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2013 Fiscal Year Annual Research Report

転写と共役したクロマチン制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 24710229
Research InstitutionShimane University

Principal Investigator

加藤 太陽  島根大学, 医学部, 助教 (40548418)

Keywords転写 / クロマチン / Spt6 / Iws1 / RNAポリメラーゼII / ヘテロクロマチン
Research Abstract

転写装置であるRNAポリメラーゼII(Pol2)と直接相互作用するヒストンシャペロンであるSpt6は、転写領域の既存のヒストンの流出を抑制する。このSpt6と相互作用するIws1は、試験管内においてSpt6とヒストンの相互作用を拮抗阻害するという報告があるが、細胞内での役割はほとんど分かっていなかった。
本研究ではクロマチン免疫沈降(ChIP)等によってIws1の機能をゲノムワイドに解析した。Iws1の遺伝子破壊は、ヘテロクロマチンにおけるサイレンシングを脱抑制するだけでなく、ヘテロクロマチンやユークロマチンの転写領域においてヒストン量を減少させた。ヒストン量の減少の程度は転写量(Pol2の結合量)と相関した。ただし、これらの表現型はSpt6の遺伝子破壊より程度が弱く、この傾向はヒストンH3のメチル化修飾の維持という観点からも同様であり、Iws1は補助的に働くことが示唆された。本研究では、ChIPで得たサンプルの高速シーケンシング(ChIP-seq)の解析系の改善にも取り組んだ。興味深いことに、遺伝子の配向性を考慮に入れたゲノムワイドな検討の結果、Spt6とIws1の遺伝子破壊によってヒストンH3の配置が転写の下流方向にシフトすることが判明した。このことから、Iws1はSpt6を補助してDNAとヒストンの結合の維持に貢献し、その機能が損なわれることで転写時のヒストン流失やヒストンのズレが生じると考えられる。

  • Research Products

    (6 results)

All 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The transcription factors Atf1 and Pcr1 are essential for transcriptional induction of the extracellular maltase Agl1 in fission yeast2013

    • Author(s)
      Kato H, Kira S, Kawamukai M
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: vol.8 No.11 Pages: 80572

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0080572

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spt6:two fundamentally distinct function in the regulation of histone modification Epigenetics2013

    • Author(s)
      Kato H, Okazaki K and Urano T
    • Journal Title

      Epigenetics

      Volume: 8 Pages: 1249-53

    • DOI

      10.4161/epi.26487

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spt6 prevents transcription-coupled loss of posttranslationally modified histone H32013

    • Author(s)
      Kato H, Okazaki K, Iida T, Nakayama J, Murakami Y and Urano T
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 3 Pages: 2186

    • DOI

      10.1038/srep02186

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mediator directs co-transcriptional heterochromatin assembly by RNA interference-dependent and -independent pathways2013

    • Author(s)
      Oya E, Kato H, Chikashige Y, Tsutsumi C, Hiraoka Y and Murakami Y
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: 9 Pages: 1003677

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1003677

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Spt6 prevents transcription-coupled loss of posttranslationally modified histone H32013

    • Author(s)
      Kato H
    • Organizer
      Message from Yeast to Epigenetics
    • Place of Presentation
      福井県あわら市(グランディア芳泉)
    • Year and Date
      20130902-20130904
    • Invited
  • [Remarks] 島根大学医学部病態生化学ホームページ

    • URL

      http://www.med.shimane-u.ac.jp/biochem2/index.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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