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2014 Fiscal Year Annual Research Report

RNA修飾の欠損と自己免疫疾患:SLE発症の新たな分子機構

Research Project

Project/Area Number 24659476
Research InstitutionUniversity of Miyazaki

Principal Investigator

剣持 直哉  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (00133124)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
KeywordsRNA修飾 / リボソーム / rRNA / snoRNA / ディスケリン / ゼブラフィッシュモデル
Outline of Annual Research Achievements

今年度はRNA修飾欠損モデルの解析に重点を置いて研究を進めた。RNA修飾を認識する抗RNA抗体については、得られたクローンの結合力に問題があること、新たなライブラリーの取得が困難になったことから、研究の継続を断念した。
1.RNA修飾欠損モデルの解析
前年度に引き続き、rRNAの修飾酵素であるディスケリンをノックダウンした先天性角化不全症モデル、U26 snoRNAの発現を阻害したRNA修飾欠損モデルのポリソームmNA解析を行い、得られたデータの情報解析を進めた。翻訳効率の変動が大きい遺伝子を解析したところ、特に、U26 snoRNAの発現阻害で脳および神経系、眼の形成に関わる遺伝子が多数同定された。
2. snoRNAデータの整備
RNA修飾に関わる核小体低分子RNA(snoRNA)のデータを収集し、データベースに整備した(http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp)。また、EMBLの支援を受けて新たに設立されたノンコーディングRNAの統合サイトRNAcentral(http://rnacentral.org)と連携し、一部のデータの移管を行った。これにより、より広くRNA修飾に関わる情報の共有が実現した。

  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] scaRNAs regulate splicing and vertebrate heart development.2015

    • Author(s)
      Patil P, Kibiryeva N, Uechi T, Marshall J, Artman M, O'Brien JE, Kenmochi N, Bittel DC.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Acta (in press)

      Volume: 0 Pages: 0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Incomplete splicing of neutrophil-specific genes affects neutrophil development in a zebrafish model of poikiloderma with neutropenia.2015

    • Author(s)
      Patil P, Uechi T, Kenmochi N
    • Journal Title

      RNA Biology

      Volume: 12(4) Pages: 426-434

    • DOI

      10.1080/15476286.2015.1017240

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] snOPY and RPG: snoRNA遺伝子およびリボソームタンパク質遺伝子データベースの構築2015

    • Author(s)
      鎌田脩作, 吉浜麻生, 中尾彰宏, 上地珠代, 剣持直哉
    • Organizer
      第3回リボソームミーティング
    • Place of Presentation
      宮崎
    • Year and Date
      2015-03-17 – 2015-03-18
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ初期発生におけるRNA修飾の役割2014

    • Author(s)
      剣持直哉
    • Organizer
      第37回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • Invited
  • [Presentation] Incomplete splicing of myeloperoxidase gene affects Neutrophil Development in the Zebrafish model of Poikiloderma with Neutropenia2014

    • Author(s)
      Prakash Patil, Tamayo Uechi, Naoya Kenmochi
    • Organizer
      第37回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] Reduced Expression of scaRNAs Disrupts Spliceosome Function and Heart Development in Zebrafish and Infants with Tetralogy of Fallot2014

    • Author(s)
      Douglas C Bittel, Prakash Patil, Tamayo Uechi, Nataliya Kibiryeva, Jennifer Marshall, Mike Artman, James E O'Brien Jr, Naoya Kenmochi
    • Organizer
      American Heart Association Scientific Sessions
    • Place of Presentation
      Chicago, USA
    • Year and Date
      2014-11-15 – 2014-11-19
  • [Presentation] RPG and snOPY: Databases for ribosomal protein genes and small nucleolar RNA genes2014

    • Author(s)
      Maki Yoshihama, Akihiro Nakao, Shusaku Kamada, Naoya Kenmochi
    • Organizer
      The 19th Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      Quebec, Canada
    • Year and Date
      2014-06-03 – 2014-06-08
  • [Remarks] 剣持研究室ホームページ

    • URL

      http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/labo

  • [Remarks] リボソームタンパク質遺伝子データベース

    • URL

      http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/

  • [Remarks] snoRNA遺伝子データベース

    • URL

      http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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