ゲノムワイド関連解析に基づく重症敗血症の個別化医療に関する研究

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 24689066
• Research Institution: Chiba University
• Principal Investigator: 中田 孝明 千葉大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任講師 (20375794)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Keywords: 遺伝子多型 / 敗血症 / ゲノムワイド関連解析

Research Abstract

１．Lymphoblasoid cellsを用いたGWAS(Stage 1)のデータ収集と解析
HapMapプロジェクト(http://www.hapmap.org/)で採取されたlymphocyteをEB virusで不死化したlymphoblastoid cellsを用い，lymphoblastoid cellを用いて，敗血症を模したcytokine mixture(TNF-alpha, IL-1beta, IFN-ganmma[各2.5 ng/mL], CpG [12.5uM])で刺激．刺激6h後のRNAをlymphoblastoid cellより抽出し，IL-6遺伝子発現レベル，細胞培養液中のIL-6濃度を測定する．これら遺伝子発現・蛋白レベルの量的形質に対するGWASを改変して行う．GWAS解析ソフトはPLINK v1.07(http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink/)を使用する．
2.重症敗血症日本人コホートのサンプル収集
重症敗血症コホートの患者サンプルおよび臨床データの収集中である．

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

計画通り，行えている．

Strategy for Future Research Activity

収集したサンプルおよび臨床データの解析を行う．また、引き続きサンプルおよび臨床データの収集を継続して行う．

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

遺伝子解析をまとめて次年度に行うため．
遺伝子解析に使用する予定である．