クライオ電子顕微鏡による生体分子モーターの立体構造と機能の解明

2016 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 25000013
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 難波 啓一 大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (30346142)
• Project Period (FY): 2013 – 2017
• Keywords: ナノマシン / 分子モーター / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子像解析 / 立体構造 / 光学顕微ナノ計測 / べん毛モーター / ブラウン・ラチェット

Outline of Annual Research Achievements

骨格筋アクトミオシンの構造からその高速運動の仕組みを解明した(Nature Communications 2017a)。細胞質ミオシンとの比較により、骨格筋ではアクチン繊維に強結合した際ATP結合ポケットがより大きく開くことでADPとPiが即座に解離し、ATP再結合によりミオシンがアクチン繊維から急速に解離する仕組みを捉えた。さらに弱結合構造モデルにおける結合ボンドの繊維軸に非対称分布から、ミオシン解離時にそのブラウン運動を一方向に偏らせて筋収縮力を発生するブラウニアン・ラチェット機構に手掛かりを得た。これら2つが骨格筋アクトミオシンモーターの高速性と高いエネルギー効率を実現している。骨格筋の細いフィラメントの構造解析でも高分解能達成の目処が立ち、世界初のトロポニンの全体像が見え始めている。相同性の高いべん毛ロッドとフックの構成タンパク質では、複合体構造中での分子の向きと相対配置のわずかな相違がドライブシャフトとして堅く真っ直ぐなロッドと自在継ぎ手として柔軟に曲がるフックの違いを実現していることをクライオ電顕で明らかにし(Nature Communications 2017b)、同定した原因変異をフックタンパク質に導入してそれを証明した(Scientific Reports 2017)。べん毛モーターの回転子では34回回転対称性のリング構造を原子レベルで明らかにしつつある。固定子でも回転子と相互作用してトルク発生に関与する細胞質ドメインの形状を明らかにした(Scientific Reports 2016)。べん毛モーターの機能解析では高速回転モーターのステップ動作解析により、固定子プロトンチャネル中のプロトン移動と共役した固定子の構造変化が固定子・回転子の結合解離を制御し、その非対称な弱結合構造が回転ブラウン運動を一方向に偏らせるブラウニアン・ラチェット機構を提案した。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

骨格筋アクトミオシンのクライオ電顕による構造から分子モーターとしての高速性と高いエネルギー効率の仕組みを解明し、Nature Communicationsに論文発表した。べん毛ロッドとフックのクライオ電顕による構造からは、相同性の高いタンパク質が機械的性質のまったく異なる超分子複合体を実現できるというタンパク質の興味深い性質を解明し、これもNature CommunicationsとScientific Reportsに論文発表した。骨格筋の細いフィラメントの構造も詳細に見え始めており、筋収縮制御の仕組みを解明できる日も間近であると期待される。べん毛モーターの回転子・固定子の構造解析も原子レベルに近づいており、光学顕微ナノ計測による高速回転モーターの機能解析から得たトルク発生のブラウニアン・ラチェット機構モデルを構造的に検証できる日も近いと思われる。

Strategy for Future Research Activity

当該科研費によるプロジェクトと並行して日本電子(株)と共同開発してきた、高度に自動化した新型クライオ電子顕微鏡が2016年夏に稼働し、その制御ソフトの開発にもおおよそ目処がたって、テスト試料の酵素複合体では2日間のデータ収集と数日の画像解析により3.2Å分解能を達成した。この電子顕微鏡に冷陰極電界放射型電子銃を装着した試作装置では、X線結晶構造解析に匹敵する1.0Åに近い分解能を達成できる可能性も見え始めている。今後もクライオ電子顕微鏡と単粒子像解析法において一層の工夫をし、この技術を一段と進歩させて到達分解能と計測解析の時間短縮を図ることで、構造生命科学の主たる手法としての汎用化を目指す。そして、こういった技術進歩の結果を活用することで、べん毛モーターの回転子や固定子、骨格筋のアクトミオシンモーターやトロポミオシン・トロポニンを含む細いフィラメントのCaイオンによる筋収縮制御系、その他さまざまな生体超分子の立体構造解析を一層高い分解能で行い、分子モーターのブラウニアン・ラチェット機構など、動作メカニズムの解明と高効率なエネルギー変換機構の一層明確な基盤の確立を目指す。

Research Products

• [Int'l Joint Research] オックスフォード大学/ブリストル大学/分子生物学研究所(英国)
  • Country Name: UNITED KINGDOM
  • Counterpart Institution: オックスフォード大学/ブリストル大学/分子生物学研究所
  • # of Other Institutions: 1
• [Int'l Joint Research] ユタ大学(米国)
  • Country Name: U.S.A.
