2013 Fiscal Year Final Research Report
Development of programmable small molecules capable of switching ON the transcriptional machinery of pluripotency genes.
| Project/Area Number |
24710261
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Research Field |
Chemical biology
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
SUGIYAMA Hiroshi 京都大学, 理学研究科, 教授 (50183843)
BANDO Toshikazu 京都大学, 理学研究科, 准教授 (20345284)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | 人工遺伝子スイッチ / 細胞リプログラミング / 小分子 / 合成生物学 / iPS細胞 |
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| Research Abstract |
Artificial transcriptional activators with epigenetic activity can retain the capability of their natural equivalents to rewire transcriptional machinery within a cell. During this tenure, we have demonstrated the potential of our novel small molecules for genome engineering termed `SAHA-PIP` containing sequence-specific pyrrole-imidazole polyamides (PIPs) and SAHA, a histone deacetylase inhibitor. We tailored SAHA-PIPs to distinctively activate the pluripotency genes by triggering transcriptionally permissive chromatin in mouse fibroblasts. We have generated PIP conjugates with fluorescent dyes and those targeting different epigenetic enzymes. In human fibroblasts, a SAHA-PIP got characterized as germ cell gene switch and genome-wide gene analysis revealed the capability of thirty-two distinct small molecules to trigger the transcriptional activation of exclusive developmental genes. Our results contribute to the development of novel chemical approach for controlling cell fate.
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[Remarks] Ganesh N. Pandian, Induced pluripotent stem cells and Genetic switches, Stem Cell Research Laboratory, Government Stanley Hospital, Tamil Nadu, India, 21 Sep. 2013
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[Remarks] Ganesh N. Pandian, Cellular reprogramming–A chemical approach, Madurai Kamraj University, Tamil Nadu, India, 18 Sep. 2013
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[Remarks] Ganesh N. Pandian, Cellular time machine : Back to the future, Kalasalingam University, Tamil Nadu, India, 17 Sep. 2013
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[Remarks] Ganesh N. Pandian, Genetic switches to control cellular time machine, Lady Doak College, Tamil Nadu, India, 13 Sep. 2013
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[Remarks] 日刊工業新聞「京大、"人工スイッチ"開発−細胞の遺伝子発現を制御」(2014年2月3日17面)
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[Remarks] GEN News「遺伝子発現スイッチ、眠ったDNAの目覚ましに」(2014年1月31日[ウェブ])
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[Remarks] マイナビニュース| Yahoo!Japanニュース「京大、狙ったDNAに結合する化合物で細胞の遺伝子発現の制御に成功」(2014年1月28日)
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[Remarks] nano.com「iCeMS研究者ら、DNAに基づく化合物を作製、細胞の遺伝子発現コントロール」(2014年1月27日[ウェブ])•朝日新聞「遺伝子のスイッチ、直接入れることに成功京大グループ」(2014年1月25日8面)
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[Remarks] 中日新聞「遺伝子使わずiPSか、京大、化合物加え似た細胞」(2014年1月25日3面)
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[Remarks] 京都新聞「狙った遺伝子制御、京大グループ成功」(2014年1月25日28面)
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[Remarks] 日本経済新聞「眠れる遺伝子働かせる、京大が化合物、iPS応用も。」(2014年1月25日42面)
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[Remarks] 産経新聞「皮膚に化合物加えiPSに似た細胞京大チーム作製」(2014年1月25日28面)
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[Remarks] 読売新聞「特定遺伝子スイッチON、化合物で活性」(2014年1月25日34面)
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[Remarks] 47 News「皮膚に化合物加えiPSに似た細胞京大チーム作製」(2014年1月24日)
