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2014 Fiscal Year Annual Research Report

葉の形態の表現型可塑性の分子基盤の解明:環境に応じて葉形を変化させる植物の研究

Research Project

Project/Area Number 24770047
Research InstitutionKyoto Sangyo University

Principal Investigator

木村 成介  京都産業大学, 総合生命科学部, 准教授 (40339122)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords表現型可塑性 / 葉 / 異形葉性 / トランスクリプトーム
Outline of Annual Research Achievements

北米の湖畔に生育する植物ニューベキアは、生育環境に応じて葉の形態を大きく変化させる特徴(表現型可塑性)を持つ。本年度は、下記(1)~(3)の具体的な研究項目(目的)のそれぞれについて、以下のような実績をあげた。

(1) ニューベキアの葉の形態の表現型可塑性の発生学的基盤の解明: 昨年度までの研究で植物ホルモンのジベレリンが表現型可塑性の発現に重要であることを明らかにしてきたが、下記(2)のmRNA-seqの解析によって、当初は注目していなかった植物ホルモンのエチレンが異形葉性に関与していることを示唆する結果を得た。そこで、エチレンの前駆体や作用阻害剤を用いて、陸生条件におけるエチレンと葉形との関連を調べた。その結果、エチレンはR. aquaticaの葉身展開を抑制することが明らかとなった。
(2) トランスクリプトーム解析による表現型可塑性に重要な遺伝子の同定と機能解析: 表現型可塑性に関わる遺伝子あるいは遺伝子制御ネットワーク(GRN)を明らかにするために、mRNA-seqを行ないデータ解析を行った。その結果、葉の葉身展開に関わることが知られているGASA14遺伝子の発現が有意に変動していることを見出した。昨年度までの研究で、ジベレリンが生育温度の変化によって誘導される表現型可塑性に関わることが明らかになっていたが、GASA14はジベレリンの下流ではたらくことが知られている。このことから、R. aquaticaのジベレリンが関与する異形葉性GRNの構成因子のひとつを同定することができたと考えている。
(3) 重イオンビーム照射による突然変異体の単離と解析: 重イオンビーム照射により葉の形態の表現型可塑性に異常のある変異体の単離を試みたが、残念ながら葉の形態に異常があるものを見つけることができなかった。

  • Research Products

    (17 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Transcriptional, post-transcriptional and post-translational regulation of SHOOT MERISTEMLESS gene expression in Arabidopsis determines gene function in shoot apex2015

    • Author(s)
      Jose Antonio Aguilar-Martinez, Naoyuki Uchida, Brad Townsley, Donnelly Ann West, Andrea Yanez, Nafeesa Lynn, Seisuke Kimura, Neelima Sinha
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 167 Pages: 424-442

    • DOI

      10.1104/pp.114.248625

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of the KNOX-GA gene module induces heterophyllic alternation in North American lake cress2014

    • Author(s)
      Hokuto Nakayama, Naomi Nakayama, Sumer Seiki, Mikiko Kojima, Hitoshi Sakakibara, Neelima Sinha, Seisuke Kimura
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 26 Pages: 4733-4748

    • DOI

      10.1105/tpc.114.130229

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A developmental model for branching morphogenesis of lake cress compound leaf2014

    • Author(s)
      Akiko Nakamasu, Hokuto Nakayama, Naomi Nakayama, Nobuhiko J. Suematsu, Seisuke Kimura
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 9 Pages: 111615

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0111615

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The genome of the stress tolerant wild tomato species Solanum pennellii2014

    • Author(s)
      Anthony Bolger 他42名(Seisuke Kimura 24番目)
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 46 Pages: 1034-1028

    • DOI

      10.1038/ng.3046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The role of SOG1, a plant-specific transcriptional regulator, in the DNA damage response2014

    • Author(s)
      Kaoru O Yoshiyama, Seisuke Kimura, Hisaji Maki, Anne B. Britt, Masaaki Umeda
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: 9 Pages: 28889

