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2013 Fiscal Year Research-status Report

黄色ブドウ球菌感染症をコントロールする緊縮制御ネットワークの総括的解明

Research Project

Project/Area Number 24791029
Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

片山 由紀  順天堂大学, 医学部, 助教 (60365591)

Keywords黄色ブドウ球菌 / バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌 / rpoB / ppGpp / 緊縮制御ネットワーク
Research Abstract

RNA ポリメラーゼβサブユニットをコードするrpoB遺伝子は、緊縮制御ネットワークの関連遺伝子である。細菌は栄養飢餓でアミノ酸が欠乏すると、タンパク合成が停止し、ppGpp を合成する。そしてこの合成されたppGpp がRNA ポリメラーゼβサブユニットやそのプロモーター領域に結合すると、遺伝子における転写活性が質と量の両面で変化し、その結果、病原性、薬剤耐性化および代謝経路の変化が生じることがわかりつつある。
申請者らは、黄色ブドウ球菌のさまざまなrpoB 遺伝子の変異株を用いてppGpp を検出したところ、変異株においてppGpp の産生量が増加していることがわかった。さらにこのrpoB 遺伝子の変異により、菌の表現型が変わり、増殖速度の低下、自己融解酵素の活性化、薬剤耐性化が認められた。増殖速度の低下からsmall colony varoant (SCV) 形成能に関与する可能性があり、今後検討する。また、抗生物質βラクタム剤、バンコマイシン、リネゾリド、ダプトマイシンの耐性化も見られ、それと相関して細胞壁の肥厚、自己融解酵素の活性化が見られたので、これらの代謝に関わるメカニズムに関与している事が示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

rpoB の変異により、抗生物質βラクタム剤、バンコマイシン、リネゾリド、ダプトマイシンの耐性化も見られ、それと相関して細胞壁の肥厚、自己融解酵素の活性化が見られたので、これらの代謝に関わるメカニズムに関与している事が示唆された。もともとrpoB はリファンピシン耐性に関与していることが報告されていたため、新しい事象を見出した。また、バンコマイシン中間耐性黄色ブドウ球菌(VISA)のなかで、新規表現型のsVISA を見出した。これはさらにバンコマイシンの耐性度があがり、これらにもrpoBやrpoC の遺伝子も関与していたことがわかった。論文にて発表済み。

Strategy for Future Research Activity

作成した変異構築株の表現型を解析する。ppGpp 合成変化の認められた薬剤選択変異株について、変異個所を検出する。
1)薬剤耐性:MIC測定による薬剤感受性プロファイリング、薬剤耐性化に伴う細胞壁肥厚の電子顕微鏡観察、自己融解酵素活性の測
定。
2)病原性:バイオフィルム形成能、Small Colony Variant (SCV)形成能、宿主感染細胞への影響(殺菌力)、宿主への定着性の検討
。3
)アレイ解析、全ゲノム塩基配列の決定とSNP 解析。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

来年度よりMiseq による次世代シークエンサーの解析を行うため、その消耗品にあてる。学会活動が多くなるため。
次世代シークエンサー解析のための消耗品。および、国内、国際学会費、論文投稿費用。

  • Research Products

    (9 results)

All 2014 2013

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] 'Slow VISA' (sVISA), a novel phenotype of vancomycin resistance, obtained in vitro from hVISA strain Mu3.2014

    • Author(s)
      Michie Saito, Yuki Katayama, Tomomi Hishinuma, Akira Iwamoto, Yoshifumi Aiba, Kyoko Kuwahara-Arai, Longzhu Cui, Miki Matsuo, Nanae Aritaka and Keiichi Hiramatsu.
    • Journal Title

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy

      Volume: In press Pages: In press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutation of RNA polymerase β-subunit gene promotes hetero-to-homo conversion of ß-lactam resistance of MRSA.2013

    • Author(s)
      Yoshifumi Aiba, Yuki Katayama, Tomomi Hishinuma, Hiroko Murakami-Kuroda, Longzhu Cui, and Keiichi Hiramatsu.
    • Journal Title

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy

      Volume: 57 Pages: 4861-4871

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Staphylococcal Cassette Chromosome mec (SCCmec)Analysis of MRSA2013

    • Author(s)
      Teruyo Ito, Kyoko Kuwahara, Yuki Katayama, Yuki Uehara Xiao Han, Yoko Kondo, and Keiichi Hiramatsu
    • Journal Title

      Springer Science+Business Media, LLC

      Volume: Chapter 8 Pages: Chapter 8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic Basis for methicillin resistance in Staphylococcus aureus.2013

    • Author(s)
      Keiichi Hiramatsu, Teruyo Ito, Sae Tsubakishita, Takashi Sasaki, Fumihiko Takeuchi, Yuh Morimoto, Yuki Katayama, Miki Matsuo, Kyoko Kuwahara, Tomomi Hishinuma, and Tadashi Baba.
    • Journal Title

      Infection and chemotherapy

      Volume: 45 Pages: 117-136

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Beta-hemolysin promotes skin colonization of Stapylococcus aureus.2013

    • Author(s)
      5) Yuki Katayama, Tadashi Baba, Miwa Sekine, Minoru Fukuda, and Keiichi Hiramatsu
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 195 Pages: 1194-1203

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Characterization of A Novel Class of VISA Phenotype ‘slow VISA’ derived from hVISA Strain Mu2014

    • Author(s)
      Yuki Katayama Michie Saito, Tomomi Hishinuma, Akira Iwamoto and Keiichi Hiramatsu
    • Organizer
      日本細菌学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] A Single Amino-Acid Substitution of rpoB gene promotes conversion of hVISA-to-slow VISA in Mu32014

    • Author(s)
      Michie Saito, Yuki Katayama, Tomomi Hishinuma, Yoshifumi Aiba1Kyoko Kuwahara-Arai and Keiichi Hiramatsu
    • Organizer
      日本細菌学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] Greater cytotoxicity of S. epidermidis than co-colonizing S. aureus against human keratinocytes2014

    • Author(s)
      Miwa Sekine, Tadashi Baba, Yuki Katayama, Keiichi Hiramatsu
    • Organizer
      日本細菌学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] RNAポリメラーゼβサブユニット遺伝子の変異が黄色ブドウ球菌のβ-ラクタム剤耐性ヘテロ型からホモ型への変換を促進する2013

    • Author(s)
      相羽 由詞,片山 由紀,菱沼 知美,黒田(村上) 博子,崔 龍洙,平松 啓一
    • Organizer
      第96回日本細菌学会 関東支部総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20131031-20131101

URL: 

Published: 2015-05-28  

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