2014 Fiscal Year Annual Research Report
インフォマティクスを活用した血中タンパク質・ペプチドリストよりの疾患マーカー探索
| Project/Area Number |
24790548
|
|---|
| Research Institution | Chiba University |
|---|
Principal Investigator |
西村 基 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (80400969)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
|
| Keywords | 質量分析 / Immuno-MS / 免疫沈降 / 抗体 / セロタイピング |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
研究代表者らは、平成24～26年度の文科省科学研究費助成により汎Apolipoprotein E(ApoE)抗体による免疫沈降(IP; ImmunoPrecipitation)と質量分析(MS; Mass Spectrometry)との組み合わせ（いわゆるImmuno-MS）で血清ApoEのほぼ全長がリシーケンス可能であり、従来のジェノタイピングと同等の情報が得られるDNA-freeなセロタイピングに応用できることを示した(PLoS One. 2014 Jan 14;9(1):e85356)。ここで行っているIPは、保険収載もされているApoE定量検査に用いられている国内企業製の臨床検査試薬を、バッファーなど関連試薬も含めそのまま転用したものである。つまり臨床検査試薬に質量分析を検出系として組み合わせ、Immuno-MSとすることで単に血中ApoE定量を行うイムノアッセイであった試薬にアイソフォーム・タイピングを行う機能を付加できた。ApoEにはE2,E3,E4の3つのアイソフォーム・タンパク質が存在するが、ApoE2はIII型家族性脂質異常症の原因と目され、またApoE4はアルツハイマー型認知症の強力なリスクファクターと認識されている。よって、アイソフォーム・タイピングを行う機能を付加することはApoE定量イムノアッセイに、従来のジェノタイピングと同等の情報が得られるDNA-freeな、これら疾患の遺伝学的な診断を行う能力を付加することとなった（Expert Rev Proteomics. 2014 Aug;11(4):405-7）。「血中タンパク質・ペプチドリストよりの疾患マーカー探索」としてApoEという実例を用いて、マーカーの質量分析により得られる情報の多様な事を示す事が出来た。
|
| Remarks |
このＵＲＬは研究者が作成したものではなく、世界的な分析機器メーカーであるThermo Scientific社が後援し作成しているプロテオミクスの研究者向けニュースサイトが研究代表者らの成果を取り上げた記事のページである。
|
-
[Journal Article] High-throughput Screening of Extended RAS Mutations Based on High-Resolution Melting Analysis for prediction of anti-EGFR Treatment Efficacy in Colorectal Carcinoma.2014
Author(s)
Ishige T, Itoga S, Sato K, Kitamura K, Nishimura M, Sawai S, Matsushita K, Suzuki K, Ota S, Miyauchi H, Matsubara H, Nakatani Y, Nomura F.
-
Journal Title
Clin Biochem.
Volume: 47
Pages: 340-3.
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] Second-generation antipsychotics and bone turnover in schizophrenia.2014
Author(s)
Okita K, Kanahara N, Nishimura M, Yoshida T, Yasui-Furukori N, Niitsu T, Yoshida T, Ishikawa M, Kimura H, Nomura F, Iyo M.
-
Journal Title
Schizophr Res.
Volume: 157
Pages: 137-41
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Direct application of MALDI-TOF mass spectrometry to cerebrospinal fluid for rapid pathogen identification in a patient with bacterial meningitis.2014
Author(s)
Segawa S, Sawai S, Murata S, Nishimura M, Beppu M, Sogawa K, Watanabe M, Satoh M, Matsutani T, Kobayashi M, Iwadate Y, Kuwabara S, Saeki N, Nomura F.
-
Journal Title
Clin Chim Acta.
Volume: 435
Pages: 59-61.
DOI
Peer Reviewed
-
