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2013 Fiscal Year Annual Research Report

光でナトリウムをポンプする新型ロドプシンの機能解明

Research Project

Project/Area Number 24655009
Research InstitutionNagoya Institute of Technology

Principal Investigator

井上 圭一  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (90467001)

Keywordsロドプシン / ナトリウムポンプ / 赤外分光
Research Abstract

本年度は我々が海洋性細菌より発見した光駆動型ナトリウムポンプロドプシン、KR2について、さらに詳細な機能解析と分光学的手法を用いた構造研究を行った。その結果これまでナトリウムイオン(Na+)より大きなカチオンは輸送されないと考えられてきたが、様々にpHを変えた活性測定により、KCl溶液中では弱いながらカリウムイオン(K+)の輸送が行われている事が明らかとなった。またこの際にはK+と同時に高い水素イオン(H+)の輸送が見られ、K+とH+は競合的に輸送が行われている事が示された。
また構造研究については低温フーリエ変換赤外分光法(FTIR)により、Na+輸送時とH+輸送時における光反応中間体について研究を行った。今回対象とした中間体は、光反応によってレチナールの異性化後に現れるK中間体についてである。そしてNa+輸送時とH+輸送時では、過去にフラッシュフォトリシスの研究から、光反応サイクルに大きな違いが見られた事から、初期中間体においてもロドプシンの構造に違いがあることを期待しFTIRによる構造解析を行った。そうしたところ予想に反し、Na+輸送時とH+輸送時におけるK中間体生成に伴う赤外吸収スペクトルの変化はほぼ同一であり、光反応に伴う初期中間体の構造変化は同一であることが明らかとなった。この結果は光反応直後においてKR2は輸送するカチオンに依存しない、共通の構造変化を起こし、その後の反応過程においてカチオンの選択がなされ得ることを示唆している。
本結果はこれらの結果についてJ. Phys. Chem. B誌へ論文発表を行い、さらに招待講演(7件)を含む33件の学会発表で本研究において得られた成果を発表した。

  • Research Products

    (38 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (33 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Molecular and evolutionary aspects of microbial sensory rhodopsins2014

    • Author(s)
      Keiichi Inoue, Takashi Tsukamoto, Yuki Sudo
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      Volume: 87 Pages: 2587-2597

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2013.05.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chimeric Proton-Pumping Rhodopsins Containing the Cytoplasmic Loop of Bovine Rhodopsin2014

    • Author(s)
      Kengo Sasaki, Takahiro Yamashita, Kazuho Yoshida, Keiichi Inoue, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 9, issue 3 Pages: 91323

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0091323

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FTIR Spectroscopy of a Light-Driven Compatible Sodium Ion-Proton Pumping Rhodopsin at 77 K2014

    • Author(s)
      Hikaru Ono, Keiichi Inoue, Rei Abe-Yoshizumi, Hideki Kandori
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry B

      Volume: in press Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Thermal and spectroscopic characterization of a proton pumping rhodopsin from an extreme thermophile2013

    • Author(s)
      Takashi Tsukamoto, Keiichi Inoue, Hideki Kandori, Yuki Sudo
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 288 Pages: 21581-21592

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.479394.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Functional conversion of archaerhodopsin-3 from light-driven proton pump to light-gated channel2014

    • Author(s)
      井上圭一、下野和実、鈴木悠斗、谷ヶ崎仁、宮内正二、林重彦、神取秀樹、須藤雄気
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会(2014)
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20140330-20140330
  • [Presentation] 光駆動ナトリウムポンプの機能と光反応の研究2014

    • Author(s)
      加藤善隆、井上圭一、大野光、吉住玲、神取秀樹
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会(2014)
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20140328-20140328
  • [Presentation] 光のエネルギーでナトリウムイオンを運ぶ:光駆動ナトリウムポンプ型ロドプシンの機能とメカニズム2014

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      遺伝研研究会2014「単細胞システムの細胞構築・運動・増殖機構の研究」
    • Place of Presentation
      三島
    • Year and Date
      20140325-20140325
    • Invited
  • [Presentation] ナトリウムポンプ型ロドプシンの細胞内機能と分光で迫る分子メカニズム2014

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      日本分光学会平成25年度生細胞分光部会シンポジウム
    • Place of Presentation
      松山
    • Year and Date
      2014-03-07
  • [Presentation] 海洋性細菌から発見された光駆動ナトリウムポンプ型ロドプシン2013