  • Counterpart Institution: ユタ大学
• [Int'l Joint Research] フランス国立科学研究センター(フランス)
  • Country Name: FRANCE
  • Counterpart Institution: フランス国立科学研究センター
• [Int'l Joint Research] メキシコ国立自治大学(メキシコ)
  • Country Name: MEXICO
  • Counterpart Institution: メキシコ国立自治大学
• [Int'l Joint Research] 欧州バイオインフォマティクス研究所オーストラリア支部(オーストラリア)
  • Country Name: AUSTRALIA
  • Counterpart Institution: 欧州バイオインフォマティクス研究所オーストラリア支部
• [Int'l Joint Research]
  • # of Other Countries: 2
• [Journal Article] Structure of actomyosin rigour complex at 5.2Å resolution and insights into the ATPase cycle mechanism. (2017)
  • Author(s): Fujii, T. & Namba, K.
  • Journal Title: Nat. Commun. Volume: 8 Pages: 13969
  • DOI: 10.1038/ncomms13969
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Identical folds used for distinct mechanical functions of the bacterial flagellar rod and hook. (2017)
  • Author(s): Fujii, T., Kato, T., Hiraoka, K. D., Miyata, T., Minamino, T., Chevance, F., Hughes, K. & Namba, K.
  • Journal Title: Nat. Commun. Volume: 8 Pages: 14276
  • DOI: 10.1038/ncomms14276
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Bacterial flagella grow through an injection-diffusion mechanism. (2017)
  • Author(s): Renault, T. T., Abraham, A. O., Bergmiller, T., Parados, G., Rainville, S., Charpentier, E., Guet, C. C., Tu, Y., Namba, K., Keener, J. P., Minamino, T. & Erhardt, M.
  • Journal Title: eLife Volume: 6 Pages: e23136
  • DOI: 10.7554/eLife.23136
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Load- and polysaccharide-dependent activation of the Na+-type MotPS stator in the Bacillus subtilis flagellar motor. (2017)
  • Author(s): Terahara, N., Noguchi, Y., Nakamura, S., Kamiike, N., Ito, M., Namba, K., Minamino, T.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 7 Pages: 46081
  • DOI: 10.1038/srep46081
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Straight and rigid flagellar hook made by insertion of the FlgG specific sequence into FlgE. (2017)
  • Author(s): Hiraoka, K. D., Morimoto, Y. V., Inoue, Y., Fujii, T., Miyata, T., Makino, F., Minamino, T. & Namba, K.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 7 Pages: 46723
  • DOI: 10.1038/srep46723.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Bacterial intracellular sodium ion measurement using CoroNa Green. (2017)
  • Author(s): Morimoto, Y. V., Namba, K. & Minamino, T.
  • Journal Title: Bio-protocol Volume: 7 Pages: e2092
  • DOI: 10.21769/BioProtoc.2092
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Measurements of free-swimming speed of motile Salmonella cells in liquid media. (2017)
  • Author(s): Morimoto, Y. V., Namba, K. & Minamino, T.
  • Journal Title: Bio-protocol Volume: 7 Pages: e2093
  • DOI: 10.21769/BioProtoc.2093
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Periodicity in attachment organelle revealed by electron cryotomography suggests conformational changes in gliding mechanism of Mycoplasma pneumoniae. (2016)
  • Author(s): Kawamoto, A., Matsuo, L., Kato, T., Yamamoto, H., Namba, K., Miyata, M.
