2013 Fiscal Year Annual Research Report
環境ストレス応答性選択的スプライシングを介した遺伝子発現制御ネットワークの解析
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24770046
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| Research Institution | Chubu University |
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Principal Investigator |
吉村 和也 中部大学, 応用生物学部, 准教授 (90379561)
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| Keywords | 環境応答 / 選択的スプライシング / 植物 / SRタンパク質 / 環境ストレス |
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| Research Abstract |
これまでに、シロイヌナズナの2種類のセリンアルギニンリッチ(SR)タンパク質、atSR45aとatSR30が転写因子を含む多様な遺伝子の強光下での選択的スプライシング効率制御に機能することを示してきた。本研究では、環境ストレス応答性選択的スプライシングを介した遺伝子発現制御ネットワークを明らかにすることを目的として、以下の研究を行った。
1. 強光ストレス応答性 選択的スプライシング制御因子、atSR30の相互作用因子の同定
スプライシング制御機構におけるatSR30の役割を明らかにするために、酵母Two-Hybrid法を用いて相互作用因子の同定を試みた。その結果、atSR30は他のSRタンパク質であるatSR45やatSCL30や、機能未知のnucleic acid binding proteinに加え、CCCH-type family proteinやPR-5などのスプライシング因子ではないと考えられる他のタンパク質とも相互作用していることが明らかになった。
2. 新規選択的スプライシング制御因子のストレスに応答した発現制御機構の解析
シロイヌナズナにおける新規選択的スプライシング制御因子のホモログの中から、環境ストレスに応答を示す因子をデータベース上から、hnRNPA1を6種類 (hnRNPA1-1, hnRNPA1-2, hnRNPA1-3, hnRNPA1-4, hnRNPA1-5, hnRNPA1-6) 、FOX1を3種類 (FOX1-1, FOX1-2, FOX1-3)、およびNOVA1を1種類 (NOVA1) 選抜し、それらの環境ストレス応答に対する発現応答性の解析を行った。その結果、個々の因子ごとに強光、塩、乾燥、および熱ストレスによる特異的な発現誘導もしくは抑制が認められた。
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[Journal Article] Transient expression analysis reveals importance of VTC2 expression level in light/dark regulation of ascorbate biosynthesis in Arabidopsis2014
Author(s)
1. Yoshimura, K., Nakane, T., Kume, S., Shiomi, Y., Maruta, T., Ishikawa, T., Shigeoka, S.
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Journal Title
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
Peer Reviewed
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