2013 Fiscal Year Annual Research Report
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24710227
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
神吉 康晴 東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)
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| Keywords | 血管内皮細胞 / 細胞分化 / ヒストン修飾 / 非翻訳RNA / 転写因子 / GATA2 |
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| Research Abstract |
マウスES細胞を分化誘導させ、VEGF（血管内皮増殖因子）受容体2（Flk、別名Kdr）陽性の中胚葉群をソート後、VEGFを48時間作用させることで血管内皮細胞を高い効率で誘導できる。平成24年度は、この実験系において、経時的なマイクロアレイ解析及び、ヒストン修飾抗体を用いたChIP-sequence解析を行い、Gata2, Fli1, Sox7, Sox18の4遺伝子を血管内皮細胞分化に重要な転写因子として抽出した。
最終年度はまず、これら4遺伝子をそれぞれ個別にノックダウンした場合、及び同時に4遺伝子をノックダウンした場合に分けて、マイクロアレイ解析を行った。その結果、Gata2の下流にある遺伝子は細胞表面の形質維持に必要な遺伝子が多く含まれており、実際に形態が変化する様子が観察された。Fli1, Sox7, Sox18もそれぞれ標的とする遺伝子は異なっており、ノックダウンした際の形態変化も異なるという結果であった。更に4遺伝子全てをノックダウンすると、内皮細胞特異的遺伝子のほとんどが発現抑制され、内皮細胞は本来の形態を失い、小さく丸い形態となった。
上記結果より、細胞分化は一つの転写因子で決定づけられるわけではなく、認識配列の異なる転写因子の組み合わせで形作られていくことを見出し、血管内皮細胞における新たな転写因子ネットワークを提唱する結果を得た。
最終年度は更に、内皮分化時の非翻訳RNAに着目し、RNA-sequence解析を行った。その結果、VEGF刺激後6時間、12時間といった早期に上記Gata2やSox7と同じように、特異的に誘導されてくるlong noncoding RNAを同定した。これまで細胞分化では転写因子が注目されているが、本結果は、非翻訳RNAによる細胞運命決定の新たなメカニズムを解き明かす可能性を示している。
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[Journal Article] Cross-enhancement of ANGPTL4 transcription by HIF1 alpha and PPAR beta/delta is the result of the conformational proximity of two response elements.2014
Author(s)
Inoue T, Kohro T, Tanaka T, Kanki Y, Li G, Poh HM, Mimura I, Kobayashi M, Taguchi A, Maejima T, Suehiro JI, Sugiyama A, Kaneki K, Aruga H, Dong S, Stevens JF, Yamamoto S, Tsutsumi S, Fujita T, Ruan X, Aburatani H, Nangaku M, Ruan Y, Kodama T, Wada Y.
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Journal Title
Genome Biology
Volume: in press
Pages: in press
Peer Reviewed
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[Journal Article] GATA factor switching from GATA2 to GATA1 contributes to erythroid differentiation.2013
Author(s)
Suzuki M, Kobayashi-Osaki M, Tsutsumi S, Pan X, Ohmori S, Takai J, Moriguchi T, Ohneda O, Ohneda K, Shimizu R, Kanki Y, Kodama T, Aburatani H, Yamamoto M.
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Journal Title
Genes to Cells
Volume: 18(11)
Pages: 921-33
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor-associated macrophages.2013
Author(s)
Osawa T, Tsuchida R, Muramatsu M, Shimamura T, Wang F, Suehiro J, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M.
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Journal Title
Cancer Research
Volume: 73(10)
Pages: 3019-28
DOI
Peer Reviewed
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