ＮＩＩＤの次世代シークエンサーを用いた病因遺伝子の同定

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 24591257
• Research Institution: Nagoya University
• Principal Investigator: 曽根 淳 名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 寄附講座助教 (40513750)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 田中 章景 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30378012) [Withdrawn] ; 小池 春樹 名古屋大学, 医学部附属病院, 講師 (80378174)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Keywords: NIID / 核内封入体 / 皮膚生検 / 次世代シークエンサー / 連鎖解析

Outline of Annual Research Achievements

我々は、前年度までに、常染色体優性遺伝形式を示したNIID家系2家系について、DNAサンプルを収集した上で、次世代シークエンサーを用いた全ゲノム解析および全エクソン解析を行ない、得られた遺伝子の配列解析を行なった。さらにCGHアレイを用いたCNV解析についても行なった。本年はこれらの解析により、いくつかのSNVがNIIDの原因遺伝子と成っている可能性が高いと見込まれた為、遺伝子産物に対する抗体を用いて、NIID剖検組織サンプルを用いた免疫染色での検討を行なった。
また、ここ数年の間に、認知症を主症状とした孤発性NIIDの診断例が、皮膚生検を活用することで増加してきており、家族性NIID例と同様に、ゲノムおよび免疫組織学的検討に組み込んだ。
さらに、今まで行ってきたゲノム解析データを、再度バイオインフォマティクスのデータを用いて詳しく検討し直すことを進めた。特に、一塩基変異であるSNVが原因遺伝子変異ではない可能性にも検索の範囲を広げ、検討を進めた結果、現時点では有望な候補領域をいくつか同定している。FXTAS (fragile X-associated tremor/ataxia syndrome)の様に、Repeat 配列の延長が疾患の原因と成っている可能性も考慮し、連鎖解析で得られた候補領域内のRepeat配列について、PacBioシークエンサーなどの最新型の次世代シークエンサーを用いた解析について今後検討が必要であるという結論に至った。

Research Products

• [Journal Article] Neuronal intranuclear inclusion disease presenting with resting tremor (2014)
  • Author(s): Kitagawa N, Sone J, Sobue G,Kuroda M, Sakurai M
  • Journal Title: Case Rep Neurol. Volume: 6(2) Pages: 176-80.
  • DOI: 10.1159/000363687
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] 皮膚生検により診断したNeuronal intranuclear inclusion disease 15例の検討 (2014)
  • Author(s): 曽根淳、荒木邦彦、藤岡祐介、稲垣智則、桝田道人、岩崎靖、吉田眞理、田中章景、祖父江元
  • Organizer: 第33回日本認知症学会学術集会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜、神奈川県横浜市
  • Year and Date: 2014-12-01
• [Presentation] 皮膚生検によるNeuronal intranuclear inclusion diseaseの診断について (2014)
  • Author(s): 曽根淳、北川尚之、岩崎靖、吉田眞理、田中章景、祖父江 元
  • Organizer: 第32回日本神経治療学会総会
  • Place of Presentation: 東京ドームホテル、東京都文京区
  • Year and Date: 2014-11-22
• [Presentation] Antemortem diagnosis of Neuronal intranuclear inclusion disease. (2014)
  • Author(s): Jun Sone, Naoyuki Kitagawa, Tomonori Inagaki, Yasushi Iwasaki,Mari Yoshida, Fumiaki Tanaka, Gen Sobue
  • Organizer: Neuroscience 2014
  • Place of Presentation: Washington convention center, Washington, USA
  • Year and Date: 2014-11-19
• [Presentation] Strategy to discover new ALS causative genetic variants in Japanese ALS patients. (2014)
  • Author(s): J.Sone, R.Nakamura, M.Nakatochi, H.Watanabe, N.Atsuta, F.Tanaka, G.Sobue.
  • Organizer: 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
  • Place of Presentation: San Diego convention center, San Diego, USA
  • Year and Date: 2014-10-21
• [Presentation] Analysis of major amyotrophic lateral sclerosis genes in Japan. (2014)
  • Author(s): Ryoichi Nakamura, Jun Sone, Naoki Atsuta, Hazuki Watanabe, Akihiro Hirakawa, Hirohisa Watanabe, Mizuki Ito, Jo Senda, Masahisa Katsuno, Fumiaki Tanaka, Yuishin Izumi, Mitsuya Morita, Kotaro Ogaki, Akira Taniguchi, Ikuko Aiba,Koichi Mizoguchi, Koichi Okamoto, Kazuko Hasegawa, Masashi Aoki, Akihiro Kawata
  • Organizer: 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
  • Place of Presentation: San Diego convention center, San Diego, USA
  • Year and Date: 2014-10-21
• [Presentation] Clinical feature of 19 cases of Neuronal intranuclear inclusion disease diagnosed by skin biopsy. (2014)
  • Author(s): Jun Sone, Naoyuki Kitagawa, Eriko Sugawara, Masaaki Iguchi, Tomonori Inagaki, Hajime Yoshimura, Junko Ishii, Michi Kawamoto, Keiko Mori, Kunihiko Araki, Michihito Masuda, Mari Yoshida, Yasushi Iwasaki, Fumiaki Tanaka, Gen Sobue
  • Organizer: XVIII International Congress of Neuropathology
  • Place of Presentation: Sheraton Rio Hotel, Rio De Janeiro, Brasil
  • Year and Date: 2014-09-15
• [Presentation] 皮膚生検により診断したNeuronal intranuclear inclusion disease 18 例の臨床学的特徴 (2014)
  • Author(s): 曽根淳、北川尚之、菅原恵梨子、違口正明、稲垣智則、吉村元、石井淳子、川本未知、森恵子、岩崎靖、吉田眞理、田中章景、祖父江元
  • Organizer: 第55回日本神経学会総会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場、福岡県福岡市
  • Year and Date: 2014-05-24