アメーバ共生細菌プロトクラミジアアンキリンエフェクターの機能解析

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 24659194
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 山口 博之 北海道大学, 大学院保健科学研究院, 教授 (40221650)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中村 眞二 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40207882) ; 松尾 淳司 北海道大学, 大学院保健科学研究院, 助教 (50359486)
• Keywords: 微生物間共生 / 原始クラミジア / エフェクター

Research Abstract

以下の2点についてこれ迄に明らかにした。
1. 札幌の河川水より分離・株化したアメーバに共生する偏性細胞内寄生性細菌Protochlamydia R18株のドラフトゲノムを決定し、比較ゲノム解析より蛋白蛋白相互作用に深く関わるアンキリン(Ank)モチーフやロイシンリッチリピート(LRR)を持つ分子をコードする計38つの遺伝子を同定した。
2. 同定したAnkやLRRを持つ分子をコードする共生細菌の遺伝子がアメーバ内で実際に発現していることをRT-PCRにて確認した。現在、Protochlamydia R18ドラフトゲノム情報を基にカスタマイズしたDNAマイクロアレイを用いてアメーバ内での共生細菌の遺伝子発現変化の網羅的な解析を進めている。