2014 Fiscal Year Annual Research Report
口腔癌のマッピングアレイを用いた再発・転移関連遺伝子の解明
Project/Area Number |
24593009
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Research Institution | Kanagawa Dental College |
Principal Investigator |
山本 信治 神奈川歯科大学, 歯学研究科(研究院), 准教授 (60385185)
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Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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Keywords | 口腔がん / DNAマッピングアレイ / ヘテロ接合性消失(LOH) |
Outline of Annual Research Achievements |
発がんの検索は、ゲノムコピー数の異常(CAN)やヘテロ接合性消失(LOH)など細胞が自ら抑制不能となり、無秩序に成長する原因である遺伝子変化を検出することから始まった。多くのがんの場合、このような変化はがん化を促進するがん遺伝子の活性化もしくは、がん抑制遺伝子の不活化によって起こる。我々は、これまでに口腔扁平上皮癌の発生過程について第2番、3番、21番染色体上の欠失状況をLOH法を用いてアレル不均衡の解析を行ってきた。その結果、OSCC患者から2qで2か所、3pで3か所、21qで4か所に共通欠失領域の同定を明らかにし、これらの染色体座位には口腔がんの発生に関与している未知がん抑制遺伝子が存在していることを明らかにした。最近、大規模な一塩基多形(SNP)タイピング用に高密度オリゴヌクレオチド(GeneChip;Mapping 10K Array)が開発され、がん細胞ゲノムに生じる様々な変化を全染色体上で網羅的に解析することが可能になった。個々の人間の遺伝子配列は99.9%まで同一で、残り0.1%が異なる。この違いは、一塩基多型(SNP)とよばれ、DNA塩基配列が一塩基だけ置換されている変異に由来するものであり、発がんに関連する遺伝的変異または遺伝的差異のパターンを明確にするのに有効な情報である。ヒトゲノムには1,000万か所のSNPが含まれると推定されている。これは、300塩基ごとに1か所存在する割合になる。Mapping 10K ArrayにおけるSNPプローブの平均間隔は210 kbごとであり、10,204個のSNPが測定可能で、従来のCGHに比べ、極めて高い解像度と分解能で染色体コピー数の変化を検出することが可能である。全ゲノム上のCANとLOHを検索した結果、1q31.1領域に3か所(D1S1189、D1S2151、D1S2595)の候補遺伝子座位を同定した。
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Research Products
(17 results)
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[Journal Article] A case of lower gingival carcinoma with drug-induced interstitial pneumonia caused after chemotherapy with peplomycin2015
Author(s)
Yamamoto N., Fuse Y., Yoshida Y., Suzuki T., Noguchi S., Katakura A., Tanaka Y., Shibahara T., Takano N.
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Journal Title
Journal of Oral and Maxillofacial Surgery, Medicine, and Pathology
Volume: 27
Pages: 92-95
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Clinicopathological study of tumor depth in tongue squamous cell carcinoma2014
Author(s)
Yamamoto N., Osaka R., Ogane S., Sugahara K., Yamamoto M., Muramatsu K., Watanabe A., Narita M., Yakushiji T., Nomura T., Yamauchi T., Takano N., Shibahara T., Saito T., Yoshida K., Sato K., Katakura A., Matsuzaka K.
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Journal Title
Journal of Oral and Maxillofacial Surgery, Medicine, and Pathology
Volume: 26
Pages: 118-121
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Clinical application of full-scale-model made by 3-dimensional ink jet printer for orthognathic surgery2014
Author(s)
Katsumi, Y., Sugahara, K., Hamada, Y., Yamamoto, N., Fujiwara, W., Tojo, K., Takano, M., Shibahara, T., Matsunaga, S., Yoshinari, M.
Organizer
5th Triennial International ADT Congress
Place of Presentation
北京(中国)
Year and Date
2014-09-07 – 2014-09-07
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[Presentation] Usefulness of 3DHD movie for surgical practices and medical education in OMFS2014
Author(s)
Sugahara, K., Takano, M., Kasahara, K., Yamamoto, N., Saito, C., Shibahara, T.
Organizer
5th Triennial International ADT Congress
Place of Presentation
北京(中国)
Year and Date
2014-09-07 – 2014-09-07
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[Presentation] Molecular epidemiological study of oral cancer in Tokyo Dental College2014
Author(s)
Yamamoto, N., Sugahara, K., Onda, T., Nomura, T., Takano, M., Shibahara, T.
Organizer
第11回アジア口腔顎顔面外科学会
Place of Presentation
西安(中国)
Year and Date
2014-08-23 – 2014-08-23
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[Presentation] Detection of surgical margin using fluorescence visualization as a useful tool for oral squamous cell carcinoma2014
Author(s)
Nomura, T., Morikawa, T., Bessho, H., Yamamoto, N., Takano, N., Shibahara, T.
Organizer
第11回アジア口腔顎顔面外科学会
Place of Presentation
西安(中国)
Year and Date
2014-08-23 – 2014-08-23
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