    • DOI

      10.4161/psb.28889

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Developmental and molecular studies on the mechanism of vegetative propagation in Rorippa aquatica2015

    • Author(s)
      Rumi Amano, Hokuto Nakayama, Shizuka Gunji, Ali Ferjani, Seisuke Kimura
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-20
  • [Presentation] 変動する環境(温度など)と発生(主に葉)への衝撃 -アブラナ科植物Rorippa aquaticaの場合-2014

    • Author(s)
      中山北斗
    • Organizer
      第7回Evo-devo青年の会「変動する環境と発生への衝撃」
    • Place of Presentation
      遺伝学研究所(静岡県)
    • Year and Date
      2014-10-11 – 2014-10-11
    • Invited
  • [Presentation] 非均一な成長場におけるチューリングパターンの挙動とそれを元に形成される分岐構造について2014

    • Author(s)
      中益朗子、末松J信彦、木村成介
    • Organizer
      第11回生物数学の理論とその応用
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府)
    • Year and Date
      2014-09-16 – 2014-09-19
  • [Presentation] RNA-seqによるトランスクリプトーム解析を用いたRorippa aquaticaにおける異形葉性の分子基盤の解明2014

    • Author(s)
      中山北斗,市橋泰範、坂本智昭、倉田哲也、木村成介
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 複葉に見られる分岐構造の非対称性形成に関する理論的なアプローチ2014

    • Author(s)
      中益朗子、末松信彦、木村成介
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 葉断面から再生するRorippa aquaticaの栄養繁殖機構の解析2014

    • Author(s)
      天野瑠美、中山北斗、Ali Ferjani、木村成介
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 環境に応じて葉形を変化させる植物Rorippa aquaticaを用いた葉形制御機構の解明2014

    • Author(s)
      中山北斗、中山尚美、小島美紀子、榊原均、Neelima Sinha, 木村成介
    • Organizer
      植物形態学会第26回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県)
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-11
  • [Presentation] Developmental and molecular mechanism of the heterophylly in North American lake cress (Rorippa aquatica; Brassicaceae)2014

    • Author(s)
      Hokuto Nakayama, Naomi Nakayama, Mikiko Kojima, Hitoshi Sakakibara, Neelima Sinha, Seisuke Kimura
    • Organizer
      The 25th International Conference on Arabidopsis Research (ICAR 2014)
    • Place of Presentation
      The University of British Columbia, Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
  • [Presentation] Behavior of Tuning Pattern on Non-uniform Growing Filed, and Asymmetric Branched Patterns Generated by The Anisotropic Growth2014

    • Author(s)
      Akiko Nakamasu, Nobuhiko J. Suematsu, Seisuke Kimura
    • Organizer
      he Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology (JSMB SMB 2014)
    • Place of Presentation
      Osaka International Convention Center (Osaka, Japan)
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
  • [Presentation] Theoretical Approach for the Mechanisms Underlying the Heterophylly of Lake Cress (Rorippa aquatica)2014

    • Author(s)
      kiko Nakamasu, Hokuto Nakayama, Nobuhiko J. Suematsu, Seisuke Kimura
    • Organizer
      47th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Place of Presentation
      WINC AICH (Nagoya, Japan)
    • Year and Date
      2014-05-27 – 2014-05-30
  • [Presentation] 生育環境により葉の形態を変化させる植物ニューベキア(Rorippa aquatica)を用いた表現型可塑性の研究2014

    • Author(s)
      木村成介
    • Organizer
      東京理科大学応用生物科学専攻セミナー
    • Place of Presentation
      東京理科大学野田キャンパス(千葉県)
    • Year and Date
      2014-05-19 – 2014-05-19
    • Invited
  • [Remarks] 植物生態進化発生学研究室

    • URL

      http://www.cc.kyoto-su.ac.jp/~seisuke/index-j.html/HOME.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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