2014 Fiscal Year Annual Research Report
マイクロＲＮＡ機能推定に向けたネットワーク解析手法の開発
| Project/Area Number |
24680032
|
|---|
| Research Institution | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology |
|---|
Principal Investigator |
瀬々 潤 独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノム情報研究センター, 研究チーム長 (40361539)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
|
| Keywords | 統計的有意性 / マイクロRNA / タンパク質相互作用 / パスウエイ |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
短鎖RNA(miRNA)は，タンパク質へと翻訳されない短いRNAであり，他のRNAと相補鎖を形成することで，対象の機能を阻害する．今までのmiRNA研究は機能するmiRNA配列の発見が中心であったが，未だに明確な機能はほとんど分かっていない．近年，次世代シーケンサを利用し，ゲノムワイドにmiRNAが制御する遺伝子を観測する事が可能となった．本研究ではこの情報を利用することでmiRNAの機能を予測する手法を開発する.本研究では，昨年度までに，本当に複数の効果が合わさる現象を解析しようとした場合に，既存の多重検定補正法で有意な結果が現れにくいのかに関して，数値実験を用いて検証をし，更に，数理統計基盤として，無限次元多重検定法(LAMP)を開発した．更にこの多重検定補正の手法に関し，速度は犠牲にしつつも，より精度高く補正できる手法 FastWYを開発した．これらの手法を比べることで，統計的有意性と機能配列の比較を行った．これらの手法を実際に生命科学データに適用すると，全ての組合せを探索できる一方で，実際に結果を見てみると，生物学的な見地から見て偽陽性と思われる発見も多かった．本年度は，タンパク質相互作用(PPI)やパスウエイの様なネットワーク情報を事前知識として変数間（対象遺伝子間）の依存関係に入れることができるよう，gLAMPを開発した．PPI情報とmiRNAのターゲット遺伝子情報を組み合わせることで，複数miRNAが制御するネットワークを発見できる可能性が示唆された．
|
| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Causes of Carryover |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