  • Journal Title: mBio Volume: 7 Issue: 2 Pages: e00243-16
  • DOI: 10.1128/mBio.00243-16.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Rearrangements of α-helical structures of FlgN chaperone control the binding affinity for its cognate substrates during flagellar type Ⅲ export. (2016)
  • Author(s): Kinoshita, M., Nakanishi, Y., Furukawa, Y., Namba, K., Imada, K. & Minamino, T.
  • Journal Title: Mol. Microbiol. Volume: 101 Pages: 656-670
  • DOI: 10.1111/mmi.13415
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structural flexibility of the periplasmic protein, FlgA, regulates flagellar P-ring assembly in Salmonella enterica. (2016)
  • Author(s): Matsunami, H., Yoon, Y.-H., Meshcheryakov, V. A., Namba, K. & Samatey, F. A.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 6 Pages: 27399
  • DOI: 10.10.8/srep27399
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Structural study of MPN387, an essential protein for gliding motility of a human pathogenic bacterium, Mycoplasma pneumonia. (2016)
  • Author(s): Kawakita, Y., Kinoshita, M., Furukawa, Y., Tulum, I., Tahara, Y. O., Katayama, E., Namba, K. & Miyata, M.
  • Journal Title: J. Bacteriol. Volume: 198 Pages: 2352-2359
  • DOI: 10.1128/JB.00160-16
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The terameric MotA complex as the core of the flagellar motor stator from hyperthermophilic bacterium. (2016)
  • Author(s): Takekawa, N., Terahara, N., Kato, T., Gohara, M., Mayanagi, K., Hijikata, A., Onoue, Y., Kojima, S., Shirai, T., Namba, K. & Homma, M.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 6 Pages: 31526
  • DOI: 10.1038/srep31526
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Structural stability of flagellin subunit affects the rate of flagellin export in the absence of FliS chaperone. (2016)
  • Author(s): Furukawa, Y., Inoue, Y., Sakaguchi, A., Mori, Y., Fukumura, T., Miyata, T., Namba, K. & Minamino, T.
  • Journal Title: Mol. Microbiol. Volume: 102 Pages: 405-416
  • DOI: 10.1111/mmi.13469
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The architecture of the cytoplasmic region of type Ⅲ secretion systems. (2016)
  • Author(s): Makino, F., Shen, D., Kajimura, N., Kawamoto, A., Pissaridou, P., Oswin, H., Pain M., Murillo, I., Namba, K. & Blocker, A. J.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 6 Pages: 33341
  • DOI: 10.1038/srep33341
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] High-resolution pH imaging of living bacterial cell to detect local pH differences. (2016)
  • Author(s): Morimoto, Y. V., Kami-ike, N., Miyata, T., Kawamoto, A., Kato, T., Namba, K. & Minamino, T.
  • Journal Title: mBio Volume: 7 Pages: e01911-16
  • DOI: 10.1128/mBio.01911-16.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] べん毛Ⅲ型輸送装置構成蛋白質FliJとⅢ型輸送シャペロンとの相互作用(Role of interactions of FliJ with FlgN and FliT chaperones in flagellar type Ⅲ protein export) (2017)
  • Author(s): 南野徹, 木下実紀, 森本雄祐, 難波啓一
  • Organizer: 第90回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター展示棟(宮城県仙台市)
  • Year and Date: 2017-03-19 – 2017-03-20
• [Presentation] 生体超分子モーターの高効率なエネルギー変換のメカニズム (2017)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: 日本物理学会第72回年次大会
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府豊中市)
  • Year and Date: 2017-03-18
  • Invited
• [Presentation] Insights into the mechanism of bacterial flagella motor rotation from the structure and dynamics. (2017)
  • Author(s): Namba, K.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-03
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Visualization of 11-and 34-fold rotational symmetries in the MS ring of the bacterial flagellum by electron cryomicroscopy. (2017)
  • Author(s): Kawamoto, A., Kaido, A., Kinoshita, M., Miyata, T., Minamino, T., Kato, T., Namba, K.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-02
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Elucidation of the directional switching mechanism of the bacterial flagellar motor by electron cryomicroscopy. (2017)
  • Author(s): Miyata, T., Kato, T., Kawamoto, A., Makino, F., Namba, K.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-02
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] The two distinct conformational states of the flagellar polyrod depending on ionic-strength revealed by CryoEM. (2017)
  • Author(s): Fujii, T., Yamada, Y., Namba, K.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-02
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Conformational rearrangement of F1hA is critical for flagellar type Ⅲ protein export. (2017)
  • Author(s): Inoue, Y., Kinoshita, M., Kitano, A., Imada, K., Namba, K., Minamino, T.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Role of intrinsically disordered region of the C-terminal domain of FliK in substrate specificity switching of the bacterial flagellar type Ⅲ export aparatus. (2017)
  • Author(s): Kinoshita, M., Aizawa, S., Namba, K., Minamino, T.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] In Vitro reconstitution of the protein export of the flagellar type Ⅲ secretion system by using the inverted membrane vesicles. (2017)
  • Author(s): Terashima, H., Kawamoto, A., Tatsumi, C., Namba, K., Minamino, T., Imada, K.
