• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Research-status Report

好熱性真核生物のゲノム情報を基盤とした小胞体関連分解装置の構造生物学研究

Research Project

Project/Area Number 24770102
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

佐藤 匡史  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (80532100)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Keywords構造生物学 / 好熱性真核生物 / X線結晶構造解析 / NMR解析
Research Abstract

本研究は、小胞体において糖タンパク質の運命決定を下す小胞体品質管理マシーナリーの分子認識および作動機構の解明を目的としている。
本研究の特徴の一つは、真核生物の中で高い生育温度(約60℃)を持つ好熱カビのゲノム情報を活用することである。そこで平成24年度では、好熱カビの小胞体品質管理マシーナリーを構成するタンパク質素子の網羅的なcDNAクローニング、大量発現系の構築、および結晶化を行った。その結果、幾つかの構成素子の大腸菌での組換えタンパク質の大量発現に成功した。特にタンパク質成熟化に関わるプロテインジスルフィドイソメラーゼ(PDI)に関して、基質結合に関わるb'-a'ドメインの酸化型および還元型の結晶構造の決定に成功した。これにより、酸化還元に伴うPDIの構造変化に関して有益な知見を得ることが出来た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

現在、好熱カビの小胞体品質管理マシーナリーを構成する幾つかのタンパク質素子の大量発現系の構築に成功している。さらに、構成素子の一つであるPDIの酸化型および還元型の結晶構造解析に成功している。以上、総合的に判断しておおむね順調に研究は進展している。

Strategy for Future Research Activity

小胞体品質管理マシーナリーが標的とするモデル基質の調製およびそれを用いた機能解析を行い、その結果を鑑みて、タンパク質複合体のX線結晶構造解析、NMR解析、電子顕微鏡解析などの多角的な構造生物学研究を順次遂行していく。モデル基質の調製は、タンパク質工学的アプローチに加えて、ケミカルバイオロジー的手法も併せて検討する。最近、私たちのグループでは、組換え酵母により安定同位体標識した高マンノース型糖鎖を調製することにも成功している。これをNMRによる相互作用解析に活用することも視野に入れて研究を遂行する。フォールディングセンサーなど柔構造を持つことが推測されるドメインと基質との相互作用解析は主にNMRを用いる。そこでは、アンフォールドタンパク質の解析が可能な分子研の超高磁場NMRを積極的に活用する。一方、ある程度の静的構造を持つことが予想されるドメインの立体構造解析についてはX線結晶構造解析を用いる。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

平成24年度において、好熱カビの小胞体品質管理マシーナリーを構成するタンパク質素子の大量発現系の構築が当初の計画より進展しなかったため、経費の大部分を計上していたNMR解析や結晶構造解析を十分に行えなかった。ただし、本年度末にかけて研究が大きく進捗したため、現在では計画通り研究は進展している。

  • Research Products

    (11 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] An archaeal homolog of proteasome assembly factor functions as a proteasome activator2013

    • Author(s)
      K. Kumoi, T. Satoh, K. Murata, T. Hiromoto, T. Mizushima, Y. Kamiya, M. Noda, S. Uchiyama, H. Yagi, and K. Kato
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 8 Pages: e60294

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0060294

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular and structural basis for N-glycan-dependent determination of glycoprotein fates in cells2012

    • Author(s)
      Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, Koichi Kato
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta

      Volume: 1820 Pages: 1327-1337

    • DOI

      doi:10.1016/j.bbagen.2011.12.017

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular and structural basis for sugar recognition by mannose 6-phosphate receptor homology domain-containing lectins and proteins2012

    • Author(s)
      Tadashi Satoh
    • Journal Title

      Trends in Glycoscience and Glycotechnology

      Volume: 24 Pages: 193-202

    • DOI

      doi.10.4052/tigg.24.193

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 古細菌タンパク質PbaBによるATP非依存的プロテアソーム活性化機構の構造基盤

    • Author(s)
      雲井健太郎,佐藤匡史,廣本武史,水島恒裕,神谷由紀子,野田勝紀,内山 進,村田和義,矢木宏和,加藤晃一
    • Organizer
      第76回日本生化学会 中部支部例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎
  • [Presentation] タンパク質の機能拡張子としての糖鎖を観る

    • Author(s)
      加藤晃一,矢木宏和,神谷由紀子,佐藤匡史
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Invited
  • [Presentation] 新規プロテアソーム活性化因子PbaB の構造と機能

    • Author(s)
      雲井健太郎,佐藤匡史,矢木宏和,廣本武史,水島恒裕,内山 進,野田勝紀,村田和義,神谷由紀子,加藤晃一
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
  • [Presentation] 糖タンパク質の輸送と分解に関わる細胞内レクチンの構造生物学研究

    • Author(s)
      佐藤匡史
    • Organizer
      第31回 日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Invited
  • [Presentation] Molecular mechanism of redox-dependent domain rearrangement of the substrate-binding region of protein disulfide isomerase

    • Author(s)
      Kouya Inagaki, Yoshinori Uekusa, Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, Koichi Kato
    • Organizer
      第50回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
  • [Presentation] Redox-dependent conformational dynamics of protein disulfide isomerase coupled with exposure of its substrate binding region

    • Author(s)
      Kouya Inagaki, Yoshinori Uekusa, Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, Koichi Kato
    • Organizer
      The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • Place of Presentation
      京都
  • [Presentation] プロテアソームを構成するサブユニットとその集合因子Ump1pの相互作用解析

    • Author(s)
      大川慶祐,矢木宏和,植草義徳,矢木真穂,水島恒裕,佐藤匡史,佐伯 泰,田中啓二,加藤晃一
    • Organizer
      日本生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋
  • [Presentation] プロテアソーム集合因子Nas2を介したプロテアソームの分子集合機構の構造基盤

    • Author(s)
      佐藤匡史,植草義徳,廣本武史,矢木真穂,矢木宏和,水島恒裕,佐伯 泰,田中啓二,加藤晃一
    • Organizer
      日本薬学会 第133回年会
    • Place of Presentation
      横浜

URL: 

Published: 2014-07-24  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi