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2012 Fiscal Year Annual Research Report

高次クロマチン形成の構造生物学的解析

Research Project

Project/Area Number 24870027
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

越阪部 晃永  早稲田大学, 理工学術院, 助手 (70632107)

Project Period (FY) 2012-08-31 – 2014-03-31
Keywordsクロマチン / リンカーヒストン / ヌクレオソーム / クロマトソーム / 結晶構造解析
Research Abstract

本研究の目的は、リンカーヒストンタンパク質H1の高次クロマチン形成における機能を構造生物学的手法によって明らかにすることである。真核生物において、長大なゲノムDNAは核内のタンパク質群とクロマチンを形成し、核内に収納される。クロマチンは主にヒストンタンパク質(H1、H2A、H2B、H3、H4)とDNAからなり、各2分子のコアヒストン(H2A、H2B、H3、H4)によって形成されるヒストン8量体にDNAが巻き付いたヌクレオソームが基本単位となる。さらに、ヌクレオソーム間のリンカーDNAにリンカーヒストンH1が結合し、高次に折り畳まれたクロマチンを形成する。一方で、クロマチンはダイナミックに構造変換を起こすことが知られており、遺伝子発現の調節のみならず、DNAの複製、修復、組換えなど様々なDNA機能発現と密接に関与していることが示され、近年注目されている。このようなクロマチンのダイナミクスはリンカーヒストンが結合した高次のクロマチン構造形成によって成立すると考えられており、H1が結合したヌクレオソーム(クロマトソーム)の立体構造を明らかにすることは非常に重要である。そこで本研究では、クロマトソームのX線立体構造を明らかにするために、申請者らの生化学的解析によってクロマトソームの形成に適した長さにデザインしたDNAを用いて、ヌクレオソームの試験管内再構成を行った。再構成したヌクレオソームにリンカーヒストンシャペロンNap1を用いてH1を結合させ、クロマトソームの形成を行った。その後、分取用電気泳動装置プレップセルによってクロマトソームの高純度精製を行った。精製したクロマトソームを用いて、ハンギングドロップ蒸気拡散法によって結晶化を行った。その結果、クロマトソームの単結晶を得ることに成功した。

Current Status of Research Progress
Reason

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Nap1 regulates proper CENP-B binding to nucleosomes.2013

    • Author(s)
      Tachiwana H, Miya Y, Shono N, Ohzeki J, Osakabe A, Otake K, Larionov V, Earnshaw WC, Kimura H, Masumoto H, Kurumizaka H.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 41 Pages: 2869-2880

    • DOI

      10.1093/nar/gks1464

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vertebrate Spt2 is a novel nucleolar histone chaperone that assists in ribosomal DNA transcription.2013

    • Author(s)
      Osakabe A, Tachiwana H, Takaku M, Hori T, Obuse C, Kimura H, Fukagawa T, Kurumizaka H.
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 126 Pages: 1323-1332

    • DOI

      doi: 10.1242/jcs.112623

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Histone chaperone activity of Fanconi anemia proteins, FANCD2 and FANCI, is required for DNA crosslink repair.2012

    • Author(s)
      Sato K, Ishiai M, Toda K, Furukoshi S, Osakabe A, Tachiwana H, Takizawa Y, Kagawa W, Kitao H, Dohmae N, Obuse C, Kimura H, Takata M, Kurumizaka H.
    • Journal Title

      EMBO Journal

      Volume: 31 Pages: 3524-3536

    • DOI

      10.1038/emboj.2012.197

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新規ヒストン相互作用因子hsSpt2の核小体クロマチンダイナミクスにおける機能2012

    • Author(s)
      越阪部晃永、立和名博昭、高久誉大、堀哲也、小布施力史、木村宏、深川竜郎、胡桃坂仁志
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] リンカーヒストンH1サブタイプを含むクロマトソームの生化学的解析2012

    • Author(s)
      越阪部晃永、加藤大貴、高久誉大、町田晋一、林田亮太、立和名博昭、胡桃坂仁志
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Remarks] 胡桃坂研究室ホームページ

    • URL

      http://www.eb.waseda.ac.jp/kurumizaka/

URL: 

Published: 2014-07-24  

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