきた。この臨床検体を用いて、胆道癌細胞株における検討から得られた遺伝子異常についてvalidationを行っている。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason 上記のように高密度オリゴヌクレオチドアレイを用いて数種類の胆道がんを含めた消化器癌細胞株のゲノム異常の網羅的解析を行ってきた。さらに解析の結果、胆道がんにおいて新規に増幅および欠失あるいはLOHを認めた染色体領域の中に、ヒストン修飾酵素遺伝子も含まれていることを見出した。
Strategy for Future Research Activity	SNPアレイを用いて胆道がん細胞株で同定したヒストン修飾因子などの遺伝子異常について、臨床検体を用いてその再現性を検討する。結果について胆管、胆道、肝内胆管など発生部位の異なる胆道がんごとにデータを収集・総括し、遺伝子異常が発生部位あるいは臨床医学的特徴に関連するのかどうかも検討する。臨床検体収集について倫理委員会の承認は取得済みである。今回の胆道がん細胞株での検討から得られた遺伝子領域増幅および欠失についてはそれぞれの遺伝子座について定量的PCRを行うことでそのコピーナンバーを検出する。その際には既報において検討した実験条件を活用する（Lin LJ,et al. Oncology. 2008;75(1-2):102-12.）。
Expenditure Plans for the Next FY Research Funding	主として遺伝子異常を解析する目的のSNPアレイ、シークエンスなどに使用する試薬類、消耗品の購入に充てる予定である。また当該遺伝子を過剰発現あるいはノックダウンした細胞の移植実験に用いるマウスの購入費や飼育費にも使用する。