  • Organizer: OIST Workshop “Bacterial flagella, injectisomes & type Ⅲ secretion systems” joint with Annual Flagella Meeting
  • Place of Presentation: OIST(沖縄県国頭郡)
  • Year and Date: 2017-03-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] クライオ電顕で探る生体超分子モーターの高効率なエネルギー変換メカニズム (2017)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: 第23回「プロテイン・モール関西」情報交流セミナー
  • Place of Presentation: 千里ライフサイエンスセンター(大阪府豊中市)
  • Year and Date: 2017-02-24
  • Invited
• [Presentation] 生体超分子モーターの高効率なエネルギー変換のメカニズム (2017)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: N-Hybrid conference 2017
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ 新潟コンベンションセンター(新潟県新潟市)
  • Year and Date: 2017-01-21
  • Invited
• [Presentation] CryoEM structural analysis of muscle thin filament composed of actin filament, tropomyosin and troponin. (2017)
  • Author(s): Fujii, T., Yamada, Y., Namba, K.
  • Organizer: JSTさきがけーライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術-研究領域研究成果報告会第2期生(平成25年度採択)
  • Place of Presentation: 東京大学(東京都文京区)
  • Year and Date: 2017-01-20
• [Presentation] Structures and dynamics of macromolecular motors revealed by electron cryomicroscopy and optical nanophotometry. (2017)
  • Author(s): Namba, K.
  • Organizer: Department Seminar
  • Place of Presentation: Northeastern University, Boston, USA
  • Year and Date: 2017-01-10
  • Invited
• [Presentation] Structures and dynamics of TMV, actomyosin and bacterial flagellar filaments. (2017)
  • Author(s): Namba, K.
  • Organizer: Caspar Structural Biology Symposium
  • Place of Presentation: Florida State University, Florida, USA
  • Year and Date: 2017-01-08
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] F1-ATPaseから進化したマイコプラズマ滑走運動のモーター (2017)
  • Author(s): 豊永拓真, 加藤貴之, 川本晃大, 浜口祐, 田原悠平, 難波啓一, 宮田真人
  • Organizer: 2017年生体運動研究合同班会議
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
  • Year and Date: 2017-01-07
• [Presentation] クライオ電子顕微鏡で明らかにしたべん毛基部体の回転対称構造 (2017)
  • Author(s): 川本晃大, 海道綾菜, 木下実紀, 宮田知子, 南野徹, 加藤貴之, 難波啓一
  • Organizer: 2017年生体運動研究合同班会議
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
  • Year and Date: 2017-01-07
• [Presentation] 高圧力下にある磁性細菌MO-1の運動観察 (2017)
  • Author(s): 西山雅祥, Juanfang Ruan, 加藤貴之, 南野徹, Long-Fei Wu, 原田慶恵
  • Organizer: 2017年生体運動研究合同班会議
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
  • Year and Date: 2017-01-07
• [Presentation] 蛍光ラベルした細菌べん毛蛋白質のin vitro輸送測定系を用いた検出 (2016)
  • Author(s): 戸野侃, 寺島浩行, 巽千夏, 川本晃大, 田端和仁, 上野博史, 松田知己, 永井健治, 野地博行, 難波啓一, 南野徹, 今田勝巳
  • Organizer: 日本生体エネルギー研究会第42回討論会
  • Place of Presentation: 名古屋工業大学(愛知県名古屋市)
  • Year and Date: 2016-12-20
• [Presentation] 高速AFMイメージングにより明らかになったべん毛モーター固定子複合体MotPSのダイナミクス (2016)
  • Author(s): 寺原直矢, 古寺哲幸, 内橋貴之, 安藤敏夫, 難波啓一, 南野徹
  • Organizer: 日本生体エネルギー研究会第42回討論会
  • Place of Presentation: 名古屋工業大学(愛知県名古屋市)
  • Year and Date: 2016-12-19
• [Presentation] Structures and dynamics of actin and bacterial flagellar filaments. (2016)
  • Author(s): Namba, K.
