2013 Fiscal Year Annual Research Report
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24790893
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
土井 宏 横浜市立大学, 医学部, 講師 (10326035)
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| Keywords | 脊髄小脳変性症 / エクソーム |
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| Research Abstract |
既知遺伝子未同定の常染色体劣性遺伝性脊髄小脳変性症（ARSCA）2家系（家系Aおよび家系Bとする）および、常染色体優性遺伝性脊髄小脳変性症（ADSCA）2家系（家系Cおよび家系Dとする）を対象として新規責任遺伝子の同定を試みた。前年度までに全ての対象家系について次世代シーケンサーによるエクソーム解析を終了しており、家系Aについては遺伝子X変異を責任遺伝子候補として同定していた。しかし他施設から遺伝子X変異が類縁疾患である常染色体劣性遺伝性痙性対麻痺（ARHSP）の原因であるとの報告が平成24年12月に論文掲載されたため、家系Aについては表現型の多様性のメカニズムを究明すべく、遺伝子Xの酵素活性の測定を他機関との共同研究で行い、論文を作成している。家系B、C、Dについては次世代シーケンサーによるエクソーム解析で認められた日本人正常コントロールにおける頻度の低い変異について、他の例で同じ遺伝子に認められないかどうか、SCA患者DNA160例のスクリーニングを、MiSeqを用いて行った。しかし、現時点では遺伝子同定に至っていない。本解析を通じて新たに収集したARSCA8家系についてもエクソーム解析を追加したが、そのうち2家系は本邦でまったく報告のなかったSPG7変異例、SCARB2変異例であることを同定し、それぞれ英文論文として報告した。また1家系においては既知の疾患関連遺伝子ではない遺伝子のホモ接合性ナンセンス変異を同定しており、今後解析を進めていく予定である。
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Research Products
(10 results)
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[Journal Article] Identification of a novel homozygous SPG7 mutation in a Japanese patient with spastic ataxia: making an efficient diagnosis using exome sequencing for autosomal recessive cerebellar ataxia and spastic paraplegia.2013
Author(s)
Doi H, Ohba C, Tsurusaki Y, Miyatake S, Miyake N, Saitsu H, Kawamoto Y, Yoshida T, Koyano S, Suzuki Y, Kuroiwa Y, Tanaka F and Matsumoto N.
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Journal Title
Intern Med
Volume: 52
Pages: 1629-1633
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mutations in KLHL40 are a frequent cause of severe autosomal-recessive nemaline myopathy.2013
Author(s)
Ravenscroft G, Miyatake S, Lehtokari VL, Todd EJ, Vornanen P, Yau KS, Hayashi YK, Miyake N, Tsurusaki Y, Doi H, Saitsu H, Osaka H, Yamashita S, Ohya T, Sakamoto Y, Koshimizu E, Imamura S, Yamashita M, Ogata K, Shiina M, Matsumoto N, et al.
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Journal Title
Am J Hum Genet
Volume: 93
Pages: 6-18
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Diagnostic utility of whole exome sequencing in patients showing cerebellar and/or vermis atrophy in childhood.2013
Author(s)
Ohba C, Osaka H, Iai M, Yamashita S, Suzuki Y, Aida N, Shimozawa N, Takamura A, Doi H, Tomita-Katsumoto A, Nishiyama K, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Eto Y, Tanaka F, Matsumoto N.
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Journal Title
Neurogenetics
Volume: 14
Pages: 225-232
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Olfactory impairment and pathology in neurodegenerative disorders with brain iron accumulation.2013
Author(s)
Dziewulska D, Doi H, Fasano A, Erro R, Fatehi F, Fekete R, Gatto EM, Pablos EG, Lehn A, Miyajima H, Piperno A, Pellechia MT, Wu YR, Yoshida K, Zarruk JG, Jingli S, Schrag A, McNeill A.
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Journal Title
Acta Neuropathol
Volume: 126
Pages: 151-153
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Pathogenic mutations in two families with congenital cataract identified with whole-exome sequencing.2013
Author(s)
Kondo Y, Saitsu H, Miyamoto T, Lee BJ, Nishiyama K, Nakashima M, Tsurusaki Y, Doi H, Miyake N, Kim JH, Yu YS, Matsumoto N.
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Journal Title
Mol Vis
Volume: 19
Pages: 384-389
Peer Reviewed
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[Journal Article] Whole-exome sequencing identified a homozygous FNBP4 mutation in a family with a condition similar to microphthalmia with limb anomalies.2013
Author(s)
Kondo Y, Koshimizu E, Megarbane A, Hamanoue H, Okada I, Nishiyama K, Kodera H, Miyatake S, Tsurusaki Y, Nakashima M, Doi H, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N.
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Journal Title
Am J Med Genet A
Volume: 161A
Pages: 1543-1546
DOI
Peer Reviewed
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