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第39回討論会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      20131219-20131219
    • Invited
  • [Presentation] 光駆動ナトリウムポンプの機能および光反応の解析2013

    • Author(s)
      加藤善隆、井上圭一、大野光、吉住玲、神取秀樹
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第39回討論会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      20131219-20131219
  • [Presentation] 光駆動型ナトリウムポンプの低温赤外分光測定による構造解析2013

    • Author(s)
      大野光、井上圭一、吉住玲、加藤善隆、神取秀樹
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第39回討論会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      20131219-20131219
  • [Presentation] ナノディスクを用いたHaloarcula vallismortisセンサリーロドプシンIの光反応ダイナミクスの研究2013

    • Author(s)
      川本健一、井上圭一、佐々木 純、谷ヶ崎 仁、本間道夫、須藤雄気、神取秀樹
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第39回討論会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      20131219-20131219
  • [Presentation] The Chimeric Protein between Bovine Rhodopsin and Microbial Rhodopsin which is Activatable Transducin (Gt)2013

    • Author(s)
      Keiichi Inoue, Kengo Sasaki, Aya Nakatsuma, Takahiro Yamashita, Kazuho Yoshida, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori
    • Organizer
      GPCR Workshop 2013
    • Place of Presentation
      Maui, Hawaii, USA
    • Year and Date
      20131201-20131205
  • [Presentation] The optical control of G-protein activity by chimeric proteins of microbial rhodopsins and GPCRs2013

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida, Keiichi Inoue, Takahiro Yamashita, Rei Abe-Yoshizumi, Kengo Sasaki, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori
    • Organizer
      GPCR Workshop 2013
    • Place of Presentation
      Maui, Hawaii, USA
    • Year and Date
      20131201-20131205
  • [Presentation] GsおよびGqの光制御に向けた新規キメラタンパク質のデザイン2013

    • Author(s)
      吉田一帆、井上圭一、山下高廣、吉住玲、佐々木賢吾、七田芳則、神取秀樹
    • Organizer
      分子研研究会「ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20131118-20131118
  • [Presentation] Study of Anabaena Sensory Rhodopsin Mutant P206D That Contains the 13-cis Form Dominantly2013

    • Author(s)
      Yoshitaka Kato, Akira Kawanabe, Keiichi Inoue, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131030-20131030
  • [Presentation] Photoreaction Dynamics of Sensory Rhodopsin I in Nanodiscs2013

    • Author(s)
      Kenichi Kawamoto, Keiichi Inoue, Jun Sasaki, Jin Yagasaki, Yuki Sudo, Michio Homma, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131029-20131029
  • [Presentation] Role of N- and C-terminus in a Light-Driven Sodium Ion Pump2013

    • Author(s)
      Shinya Sugita, Yoshitaka Kato, Rei Abe-Yoshizumi, Jun Sasaki, Keiichi Inoue, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131029-20131029
  • [Presentation] Designs of New Chimeric Proteins for Optical Activation of Gs- and Gq-proteins2013

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida, Keiichi Inoue, Takahiro Yamashita, Rei Abe-Yoshizumi, Kengo Sasaki, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131029-20131029
  • [Presentation] Laser Flash Photolysis study on Photochemistry of Rhodopsin Mimics2013

    • Author(s)
      Keiichi Inoue, Yuuya Ozaki, James H. Geiger, Babak Borhan, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131028-20131028
  • [Presentation] Light-induced Inward Proton Transport in a Blue-shifted Archaerhodopsin-3 Mutant2013

    • Author(s)
      Keiichi Inoue, Takashi Tsukamoto, Jin Yagasaki, Kazumi Shimono, Seiji Miyauchi, Shigehiko Hayashi, Hideki Kandori, Yuki Sudo
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131028-20131028
  • [Presentation] Low-temperature FTIR Spectroscopy of a Light-driven Sodium Ion Pump2013

    • Author(s)
      Hikaru Ono, Keiichi Inoue, Rei Abe-Yoshizumi, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20131028-20131028
  • [Presentation] Mechanism of light-driven sodium ion pump2013

    • Author(s)
      Hikaru Ono, Keiichi Inoue, Rei Abe-Yoshizumi, Hideki Kandori
    • Organizer
      IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20130902-20130902
  • [Presentation] Differences of Photo Reaction Dynamics of Sensory Rhodopsin I in Acidic- and Alkaline forms2013