  • Organizer: IGER International Symposium on “Now in actin study : Motor protein research reaching a new stage”
  • Place of Presentation: 名古屋大学(愛知県名古屋市)
  • Year and Date: 2016-12-12
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] クライオ電顕単粒子解析法による赤痢菌毒素分泌装置ニードルの高分解能構造解析 (2016)
  • Author(s): 藤井高志
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • Year and Date: 2016-11-30
  • Invited
• [Presentation] クライオ電子顕微鏡によるCENP-H複合体の構造解析 (2016)
  • Author(s): 牧野文信, マッキンリー カラ, 原昌稔, 堀哲也, 加藤貴之, チーズマン イアン, 難波啓一, 深川竜郎
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • Year and Date: 2016-11-30
• [Presentation] 最新低温電子顕微鏡“CryoARM”の性能. Performance of State-of-the-art Cryo EM, named “CryoARM” (2016)
  • Author(s): Kato, T., Hosogi, N., Kaneko, T., Ishikawa, I. & Namba, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] Visualization of 11-and 34-fold rotational symmetries in the MS ring of the bacterial flagellum by electron cryomicroscopy. (2016)
  • Author(s): Kawamoto, A., Kaido, A., Kinoshita, M., Miyata, T., Minamino, T., Kato, T. & Namba, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] 筋収縮制御メカニズムの解明を目指した細いフィラメントの立体構造解析. CryoEM structural analysis of muscle thin filament composed of actin filament, tropomyosin and troponin. (2016)
  • Author(s): Yamada, Y., Namba, K & Fujii, T.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] サルモネラ属菌FliFG融合変異型べん毛モーターの動態機能計測. Functional analysis of a FliFG deletion-fusion mutant flagellar motor. (2016)
  • Author(s): Sakai, T., Mori, K., Inoue, Y., Miyata, T., Terahara, N., Morimoto, Y., Kato, T., Namba, K. & Minamino, T.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] Functional analysis of slow-motile mutations in flagellar stator MotA/B of Salmonella. (2016)
  • Author(s): Shajaripourjaberi, S., Terahara, N. & Minamino, T.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] F1hAの構造変換がべん毛蛋白質輸送順序の決定に重要である. Conformational rearrangements of F1hA is critical for ordered protein export during flagellar assembly. (2016)
  • Author(s): Inoue, Y., Ogawa, Y., Kinoshita, M., Imada, K., Namba, K. & Minamino, T.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] 細菌べん毛Ⅲ型タンパク質輸送のin vitro再構築. In vitro reconstitution of the bacterial flagellar type Ⅲ protein export. (2016)
  • Author(s): Terashima, H., Kawamoto, A., Tatsumi, C., Namba, K., Minamino, T. & Imada, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] バクテリアべん毛輸送ゲート複合体の発現系の構築と精製. Expression and purification of the bacterial flagellar type Ⅲ export gate complex. (2016)
  • Author(s): Fukumura, T., Kinoshita, M., Namba, K. & Minamino, T.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] ロッド様に直線状で固く、野生型より長い変異型フックの金ナノ粒子標識によるべん毛モーターの高分解能回転計測. High resolution measurements of flagellar motor rotation by nanogold attached to a straight, solid hook mutant longer than the wild-type. (2016)
  • Author(s): Nakamura, S., Morimoto, Y. V., Minamino, T. & Namba, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-27
• [Presentation] ユビキチン化に伴う蛋白質の凝集体形成. Ubiquitylation-induced protein aggregation. (2016)
  • Author(s): Morimoto, D., Walinda, E., Fukada, H., Sugase, K., Hoshino, M., Fujii, T., Namba, K., Komatsu, M., Tanaka, K. & Shirakawa, M.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-26
