New anti-HIV/SIV cellular-factors counteracted by Vpx: their search and identification

2013 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 24659208
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Virology
• Research Institution: The University of Tokushima
• Principal Investigator: ADACHI Akio 徳島大学, 大学院ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (90127043)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): NOMAGUCHI Masako 徳島大学, 大学院ヘルスバイオサイエンス研究部, 准教授 (80452647) ; MIYAZAKI Yasuyuki 徳島大学, 大学院ヘルスバイオサイエンス研究部, 助教 (70607233) ; MIYAKE Ariko 徳島大学, 大学院ヘルスバイオサイエンス研究部, 助教 (20548622)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2014-03-31
• Keywords: ウイルス / HIV / Vpx / 拮抗因子 / 細胞因子 / 蛋白質翻訳

Research Abstract

On the basis of our previous results on molecular genetic analyses of HIV-2 in various myeloid and lymphoid cell lines, we newly developed systems to search and identify new cellular factors that are counteracted by Vpx, other than SAMHD1. We have obtained important virological results to show this concept: genetic and biochemical evidences demonstrating that Vpx is required for efficient virus replication in actively proliferating lymphocytes without SAMHD1 expression. Furthermore, in this study, we have identified the PPM (Poly-Proline Motif) sequence in Vpx that is critical for efficient translation of Vpx.

