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2015 Fiscal Year Annual Research Report

哺乳類概日振動体の構成的な理解

Research Project

Project/Area Number 25221004
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

上田 泰己  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (20373277)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 洲崎 悦生  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (10444803)
大出 晃士  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40612122)
田井中 一貴  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (80506113)
Project Period (FY) 2013-05-31 – 2018-03-31
Keywords概日振動 / リン酸化 / 温度補償性 / 自律発振機構 / 変異マウス作製
Outline of Annual Research Achievements

平成28年度の研究に於いて、明確な進展が得られたこととして、本研究の2つの柱である温度補償性の理解、周期長制御の理解に密接な関係を見出したことが挙げられる。すなわち、昨年度までに見出していたリン酸化産物と酵素(CKIδ)の安定的な複合体結合能が、試験管内での温度非依存的なリン酸化反応速度の担保だけでなく、概日周期長制御にも重要であることが明らかとなった。
上記リン酸化産物結合を阻害するようなCKIδ変異や、低分子化合物は、リン酸化産物結合による酵素活性の拮抗的阻害を抑制し、CKIδ活性を賦活化、さらに概日周期長を短縮することが見出された。これらの結果は、リン酸化産物結合機構が、実際の概日時計機構においても重要な役割を果たしていることを強く示唆する。特に、本研究の3つ目の柱である、個体レベルでの分子機構の確認を達成するために、リン酸化産物結合が減弱した変異CKIδを発現するマウスの概日行動周期長が顕著に短縮することを確認することができた点を強調したい。これらの結果は、in vitroでのリン酸化反応速度制御の徹底的な理解によって、個体全体の生理活性リズムを制御するための知見を得ることができる好例を提示している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

1. 温度補償性:温度非依存性のタンパク質リン酸化反応の理解と設計
CKIδ/ε によるリン酸化反応速度が温度に依存しないという、常識に反する現象に対して、3年間の研究によって、具体的な動作原理(温度依存的にリン酸化産物と酵素の結合が安定化される)を提唱し、さらに低分子化合物および、酵素変異体を用いて、動作原理を検証することが出来た。従って、我々は温度非依存性のリン酸化反応の深い「理解」を得た。さらに、酵素変異体解析から、温度依存的なリン酸化産物との結合に重要な酵素ドメインを決定しており、「設計」へ向けて研究を展開している。
2. 自律発振機構:概日振動体発振・周期長制御機構の理解と設計
周期長を短縮する低分子化合物候補については、上記の温度補償性の理解に基づき、すでにATAを得た。また、タンパク質についてもCKIδおよびCRY1について、顕著な周期長短縮効果を示す領域をアミノ酸残基レベルで同定している。これらの結果は、タンパク質構造に基づく予測・変異導入を行っており、周期長を制御するタンパク質の設計を部分的に達成している。 これらの結果は同時に、CKIδやCRY1がリン酸化を駆動力とする振動子を構成する有力な候補であることを裏付けている。
3. 個体レベルでの概日振動体動作原理の検証
100%ES細胞由来マウス作製技術を運用し、実際にこの技術を用いて、CKIδやCRY1の個体レベルでの機能解析を進めている。さらにノックアウト作成技術や、個体の行動・睡眠覚醒リズム解析の新規手法を開発した。これらの手法は、開発のみならず、実際に研究グループの中でコンスタントに使用しており、1. や 2. で得られた知見の個体レベルでの検証を進めている。当初の目標通り、計画通りの進行である。

Strategy for Future Research Activity

現在得られている、動作モデル「温度依存的なリン酸化産物結合による温度補償性機構」をさらに多角的に検証する。現在、細胞内でのPer2安定性にもとづいて得られた、R178, K224それぞれのアミノ酸残基の変異CKIδを用いて、リン酸化産物結合と温度非依存性リン酸化の関係を検証する。K224変異によって、リン酸化産物結合活性が失われることを(検証済)に加えてR178変異による結合活性の有無、さらに、これらの変異タンパク質を精製し、in vitroのリン酸化アッセイによって、リン酸化反応の温度依存性を直接的に測定する。TTBK1を対象とした、異なるタンパク質への温度非依存的リン酸化進行機能の付与を引き続き行い、温度補償機構の「設計」を行う。
さらに、これらの変異CKIδを導入した際に概日時計振動周期長の温度補償性が崩れるかを検証する。変異CKIδ導入マウス(作成済)から培養細胞(MEF)や視交叉上核スライスを調整し、これらの細胞や組織を異なる温度で培養することで、概日振動を概日時計プロモーター下流で発現するLuciferase レポーター(MEF)や電気活動(SCNスライス)によって測定することで、周期長の温度依存性を測定する。

