2013 Fiscal Year Research-status Report
機能株群集成長解析を活用した植物有害物質膜輸送体の包括的機能ゲノム解析
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24651213
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
中西 洋一 名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (60362290)
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| Keywords | 植物 / ゲノム / 有害化学物質 / 膜輸送 |
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| Research Abstract |
多くの生物のゲノムには、コンピュータで予想したタンパク質の構造的特徴から膜輸送体をコードすると示唆される遺伝子が千を超えて存在する。しかし、分子機能との対応が明らかにされていないものも多く、解明が待たれている。本研究では、モデル植物シロイヌナズナの膜輸送体候補遺伝子群について、「機能株群集成長解析」という新たな手法を活用して、重金属、薬物、植物由来天然物といった有害物質の膜輸送と包括的に関連づけことを目的としている。
本年度は、前年度作製したシロイヌナズナ膜輸送体1350種類の酵母遺伝子発現ライブラリとモデル有害物質をもちいた実験結果をもとに、機能株群集成長解析の手法に関するモデル化を進めた。また、宿主の生育に中立的な物質を輸送する膜輸送体についても機能株群集成長解析を適用するために、新たにな酵母順逆両選抜システムを開発した。関連の研究成果も合わせ、学会発表４回を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
２５年度には植物膜輸送体を発現させた酵母ライブラリの生育に有害物質が与える影響を評価し、成果発表する予定であった。しかし、２４年度において、一部の植物膜輸送体遺伝子の取り扱いが予想以上に困難であったことから、酵母ライブラリの作出に手間取り、全体的に計画が１年程度遅延している。本年度は、本来前年度に行う予定であったモデル有害物質を用いたモデル化試験を行った。
また、研究の過程であらたに植物細胞にとって中立的な物質の膜輸送に関しても機能株群集成長解析を適用する着想が得られたため、研究実施内容を修正した。結果として本来計画の遅れの一因となったが、本研究の一般性を広げる上で有益な研究成果が得られたと考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成２６年度においては、本来２５年度計画にあるモデル有害物質以外の化学物質による酵母ライブラリの群生育試験と、その統計解析、データベース化、論文・学会発表を次年度に行う。また、２５年度に開発した酵母逆選抜システムをもちいて、中立的な物質についても追加の機能株群集成長解析をおこない、研究成果がより一般的であることを明らかにする。
これらの目的で、研究費未使用額を繰り越したので、当初予定の実験を実施したり、成果発表をおこない、その経費に充てることとしたい。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
２５年度に、植物膜輸送体を発現させた酵母ライブラリの生育に有害物質が与える影響を評価し、成果発表する予定であった。しかし、２４年度において、一部の植物膜輸送体遺伝子の取り扱いが予想以上に困難であったことから、酵母ライブラリの作出に手間取り、全体的に計画が１年程度遅延している。実験系のモデル試験（２５年度）、有害物質群の評価（２６年度）と計画を順次後倒ししたため、未使用額が生じた。
このため、モデル有害物質以外の化学物質による酵母ライブラリの群生育試験と、その統計解析、データベース化、論文・学会発表を次年度に行うこととし、未使用額をその経費に充てることとしたい。当初予定の実験のための消耗品費、成果発表のための旅費、謝金、その他に用いる。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Thioredoxin-h regulates calcium-signaling proteins in plasma membranes2013
Author(s)
Ueoka-Nakanishi, H., Sazuka, T., Nakanishi, Y., Mori, H., Maeshima, M., and Hisabori, T.
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Journal Title
FEBS Journal
Volume: 280
Pages: 3220-3231
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Local distribution of membrane proteins on vacuoles isolated from Arabidopsis suspension-cultured cells2013
Author(s)
Yoshida, K., Ohnishi, M., Fukao, Y., Okazaki, Y., Song, C., Hayashi, F., Fujiwara, M., Nakanishi, Y., Saito, K., Shimmen, T., Suzaki, T., Fukaki, H., Maeshima, M., and Mimura, T.
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Journal Title
Plant and Cell Physiology
Volume: 54
Pages: 1571-1584
DOI
Peer Reviewed
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