• [Presentation] 赤痢菌ニードル複合体の極低温電子顕微鏡による構造解析. Structural analysis of needle complex from shigella flexneri by cryo clectron microscopy. (2016)
  • Author(s): Kajimura, N., Kato, T., Blocker, A. J. & Namba, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-26
• [Presentation] 反転膜小胞を用いたべん毛軸構造タンパク質よ輸送順序の解析. Secretion order of the Class-Ⅱ flagellar axial proteins analyzed by inverted membrane vesicles(IMV). (2016)
  • Author(s): Matsumoto, Y., Tatsumi, C., Terashima, H., Minamino, T. & Imada, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-26
• [Presentation] 細菌べん毛モーターの回転方向変換制御機構の解明. Elucidation of the directional switching mechanism of the bacterial flagellar motor by electron cryomicroscopy. (2016)
  • Author(s): Miyata, T., Kato, T., Kawamoto, A. & Namba, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-26
• [Presentation] マウス繊毛細胞におけるDpcdの機能解析. Role of Dpcd in motile cilia of meice. (2016)
  • Author(s): Tamegai, M., Kikumoto, M., Kinoshita, M., Kawamoto, A., Namba, K., Hamada, H., Imada, K., Narita, A. & Shinohara, K.
  • Organizer: 第54回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2016-11-26
• [Presentation] クライオ電子顕微鏡で探る生体分子モーターの構造と機能 (2016)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: 理研シンポジウム「クライオ電子顕微鏡が拓く未来-構造生物学研究のパラダイムシフト-」
  • Place of Presentation: 理化学研究所横浜キャンパス(神奈川県横浜市)
  • Year and Date: 2016-11-08
  • Invited
• [Presentation] Direct observation of ring formation of the C-terminal cytoplasmic domain of a flagellar type Ⅲ export gate protein FlhA by high-speed atomic force microscopy. (2016)
  • Author(s): Minamino, T., Terahara, N., Inoue, Y., Kodera, N., Ando, T. & Namba, K.
  • Organizer: 4th Kanazawa Bio-AFM Workshop 2016
  • Place of Presentation: KKR ホテル金沢(石川県金沢市)
  • Year and Date: 2016-10-05
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 生体超分子モーターの高効率なエネルギー変換のメカニズム (2016)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: 東大教養部学部特別講義付録公開セミナー
  • Place of Presentation: 東京大学(東京都文京区)
  • Year and Date: 2016-09-21
  • Invited
• [Presentation] クライオ電子顕微鏡で生体超分子の動作メカニズムを探る. Studying the mechanisms of macromolecular assemblies by electron cryomicroscopy. (2016)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: Advanced Seminar Series on Microbiology and Immunology
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • Year and Date: 2016-07-15
  • Invited
• [Presentation] 生体超分子モーターの高効率なエネルギー変換メカニズム (2016)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: 応用物理学セミナー
  • Place of Presentation: 東北大学(宮城県仙台市)
  • Year and Date: 2016-07-07
  • Invited
• [Presentation] Structures and functions of macromolecular motor assemblies. (2016)
  • Author(s): Namba, K.
  • Organizer: 2016 Kuo Symposium on 3D Cryo-EM Molecular Imaging
  • Place of Presentation: Beiijing Gubei Water Town Hotel, Beijing, China
  • Year and Date: 2016-06-27
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Methodologies that Drive the Field Forward. (2016)
  • Author(s): Namba, K.
  • Organizer: GRC on 3DEM
  • Place of Presentation: The Chinese University of Hong Kong, Hon Kong, China
  • Year and Date: 2016-06-20
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] High resolutions structural analysis of the 100S ribosome. (2016)
  • Author(s): Kato, T., Miyata, T., Ueta, M., Wada, A., Wada, C. & Namba, K.