  • Research Products

    (34 results)

All 2016 2015

All Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (23 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 22 results)

  • [Journal Article] Involvement of Ca2+-dependent hyperpolarization in sleep duration in mammals2016

    • Author(s)
      Fumiya Tatsuki, Genshiro A. Sunagawa, Shoi Shi, Etsuo A. Susaki, Hiroko Yukinaga, Dimitri Perrin, Kenta Sumiyama, Maki Ukai-Tadenuma, Hiroshi Fujishima, Rei-ichiro Ohno, Daisuke Tone, Koji L. Ode, Katsuhiko Matsumoto, Hiroki R. Ueda
    • Journal Title

      Neuron

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.neuron.2016.02.032

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Whole-body and Whole-Organ Clearing and Imaging Techniques with Single-Cell Resolution: Toward Organism-Level Systems Biology in Mammals2016

    • Author(s)
      Etsuo A. Susaki, Hiroki R. Ueda
    • Journal Title

      Cell Chemical Biology

      Volume: 23 Pages: 137-157

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2015.11.009

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Mammalian Reverse Genetics without Crossing Reveals Nr3a as a Short-Sleeper Gene2016

    • Author(s)
      Genshiro A. Sunagawa, Kenta Sumiyama, Maki Ukai-Tadenuma, Dimitri Perrin, Hiroshi Fujishima, Hideki Ukai, Osamu Nishimura, Shoi Shi, Rei-ichiro Ohno, Ryohei Narumi, Yoshihiro Shimizu, Daisuke Tone, Koji L. Ode, Shigehiro Kuraku, Hiroki R. Ueda
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 14 Pages: 662-677

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2015.12.052

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 個体レベルのシステム生物学2016

    • Author(s)
      張千惠, 洲﨑悦生, 上田泰己
    • Journal Title

      臨床整形外科

      Volume: 51 Pages: 180-183

  • [Journal Article] Advanced CUBIC protocols for whole-brain and whole-body clearing and imaging2015

    • Author(s)
      Etsuo A. Susaki, Kazuki Tainaka, Dimitri Perrin, Hiroko Yukinaga, Akihiro Kuno, Hiroki R. Ueda
    • Journal Title

      Nature protocols

      Volume: 10 Pages: 1709-1727

    • DOI

      10.1038/nprot.2015.085

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Seeing the forest and trees: whole-body and whole-brain imaging for circadian biology2015

    • Author(s)
      Koji L. Ode, Hiroki R. Ueda
    • Journal Title

      Diabetes, Obesity and Metabolism

      Volume: 51 Pages: 47-54

    • DOI

      10.1111/dom.12511.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] マウス全脳・全身を透明化し1細胞解像度で観察する新技術を開発2015

    • Author(s)
      久野朗広, 洲崎悦生, 田井中一貴, 上田泰己
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 53 Pages: 737-740

  • [Journal Article] 脳の見える化―構造編 細胞を見る 脳の透明化と構造情報処理2015

    • Author(s)
      史蕭逸, 洲崎悦生, 上田泰己
    • Journal Title

      Clin Neurosci

      Volume: 33 Pages: 639-642

  • [Journal Article] 1細胞解像度個体全身三次元イメージング2015

    • Author(s)
      久保田晋平, 田井中一貴, 上田泰己
    • Journal Title

      細胞工学

      Volume: 34 Pages: 272-282

  • [Journal Article] CUBICを用いた全身三次元病理解析2015

    • Author(s)
      須山孟, 田井中一貴, 上田泰己
    • Journal Title

      心臓

      Volume: 47 Pages: 227-284

  • [Journal Article] 脳を透明にする2015

    • Author(s)
      岸野文昭, 洲崎悦生, 上田泰己
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 55 Pages: 145-147

  • [Presentation] 全身全細胞解析技術による「個体レベルのシステム生物学」の進展2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      日本薬学会第136回年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-29
    • Invited
  • [Presentation] 全身全細胞解析技術による「個体レベルのシステム生物学」の進展2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      第93回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-22
    • Invited
  • [Presentation] 全身全細胞解析技術による「個体レベルのシステム生物学」の進展2016

