2013 Fiscal Year Annual Research Report
トランスクリプトーム解析によるエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構の解明
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24870002
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
松波 雅俊 北海道大学, 水産科学研究科(研究院), 博士研究員 (60632635)
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| Project Period (FY) |
2012-08-31 – 2014-03-31
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| Keywords | バイオインフォマティクス / 生態発生学 / 表現型可塑性 / 両生類 / 個体群生態学 / サンショウウオ / RNA-seq / 捕食者・被食者 |
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| Research Abstract |
本研究では、同一のゲノム情報をもつにも関わらず、環境の変化に応じて表現型を変化させる表現型可塑性についての解析をおこなった。北海道に生息する有尾両生類であるエゾサンショウウオ(Hynobius retardatus)の幼生は、被食者であるカエル幼生・捕食者であるヤゴの存在や個体群密度に応じて、明瞭な表現型可塑性を示す。本研究では、このエゾサンショウウオをモデルとして、表現型可塑性の分子基盤を解明することを目的とする。
昨年度は、次世代シークエンサーのテストランをおこなったので、来年度はこの結果をさらに拡張し、形態変化の要因となる候補遺伝子の同定を目指した。昨年度の時点では、トランスクリプトーム解析の繰り返しがなかったので、繰り返し実験をおこない、統計的に有意な発現量の差を持つ遺伝子を選別した。この実験を通して、可塑性の原因となる可能性がより高い候補遺伝子が明らかになった。ここまでの結果を取りまとめ、学会発表・学術論文の執筆をおこなった。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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