  • Organizer: GRC on 3DEM
  • Place of Presentation: The Chinese University of Hong Kong, Hon Kong, China
  • Year and Date: 2016-06-19 – 2016-06-24
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 生命科学におけるクライオ電子顕微鏡の役割とポテンシャル (2016)
  • Author(s): 難波啓一
  • Organizer: 大阪大学蛋白質研究所「マルチスケール構造生物学(日本電子)」寄附研究部門開設記念セミナー
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府吹田市)
  • Year and Date: 2016-06-17
  • Invited
• [Presentation] 高速AFMによるべん毛モーター固定子複合体MotPSの動的構造解析 (2016)
  • Author(s): 寺原直矢, 古寺哲幸, 内橋貴之, 安藤敏夫, 難波啓一, 南野徹
  • Organizer: 第四回宮田新学術領域班会議
  • Place of Presentation: 長崎大学(長崎県長崎市)
  • Year and Date: 2016-06-09
• [Presentation] 蛋白質輸送体の中に存在する、回転分子モーターによく似た複合体. Protein translocator resembling the FI-rotary motor. (2016)
  • Author(s): 寺島浩行, 川元晃大, 巽千夏, 難波啓一, 南野徹, 今田勝巳
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
  • Year and Date: 2016-06-09
• [Presentation] 筋収縮制御メカニズムの解明を目指した骨格筋の細いフィラメントの構造解析. GryoEM structural analysis of muscle thin filament composed of actin filament, tropomyosin and troponin. (2016)
  • Author(s): 山田有里佳, 難波啓一, 藤井高志
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
  • Year and Date: 2016-06-09
• [Presentation] べん毛基部体の回転対称性の謎に迫る (2016)
  • Author(s): 川本晃大, 宮田知子, 加藤貴之, 南野徹, 難波啓一
  • Organizer: 第四回宮田新学術領域班会議
  • Place of Presentation: 長崎大学(長崎県長崎市)
  • Year and Date: 2016-06-08
• [Presentation] ユビキチン化に伴う基礎蛋白質の構造不安定化とアミロイド様繊維形成. ubiquitylation-driven folding destabilization of substrate proteins and amyloid-like fibril formation of polyubiquitin chains. (2016)
  • Author(s): 森本大智, Erik Walinda, 深田はるみ, 菅瀬謙治, 星野大, 藤井高志, 難波啓一, 小松雅昭, 田中啓二, 白川昌宏
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
  • Year and Date: 2016-06-07
• [Presentation] クライオ電顕単粒子解析法による赤痢菌タイプⅢ型輸送装置ニードル繊維の2.7Å分解能での構造解析.2.7Å structure of the type 3 secretion needle by CryoEM. (2016)
  • Author(s): 藤井高志, 山田有里佳, 難波啓一
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
  • Year and Date: 2016-06-07
  • Invited
• [Presentation] サルモネラFliFG融合変異型べん毛モーターの動態機能計測 (2016)
  • Author(s): 酒井智史, 森広一郎, 宮田知子, 井上由美, 寺原直矢, 森本雄祐, 加藤貴之, 難波啓一, 南野徹
  • Organizer: 第13回21世紀大腸菌研究会
  • Place of Presentation: グリーンピア南阿蘇(熊本県阿蘇郡)
  • Year and Date: 2016-06-02
• [Presentation] バクテリアべん毛フックの長さ制御におけるFlhAとFliH/FliI複合体の役割. (2016)
  • Author(s): 井上由美, 木下実紀, 難波啓一, 南野徹.
  • Organizer: 第13回21世紀大腸菌研究会
  • Place of Presentation: グリーンピア南阿蘇(熊本県阿蘇郡)
  • Year and Date: 2016-06-02
• [Presentation] バクテリアべん毛フック長制御蛋白質FliKの部位特異的in vivo光架橋実験 (2016)
  • Author(s): 木下実紀, 難波啓一, 南野徹
  • Organizer: 第13回21世紀大腸菌研究会
  • Place of Presentation: グリーンピア南阿蘇(熊本県阿蘇郡)
  • Year and Date: 2016-06-02
• [Remarks] プロトニックナノマシン研究室<難波教授>
  • URL: http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/result/