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      第89回日本薬理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-09
    • Invited
  • [Presentation] 体内の「時間」の理解にむけて -全身透明化の先に見えるもの-2016

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      第30回日本がん看護学会学術集会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉県千葉市美浜区)
    • Year and Date
      2016-02-20
    • Invited
  • [Presentation] 全身・全脳透明化の先に見えてくるもの ~生命の『時間』の謎の解明に向けて~2016

    • Author(s)
      Hiroki R. Ueda
    • Organizer
      West BIOS 2016
    • Place of Presentation
      San Francisco (USA)
    • Year and Date
      2016-02-13 – 2016-02-21
    • Invited
  • [Presentation] Towards Organisms-level Systems Biology2015

    • Author(s)
      Hiroki R. Ueda
    • Organizer
      Pacifichem2015
    • Place of Presentation
      Hawaii (USA)
    • Year and Date
      2015-12-14 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 外部光環境の内部表現機構としての概日時計システム2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] The post-translational landscape of mammalian circadian clock; an MS-based analysis of CRY1 and beyond2015

    • Author(s)
      大出晃士
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] CUBIC: whole-organ, whole-body imaging with single-cell resolution using chemical cocktails2015

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] CUBICによる全身全細胞の網羅的観察2015

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場・ポートピアホテル(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] 全身・全脳透明化の先に見えるもの ―個体レベルの「時間」の理解に向けて―2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      脳心血管抗加齢研究会2015
    • Place of Presentation
      秋葉原UDX(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2015-11-29
    • Invited
  • [Presentation] 全脳・全身透明化から見えてくるもの -個体システムの合成生物学に向けてー2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      細胞を創る研究会8.0
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2015-11-12 – 2015-11-13
    • Invited
  • [Presentation] Towards Organisms-level Systems Biology at Single-cell Resolution2015

    • Author(s)
      Hiroki R. Ueda
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia Conferences
    • Place of Presentation
      Suzhou (USA)
    • Year and Date
      2015-10-26 – 2015-10-30
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Whole-body and whole-brain imaging with single-cell resolution by CUBIC2015

    • Author(s)
      Hiroki R. Ueda
    • Organizer
      2015 Society for Neuroscience
    • Place of Presentation
      Chicago (USA)
    • Year and Date
      2015-10-16 – 2015-10-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 個体レベルの「時間」の理解に向けて ―全身・全脳透明化の先に見えるもの―2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-15
    • Invited
  • [Presentation] Towards System-level Understanding of Mammalian Circadian Clocks2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      Asian Forum on Chronobiology in 2015
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-09-06 – 2015-09-07
    • Invited
  • [Presentation] Mammalian cryptochrome 1 regulates circadian period through its co-factor pocket2015

    • Author(s)
      Koji L. Ode
    • Organizer
      XIV EBRS and IV WCC
    • Place of Presentation
      Manchester (UK)
    • Year and Date
      2015-08-02 – 2015-08-06
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 全身・全脳透明化の先に見えるもの ―個体レベルのシステム生物学の実現に向けて―2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      第47回日本動脈硬化学会総会・学術集会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2015-07-08 – 2015-07-09
    • Invited
  • [Presentation] CUBIC: Whole-organ, whole-body imaging with single-cell resolution using hydrophilic chemical cocktails2015

    • Author(s)
      Kazuki Tainaka
    • Organizer
      International Conference on Systems Biology of Human Disease 2015
    • Place of Presentation
      Heidelberg (German)
    • Year and Date
      2015-07-06 – 2015-07-08
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 全身全細胞を観察対象とする3次元組織イメージング・解析技術CUBIC2015

    • Author(s)
      洲崎悦生
    • Organizer
      第67回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • Year and Date
      2015-07-01
    • Invited
  • [Presentation] 全身・全脳透明化の先に見えるもの ―個体レベルのシステム生物学の実現に向けて―2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      第56回日本心身医学会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • Year and Date
      2015-06-26
    • Invited
  • [Presentation] 個体レベルのシステム生物学の実現に向けて2015

    • Author(s)
      上田泰己
    • Organizer
      第88回日本内分泌学会学術総会
    • Place of Presentation
      ホテルニューオータニ東京(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2015-04-24
    • Invited
  • [Presentation] Systems biology of circadian clocks2015

    • Author(s)
      Hiroki R. Ueda
    • Organizer
      16th IGIS Symposium
    • Place of Presentation
      Nice (France)
    • Year and Date
      2015-04-09 – 2015-04-12
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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