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2013 Fiscal Year Research-status Report

ケトン体代謝とその異常症の解析―SCOT遺伝子発現調節機構の解明を中心にしてー

Research Project

Project/Area Number 24591505
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

深尾 敏幸  岐阜大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (70260578)

Keywordsケトン体代謝 / 先天代謝異常症 / スプライシング / 遺伝子異常 / 遺伝子発現調節 / OXCT1 / ChiPアッセイ
Research Abstract

申請者らはこれまで、ケトン体代謝とその異常症の研究をすすめてきた。本研究の目的は、これまで研究を進める中で得られた課題である.1)ミスセンス変異のRNAプロセッシングへの影響を明らかにすること2)SCOT遺伝子の遺伝子発現調節機構について解析し、特にSCOT遺伝子が肝臓特異的に発現抑制を受けるメカニズムについて明らかにすることである。
本年度においては1)については昨年に引き続きT2遺伝子のうちミスセンス変異が比較的多いエクソン10を選択し、ミスセンス変異の導入を試み、いくつかのconstructsの作成を行っている. 今後mini-gene splicing experimentsを行い、どの程度RNAプロセッシングに影響するのかについて検討したい。2)についてはこれまでも取り組んできたが、マウスのSCOT遺伝子の解析を追加し、マウスの肝臓、腎臓を材料としたRNA polymerase IIによるChiPアッセイを行ってきたが、肝臓でのRNA転写の低下している結果は得られているが、転写オフと言えるほどの明確な結果は得られず、アセチル化ヒストン、メチル化ヒストンなどのChiPアッセイを追加するように計画中である.バイオインフォーマテイクスを用いた5‘非コード領域の多動物種比較解析によっても明確な肝臓特異的抑制を来す部位の同定に至っていない.SCOT遺伝子3’非翻訳領域の miRNAの影響をみるためのconstructsも作成中である.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本年度の研究においては、予定より進行が遅れており、その要因の1つはconstructsの作成に手間取っていることで、通常の変異導入、ベクター作成による方法では、効率が悪く、現在新たな変異導入、ベクター作成法の導入が必要と考えて検討中である.また想定していたより多種動物間の配列比較による検討が、翻訳領域のように容易ではなく、この解析は方針の変更が必要である.

Strategy for Future Research Activity

現在新たなベクター構築法としてIn Fusion法を検討しており、これがうまくいけばConstructs の作成が迅速に行えると考えている.

  • Research Products

    (11 results)

All 2014 2013

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Metabolic encephalopathy in beta-ketothiolase deficiency: The first report from India.2014

    • Author(s)
      Akella RR, Aoyama Y, Mori C, Lingappa L, Cariappa R, Fukao T.
    • Journal Title

      Brain Dev

      Volume: undefiied Pages: in press

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2013.07.007.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A structural mapping of mutations causing succinyl-CoA:3-ketoacid CoA transferase (SCOT) deficiency.2014

    • Author(s)
      Shafqat N, Kavanagh KL, Sass JO, Christensen E, Fukao T, Lee WH, Oppermann U, Yue WW.
    • Journal Title

      J Inherit Metab Dis

      Volume: undefined Pages: in press

    • DOI

      10.1007/s10545-013-9589-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A treatable new cause of chorea: beta-ketothiolase deficiency.2013

    • Author(s)
      Buhaş D, Bernard G, Fukao T, Décarie JC, Chouinard S, Mitchell GA
    • Journal Title

      Mov Disord.

      Volume: 28 Pages: 1054-1056

    • DOI

      10.1002/mds.25538.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of MLPA for human ACAT1 gene and identification of a heterozygous Alu-mediated deletion of exons 3 and 4 in a patient with mitochondrial acetoacetyl-CoA thiolase (T2) deficiency.2013

    • Author(s)
      Fukao T, Aoyama Y, Murase K, Hori T, Harijan RK, Wierenga RK, Boneh A, Kondo N.
    • Journal Title

      Mol Genet Metab.

      Volume: 110 Pages: 184-187

    • DOI

      10.1016/j.ymgme.2013.07.004.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] (Educational lecture) Inborn errors of ketogenesis and ketone body utilization2013

    • Author(s)
      Fukao T
    • Organizer
      The 55th Annual meeting of the Japanese Society for Inherited Metabolic Diseases
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20131127-20131129
  • [Presentation] The first case of HSD10 disease (2-Methyl-3-Hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase deficiency) from Asia2013

    • Author(s)
      Fukao T, Akiba K, Goto M, Kuwayama N, Morita M, Hori T, Aoyama Y, Venkatesan R, Wierenga R, Hasegawa Y, Shigematsu Y, Ohtake A, Moriyama Y, Usuda N, Hasegawa Y
    • Organizer
      The 3rd Asian Congress for Inherited Metabolic Diseases / The 55th Annual meeting of the Japanese Society for Inherited Metabolic Diseases
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      20131127-20131129
  • [Presentation] 日本初のHSD10病(2-methyl-3-hydroxybutryl-CoA 脱水素酵素欠損症)の報告2013

    • Author(s)
      深尾敏幸, 秋葉和壽, 桑山信希, 森田実喜子, 青山友佳、後藤正博, Venkatesan Rajaran, Rikkert Wierenga、臼田信光、森山陽介、重松陽介、長谷川有紀、大竹明、村山圭、堀友博、長谷川行洋
    • Organizer
      第58回日本人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20131120-20131123
  • [Presentation] ケトン体代謝異常症と急性脳症2013

    • Author(s)
      深尾敏幸
    • Organizer
      第18回日本神経感染症学会
    • Place of Presentation
      宮崎
    • Year and Date
      20131011-20131012
    • Invited
  • [Presentation] Ketone body metabolism and its defects. Update.2013

    • Author(s)
      Fukao T.
    • Organizer
      12th International Congress of Inborn Errors of Metabolism
    • Place of Presentation
      Barcelona
    • Year and Date
      20130903-20130906
    • Invited
  • [Presentation] HMG-CoAリアーゼ欠損症のMPLA法の確立と1症例におけるエクソン2-4を含む欠失の同定2013

    • Author(s)
      青山 友佳, 石毛 美夏,田中 藤樹,深尾 敏幸
    • Organizer
      第40回日本マススクリーニング学会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20130823-20130824
  • [Book] タンデムマス・スクリーニングガイドブック2013

    • Author(s)
      深尾敏幸
    • Total Pages
      152ページ中20ページ担当
    • Publisher
      診断と治療社

URL: 

Published: 2015-05-28  

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