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2013 Fiscal Year Annual Research Report

多糖合成酵素に関する新しい分子反応機構の構築と応用研究

Research Project

Project/Area Number 24658089
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

木村 淳夫  北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (90186312)

Keywords多糖 / ドメイン / 合成
Research Abstract

多糖の合成酵素が示す反応を「転移作用(初発反応)と伸長作用」に分け、1)分子解析を行い、かつ、2)合成される多糖の構造をコントロールするが目的である。合成酵素を研究する世界中の科学者は、触媒反応に「伸長」を加える理論を持っていない現状がある。 我々は、オリゴ糖から多糖を合成する酵素(多糖合成酵素)のドメイン削除体を構築した。削除体はnative酵素と同一の転移能を示したが、伸長反応が大巾に低下した。さらに中型のオリゴ糖を合成する新規酵素(中型オリゴ糖合成酵素)のアミノ酸置換体に長鎖生成物を産する現象を見出した。この2つの事例は、合成反応を転移と伸長に区別でき、別個の構造因子により両作用の制御が可能であることを示唆する。両酵素を実験対象に、反応の分子機構究明と分子サイズ(物性)の異なる多糖の構築・提供を行う。
(1)酵素結晶化による立体構造解析:昨年度から立体構造解析を意図した酵素結晶の調製を行ってきた。中型オリゴ糖合成酵素は幸運にもX線構造解析が可能な結晶が得られたが、多糖合成酵素の場合は困難であった。従って、前者は当該構造を用いて以下の解析を行い、多糖合成酵素は相同酵素を用いることにした。
(2)中型オリゴ糖合成酵素の分子解析:活性部位付近のループに変異を導入したところ、オリゴ糖合成に変化が生じた。従って、当該構造因子が本酵素の中型オリゴ糖合成に重要であることが示された。さらに長鎖オリゴ糖の生成を制御できるアミノ酸を見出した。
(3)多糖合成酵素を用いた削除体実験:昨年度、N末端削除は活性を低下させることを見出したので、C末端の削除体に着目し実験を進めた。得られたC末端削除体は「長鎖生成物を生産する現象」を示した。さらなる解析から構造因子が活性ドメインの近傍に存在している可能性を得た。

  • Research Products

    (12 results)

All 2014 2013

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] 糖質酵素の分子機構に関する研究.2014

    • Author(s)
      木村淳夫
    • Journal Title

      応用糖質科学

      Volume: 4 Pages: 3-16

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Key aromatic residue, possibly presenting at subsite +2 and +3, of glycoside hydrolase family 31 α-glucosidase regulates recognition on long-chain substrates.2013

    • Author(s)
      Tagami T, Okuyama M, Nakai H, Kim YM, Mori H, Taguchi K, Svensson B, Kimura A
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta

      Volume: 1834 Pages: 329-335

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2012.08.007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel mechanism for promotion of quercetin glycoside absorption by megalo α-1,6-glucosaccharide in the rat small intestine.2013

    • Author(s)
      Shinoki A, Lang W, Thawornkuno C, Kang HK, Kumagai Y, Okuyama M, Mori H, Kimura A, Ishizuka S, Hara H
    • Journal Title

      Food Chem

      Volume: 136 Pages: 293-296

    • DOI

      10.1016/j.foodchem.2012.08.028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular basis for the recognition of long-chain substrates by plant α-glucosidase.2013

    • Author(s)
      Tagami T, Yamashita K, Okuyama M, Mori H, Yao M, Kimura A
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 288 Pages: 19296-19303

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.465211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analyses of cycloisomaltooligosaccharide glucanotransferase from Bacillus circulans T-3040.2013

    • Author(s)
      Suzuki N, Kim YM, Momma M, Fujimoto Z, Kobayashi M, Kimura A, Funane K
    • Journal Title

      Acta Crystallogr F

      Volume: 69 Pages: 946-949

    • DOI

      10.1107/S174430911301991X

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Gluconobacter oxydans由来dextran dextrinaseの直鎖イソマルトメガロ糖の効率的な合成に関わる領域の解析2014

    • Author(s)
      熊谷祐也, Lang Weeranuch, 貞廣樹里, 奥山正幸, 森春英, 木村淳夫
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学(川崎市多摩区)
    • Year and Date
      20140327-20140330
  • [Presentation] 糖質酵素の分子機構に関する研究:新規な糖質機能の発見と応用2014

    • Author(s)
      木村淳夫
    • Organizer
      平成25年度日本応用糖質科学会北海道支部シンポジウム(招待講演)
    • Place of Presentation
      北農ビル(札幌市中央区)
    • Year and Date
      20140203-20140203
    • Invited
  • [Presentation] 糖質酵素の分子機構に関する研究2013

    • Author(s)
      木村淳夫
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部講演会(招待講演)
    • Place of Presentation
      北海道大学農学部(札幌市北区)
    • Year and Date
      20131129-20131130
    • Invited
  • [Presentation] Gluconobacter oxydansが産生する2つのデキストラン合成酵素の同一性に関する解析2013

    • Author(s)
      貞廣樹里,森春英,佐分利亘,奥山正幸,木村淳夫
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学農学部(札幌市北区)
    • Year and Date
      20131129-20131130
  • [Presentation] Gluconobacter oxydans由来dextran dextrinaseの直鎖イソマルトメガロ糖の合成に関わる領域2013

    • Author(s)
      熊谷祐也, Weeranuch Lang, 貞廣樹里, 奥山正幸, 森春英, 木村淳夫
    • Organizer
      日本農芸化学会北海道支部講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学農学部(札幌市北区)
    • Year and Date
      20131129-20131130
  • [Presentation] Gluconobacter oxydans由来dextran dextrinaseによる直鎖イソマルトメガロ糖の酵素合成2013

    • Author(s)
      熊谷祐也,Weeranuch Lang,貞廣樹里,奥山正幸,森春英,木村淳夫
    • Organizer
      応用糖質科学会平成25年度大会(ポスター賞受賞)
    • Place of Presentation
      鹿児島大学農学部(鹿児島市)
    • Year and Date
      20130925-20130927
  • [Presentation] 糖質酵素の分子機構に関する研究2013

    • Author(s)
      木村淳夫
    • Organizer
      応用糖質科学会平成25年度大会(学会賞受賞・招待講演)
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島市)
    • Year and Date
      20130925-20130927
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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