2012 Fiscal Year Research-status Report
革新的両方向性遺伝学的アプローチによる重度小頭症の病態解明
| Project/Area Number |
24651222
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
|
| Research Institution | Hiroshima University |
|---|
Principal Investigator |
松浦 伸也 広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (90274133)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
宮本 達雄 広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 助教 (40452627)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
|
| Keywords | エクソーム解析 |
|---|
| Research Abstract |
遺伝性小頭症は、遺伝的異質性が特段に高いことが知られており、これまでに原因遺伝子として、NBS1、Rad50、Ligase4、ATR、MCPH1、ORC1、PCNT、ASPM、CENPJ、CDK5RAP2、STIL、CEP152、CEP63などが同定された。これらの研究から、遺伝性小頭症の患者は、出生前からのゲノム安定性機構の破綻により、器官形成期で神経幹細胞が十分増殖できず、そのために脳サイズが小さくなることが考えられた。私たちは最近、日本人10家系11例のサンプルを収集して、DNA修復経路上から原因遺伝子を探索し、２家系にDNA二重鎖切断修復遺伝子Mre11Aに変異を、２家系に中心体構成因子PCNT遺伝子に変異を同定した。いずれの患者細胞もDNA損傷後のアポトーシスが亢進しており、神経幹細胞の増殖不良にアポトーシスの関与が示唆された。一方、残り６家系にはDNA修復経路上の小頭症関連遺伝子に変異を認めず、新規の原因遺伝子が予想された。本研究では、日本人遺伝性小頭症の６家系について、次世代シーケンサーを用いた全エクソーム解析で原因遺伝子を同定して、病因と病態を解明することを目的としている。
これまでに日本人遺伝性小頭症４家系について、次世代シーケンサーを用いた全エクソーム解析を行った。具体的には、Nimblegen社のExon captureを用いて、ゲノムDNAのエクソン配列に相当するDNA断片を濃縮し、Hiseq2000で塩基配列を決定した。現在、dbSNPを用いて候補SNPの絞り込みを行っている。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画案に沿って研究が順調に進行中である。
|
| Strategy for Future Research Activity |
遺伝性小頭症６家系の原因遺伝子探索を継続する。それと同時に、人工ヌクレアーゼを用いたゲノム編集技術の開発を進める。これにより、遺伝性疾患の細胞モデルならびにマウスモデルを速やかに作成することが可能となる。
|
| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
平成24年度未使用分を使用して残り２家系の次世代シーケンサによる解析を進める。また、平成25年度予算で高活性のTALEヌクレアーゼを作成して、高効率の遺伝子標的法を開発する。
|
-
-
-
-
[Presentation] Kinetics of radiation-induced DNA double strand break rejoining in DNA repair deficient cells2013
Author(s)
Ohara, M., Sakamoto, Y., Fukasaku, J., Komatsu, K., Matsuura, S., Tauchi, H.
Organizer
The 3rd international symposium of RIRBM, Hiroshima University
Place of Presentation
広島
Year and Date
20130212-20130213
-
[Presentation] Artificial nuclease-based targeted DSB introduction and its application2013
Author(s)
Ochiai, H., Miyamoto, T., Kanai, A., Hosoba, K., Sakuma, T., Yamamoto, T., Matsuura, S.
Organizer
The 3rd international symposium of RIRBM, Hiroshima University
Place of Presentation
広島
Year and Date
20130212-20130213
-
-
-
[Presentation] Establishment of human disease model cell lines by introduction of intergenic single nucleotide mutation using artificial nucleases2012
Author(s)
Ochiai, H., Miyamoto, T., Kanai, A., Hosoba, K., Sakuma, T., Noji, S., Yamamoto, T., Matsuura, S.
Organizer
第35回日本分子生物学会年会
Place of Presentation
福岡
Year and Date
20121211-20121214
Invited
-
-
[Presentation] Role of MRE11/RAD50/NBS1 complex in regulation of ATM activation2012
Author(s)
Kobayashi, J., Fujimoto, H., Okui, M., Kato, T., Matsuura, S., Komatsu, K.
Organizer
第35回日本分子生物学会年会
Place of Presentation
福岡
Year and Date
20121211-20121214
-
-
-
-
-
