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2014 Fiscal Year Annual Research Report

未培養微生物の機能推定技術の開発ー細胞壁処理不要の高感度FISH法の開発ー

Research Project

Project/Area Number 24760437
Research InstitutionAnan National College of Technology

Principal Investigator

川上 周司  阿南工業高等専門学校, その他部局等, 助教 (00610461)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords高感度FISH法 / 環境微生物 / シングルセル解析
Outline of Annual Research Achievements

H26年度は、H24年度から開発をはじめたin situ HCR法を環境サンプルに応用する実証実験を行った。我々の研究フィールである排水処理システムの汚泥や嫌気性汚泥などに対しin situ HCR法の適用例を示すとともに、通常のFISH法では検出できない低活性の微生物の可視化に成功した。またin situ HCR法のさらなる高感度化を目指し、dextran sulfateを使う新しいプロトコールの検討を行い、確立した。3年間の開発期間を通してin situ HCR法を実用レベルの技術にまで押し上げることができた。
アプタマーを用いた微生物検出技術の開発では、H26年度の検討から大腸菌を特異的に検出できる系の確立に成功した。またAMOも用いた任意の酵素を検出する系では、AMOの人工合成に成功し、SELEX法を行う段階まで到達できた。アプタマーを用いて微生物をシングルセルレベルで可視化した報告はこれまでなく、本研究でその実用可能性を示すことができた。

  • Research Products

    (4 results)

All 2015 2014

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] In situ DNA-HCR: A facilitated in situ hybridization chain reaction system for the detection of environmental microorganisms2015

    • Author(s)
      Tsuyoshi Yamaguchi, Shuji Kawakami, Masashi Hatamoto, Hiroyuki Imachi, Masanobu Takahashi, Nobuo Araki, Takashi Yamaguchi and Kengo Kubota.
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: ? Pages: ?

    • DOI

      10.1111/1462-2920.12745

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 環境微生物の細胞壁タンパク質を検出するアプタマーの開発2015

    • Author(s)
      柿内涼太, 今出圭哉, 川上周司, 山田剛史, 山口剛士, 山口隆司.
    • Organizer
      第49回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] Modification of in situ DNA-HCR protocol for speedy detecting environmental microorganisms.2015

    • Author(s)
      山口剛士, Bernhard M. Fuchs, 川上周司, 幡本将史, 久保田健吾, Rudolf Amann, 山口隆司.
    • Organizer
      第49回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] Applicability of in situ DNA-HCR for the detection of Archaea in anaerobic sludge2014

    • Author(s)
      Tsuyoshi YAMAGUCHI, Shuji Kawakami, Masashi HATAMOTO, Kengo KUBOTA, Nobuo ARAKI, Takashi YAMAGUCHI.
    • Organizer
      15th International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      Seoul, South-Korea
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-29

URL: 

Published: 2016-06-01  

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