    • Author(s)
      Kenichi Kawamoto, Keiichi Inoue, Jin Yagasaki, Yuki Sudo, Michio Homma, Hideki Kandori
    • Organizer
      IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20130902-20130902
  • [Presentation] 分光学者と微生物型ロドプシン:分子の基礎研究と応用への路2013

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      第45回分子病態医学セミナー
    • Place of Presentation
      東温
    • Year and Date
      20130710-20130710
    • Invited
  • [Presentation] ナトリウムポンプ型ロドプシン(NaR)のイオン輸送ダイナミクス研究2013

    • Author(s)
      井上圭一、大野光、吉住玲、吉澤晋、木暮一啓、神取秀樹
    • Organizer
      第40回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20130607-20130607
  • [Presentation] 微生物型ロドプシンを用いた光駆動性Gs及びGq活性型キメラタンパク質の構築2013

    • Author(s)
      吉田一帆、山下高廣、佐々木賢吾、吉住玲、井上圭一、七田芳則、神取秀樹
    • Organizer
      第40回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20130607-20130607
  • [Presentation] Differences of Photo Reactions of Haloarcula vallismortis Sensory Rhodopsin I in Acidic- and Alkaline forms2013

    • Author(s)
      Kenichi Kawamoto, Keiichi Inoue, Jin Yagasaki, Yuki Sudo, Michio Homma, Hideki Kandori
    • Organizer
      IMS Workshop on "Hierarchical Molecular Dynamics: From Ultrafast Spectroscopy to Single Molecule Measurements"
    • Place of Presentation
      Okazaki
    • Year and Date
      20130525-20130525
  • [Presentation] Design of new chimeric proteins for optical activation of G proteins2013

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida, Takahiro Yamashita, Kengo Sasaki, Rei Abe-Yoshizumi, Keiichi Inoue, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori
    • Organizer
      IMS Workshop on "Hierarchical Molecular Dynamics: From Ultrafast Spectroscopy to Single Molecule Measurements"
    • Place of Presentation
      Okazaki
    • Year and Date
      20130525-20130525
  • [Presentation] Time-resolved FTIR study of a light-driven sodium pump rhodopsin2013

    • Author(s)
      Hui-Fen Chen, Keiichi Inoue, Hideki Kandori
    • Organizer
      The XVIth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy (TRVS 2013)
    • Place of Presentation
      Beppu
    • Year and Date
      20130520-20130521
  • [Presentation] 新たなロドプシンが切り拓く、光操作の新地平2013

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      名古屋工業大学オプトバイオテクノロジー研究センター設立シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2013-12-26
  • [Presentation] 海洋性の細菌から見つかった光駆動型ナトリウムポンプ2013

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      大阪市立大学セミナー
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2013-12-18
  • [Presentation] 光駆動ナトリウムポンプの発見と展開2013

    • Author(s)
      井上圭一
    • Organizer
      分子研研究会「ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2013-11-18
  • [Presentation] 光駆動型ナトリウムポンプの低温赤外分光測定2013

    • Author(s)
      大野光、井上圭一、吉住玲、神取秀樹
    • Organizer
      分子研研究会「ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2013-11-18
  • [Presentation] ナノディスクを用いたセンサリーロドプシンIの光反応ダイナミクスの研究2013

    • Author(s)
      川本健一、井上圭一、佐々木純、谷ヶ崎仁、本間道夫、須藤雄気、神取秀樹
    • Organizer
      分子研研究会「ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る」
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2013-11-18
  • [Presentation] 青色受容型アーキロドプシン3変異体のイオン輸送特性と光化学反応2013

    • Author(s)
      井上圭一、谷ヶ崎仁、下野和実、宮内正二、林重彦、神取秀樹、須藤雄気
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2013-09-27
  • [Presentation] 青色光受容型プロトンポンプによる神経活動抑制2013

    • Author(s)
      須藤雄気、岡崎史子、大野光、谷ヶ崎仁、須郷聖也、神谷基司、Louisa Reissig、井上圭一、井原邦夫、神取秀樹、高木新、林重彦
    • Organizer
      第40回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2013-06-08
  • [Remarks] 国立大学法人 名古屋工業大学 研究者データベースシステム

    • URL

      http://researcher.nitech.ac.jp/html/14_ja.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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