Research Products

• [Journal Article] Natural single-nucleotide polymorphisms in the 3'region of HIV-1 pol gene modulate viral replication ability (2014)
  • Author(s): Nomaguchi, M., Miyake, A., Doi, N., Fujiwara, S., Miyazaki, Y., Tsunetsugu-Yokota, Y., Yokoyama, M., Sato, H., Masuda, T., and Adachi, A.
  • Journal Title: Journal of Virology Volume: 88 Pages: 4145-4160
  • DOI: 10.1128/JVI.01859-13
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Role of poly-proline motif in HIV-2 Vpx expression (2014)
  • Author(s): Miyake, A., Miyazaki, Y., Fujita, M., Nomaguchi, M., and Adachi, A.
  • Journal Title: Frontiers in Microbiology Volume: 5 Pages: 24
  • DOI: 10.3389/fmicb.2014.00024
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Poly-proline motif in HIV-2 Vpx is critical for its efficient translation (2014)
  • Author(s): Miyake, A., Fujita, M., Fujino, H., Koga, R., Kawamura, S., Otsuka, M., Ode, H., Iwatani, Y., Sakai, Y., Doi, N., Nomaguchi, M., Adachi, A., and Miyazaki, Y.
  • Journal Title: Journal of General Virology Volume: 95 Pages: 179-189
  • DOI: 10.1099/vir.0.057364-0
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Generation of rhesus macaque-tropic HIV-1 clones that are resistant to major anti-HIV-1 restriction factors (2013)
  • Author(s): Nomaguchi, M., Yokoyama, M., Kono, K., Nakayama, E.E., Shioda, T., Doi, N., Fujiwara, S., Saito, A., Akari, H., Miyakawa, K., Ryo, A., Ode, H., Iwatani, Y., Miura, T., Igarashi, T., Sato, H., and Adachi, A.
  • Journal Title: Journal of Virology Volume: 87 Pages: 11447-11461
  • DOI: 10.1128/JVI.01549-13
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Growth potentials of CCR5-tropic HIV-1mt clones in macaque cells (2013)
  • Author(s): Doi, N., Okubo, A., Yamane, M., Sakai, Y., Adachi, A., and Nomaguchi, M.
  • Journal Title: Frontiers in Microbiology Volume: 4 Pages: 218
  • DOI: 10.3389/fmicb.2013.00218
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] TRIM5 genotypes in cynomolgus monkeys primarily influence inter-individual diversity in susceptibility to monkey-tropic human immunodeficiency virus type 1 (2013)
  • Author(s): Saito, A., Nomaguchi, M., Kono, K., Iwatani, Y., Yokoyama, M., Yasutomi, Y., Sato, H., Shioda, T., Sugiura, W., Matano, T., Adachi, A., Nakayama, E.E., and Akari, H.
  • Journal Title: Journal of General Virology Volume: 94 Pages: 1318-1324
  • DOI: 10.1099/vir.0.050252-0
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Systemic biological analysis of the mutations in two distinct HIV-1mt genomes occurred during replication in macaque cells (2013)
  • Author(s): Nomaguchi, M., Doi, N., Fujiwara, S., Saito, A., Akari, H., Nakayama, E.E., Shioda, T., Yokoyama, M., Sato, H., and Adachi, A.
  • Journal Title: Microbes and Infection Volume: 15 Pages: 319-328
  • DOI: 10.1016/j.micinf.2013.01.005
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Gag-CA Q110D mutation elicits TRIM5 -independent enhancement of HIV-1mt replication in macaque cells (2013)
  • Author(s): Nomaguchi, M., Yokoyama, M., Kono, K., Nakayama, E.E., Shioda, T., Saito, A., Doi, N., Yasutomi, Y., Matano, T., Sato, H., and Adachi, A.
  • Journal Title: Microbes and Infection Volume: 15 Pages: 56-65
  • DOI: 10.1016/j.micinf.2012.10.013
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Interferon-induced SCYL2 limits release of HIV-1 by triggering PP2A-mediated dephosphorylation of the viral protein Vpu (2012)
  • Author(s): Miyakawa, K., Sawasaki, T., Matsunaga, S., Tokarev, A., Quinn, G., Kimura, H., Nomaguchi, M., Adachi, A., Yamamoto, N., Guatelli, J., and Ryo, A.
  • Journal Title: Science Signaling Volume: 5 Pages: ra73
  • DOI: 10.1126/scisignal.2003212
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] SAMHD1 -dependent and -independent functions of HIV-2/SIV Vpx protein (2012)
  • Author(s): Fujita, M., Nomaguchi, M., Adachi, A., and Otsuka, M.
  • Journal Title: Frontiers in Microbiology Volume: 3 Pages: 297
  • DOI: 10.3389/fmicb.2012.00297
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Species tropism of HIV-1 modulated by viral accessory proteins (2012)
  • Author(s): N omaguchi, M., Doi, N., Matsumoto, Y., Sakai, Y., Fujiwara, S., and Adachi, A.
  • Journal Title: Frontiers in Microbiology Volume: 3 Pages: 267
  • DOI: 10.3389/fmicb.2012.00267
  • Peer Reviewed
• [Presentation] CCR5指向性を示す新規サル指向性HIV-1はサル個体に持続感染する (2013)
  • Author(s): 齋藤暁、大附寛幸、東濃篤徳、鈴木紗織、松田健太、高橋尚史、松岡佐織、岩谷泰雅、杉浦瓦、野間口雅子、足立昭夫、安富康宏、俣野哲朗、三浦智行、明里宏文
  • Organizer: 第27回日本エイズ学会
  • Place of Presentation: 市民会館崇城大学ホール(熊本県)
  • Year and Date: 2013-11-20
• [Presentation] SAMHD1 -independent function of HIV-2 Vpx protein (2013)
  • Author(s): チッフチハリルイブラヒム、古賀涼子、岩谷泰雅、野間口雅子、足立昭夫、大塚雅巳、藤田美歌子
  • Organizer: 第27回日本エイズ学会
  • Place of Presentation: 市民会館崇城大学ホール(熊本県)
  • Year and Date: 2013-11-20
• [Presentation] アカゲザルPBMCで効率よく増殖するHIV-1mtの構築 (2013)
  • Author(s): 足立昭夫、土肥直哉、藤原佐知、野間口雅子
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-11
• [Presentation] CCR5指向性を示す新規サル指向性HIV-1はサル個体に持続感染する (2013)
  • Author(s): 齋藤暁、大附寛幸、東濃篤徳、鈴木紗織、松田健太、高橋尚史、松岡佐織、岩谷泰雅、杉浦瓦、野間口雅子、足立昭夫、安富康宏、俣野哲朗、三浦智行、明里宏文
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-11
• [Presentation] Vpx発現におけるC末端ポリプロリンモチーフの機能の解析 (2013)
  • Author(s): 三宅在子、宮崎恭行、野間口雅子、足立昭夫
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-11
• [Presentation] マクロファージにおけるSAMHD1非依存的なHIV-2 Vpxの機能 (2013)
  • Author(s): 山本充奈美、野間口雅子、古賀涼子、岩谷泰雅、高宗暢暁、三隅将吾、大塚雅巳、足立昭夫、藤田美歌子
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-11
• [Presentation] R5-tropic HIV-1mt Env適応変異の宿主細胞依存性増殖促進機構の解析 (2013)
  • Author(s): 土肥直哉、藤原佐知、酒井遥介、大久保綾香、山根瑞萌、足立昭夫、野間口雅子
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-11
• [Presentation] HIV-1 pol (4895-4933)の1塩基置換によるウイルス複製制御機構の解析 (2013)
  • Author(s): 野間口雅子、三宅在子、土肥直哉、藤原佐知、宮崎恭行、横田恭子、横山勝、佐藤裕徳、増田貴夫、足立昭夫
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-10
• [Presentation] in vitro再構築系を用いたHIV-1/HIV-2 CAアセンブリーの安定性に関する解析 (2013)
  • Author(s): 宮崎恭行、三宅在子、野間口雅子、内山恒夫、足立昭夫
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-11-10
• [Presentation] HIV-2 Vpx富プロリン領域の機能 (2012)
  • Author(s): 藤野悠那、三宅在子、古賀涼子、川村宗吾、大出裕高、岩谷泰雅、野間口雅子、足立昭夫、大塚雅巳、宮崎恭行、藤田美歌子
  • Organizer: 第26回日本エイズ学会
  • Place of Presentation: 慶應義塾大学日吉キャンパス(神奈川県)
  • Year and Date: 2012-11-24
• [Presentation] HIV-1インテグラーゼC末端領域の1塩基置換によるウイルス複製制御機構の解析 (2012)
  • Author(s): 野間口雅子、三宅在子、土肥直哉、藤原佐知、宮崎恭行、足立昭夫
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪府)
  • Year and Date: 2012-11-14
• [Presentation] SAMHD1非依存的なHIV-2 Vpxの機能 (2012)
  • Author(s): 藤田美歌子、野間口雅子、古賀涼子、藤野悠那、大塚雅巳、足立昭夫
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪府)
  • Year and Date: 2012-11-14
• [Presentation] Vpx発現におけるC末端ポリプロリンモチーフの機能の解析 (2012)
  • Author(s): 三宅在子、藤野悠那、古賀涼子、川村宗吾、大出裕高、岩谷泰雅、野間口雅子、足立昭夫、大塚雅巳、藤田美歌子、宮崎恭行
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪府)
  • Year and Date: 2012-11-14
• [Presentation] R5-tropic HIV-1mt NL-DT562のEnv適応変異による増殖促進機構の解析 (2012)
  • Author(s): 土肥直哉、藤原佐知、酒井遥介、松本唯、足立昭夫、野間口雅子
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪府)
  • Year and Date: 2012-11-13
• [Presentation] in vitro再構築系を用いたHIV-2 CAアセンブリーの安定性に関する解析 (2012)
  • Author(s): 宮崎恭行、三宅在子、野間口雅子、内山恒夫、足立昭夫
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪府)
  • Year and Date: 2012-11-13