2015 Fiscal Year Annual Research Report
ステム構造を必要としない高感度リニアプローブの創成
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25248037
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
浅沼 浩之 名古屋大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (20282577)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
神谷 由紀子 名古屋大学, 学内共同利用施設等, 講師 (00527947)
樫田 啓 名古屋大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (30452189)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | ペリレン / 蛍光プローブ / リニアプローブ / アントラキノン / pBR３２２ / インベーダー / PNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成27年度はリニアプローブとPNAとの併用によるDNA二重鎖へのストランド・インベージョンによる蛍光標識を検討した。前年度、ストランドインベーダーとして機能するリニアプローブには、エチニルペリレン（蛍光色素）とアントラキノン（消光色素）が有効であることを見出した。そこでアントラキノンおよびエチニルペリレンを天然のヌクレオチド2残基ごとに導入し、アントラキノンとエチニルペリレンの間に天然のヌクレオチド３残基導入したリニアプローブを設計した。このリニアプローブはターゲットDNA非存在下では強くクエンチされていたため、ほとんど発光しなかった。また相補的なPNAとはほとんど二重鎖を形成せず、そのためPNAが共存してもエチニルペリレンはからの発光は一本鎖の場合と同様ほとんど観察されなかった。それに対してターゲットDNA存在下では安定に二重鎖を形成した上、エチニルペリレンのインターカレートに基づく強い発光が観察された。この結果よりリニアプローブとPNAの組み合わせはストランド・インベーダーの条件を満たすことが分かった。そこでプラスミドpBR322の一部の配列をターゲットにしたリニアプローブとPNAを設計し、50merの合成DNA二重鎖を使用してインベージョンが起きるか試したところ、ターゲット配列が末端にある場合には40℃でインキュベーションすることで容易にインベージョンが起きることを見出した。インベージョンに伴い蛍光増強も観察され、二重鎖が蛍光ラベルできることも確認した。ターゲット配列が中央にある場合はPCRと同様のヒートショックをかけることで容易にインベージョンが起きることも明らかにした。インベージョンは500merあるいは300merのPCR産物でも実現できた。従来のpcPNAの場合と異なり、100mMという通常の塩濃度でもリニアプローブとPNAの組み合わせではインベージョンを実現できた。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(65 results)
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[Journal Article] Faint electric treatment-induced rapid endosomal escape for efficient delivery of functional macromolecules into the cytoplasm2016
Author(s)
Hasan, M., Nishimoto, A., Ohgita, T., Hama, S., Kashida, H., Asanuma, H., Kogure, K.
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Journal Title
J. Control Release
Volume: ?
Pages: ?
Peer Reviewed
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[Presentation] 非常識”な非環状人工核酸2015
Author(s)
浅沼浩之
Organizer
第１回秩序化分子システム 仙台ワークショップ
Place of Presentation
ホテルニュー水戸屋、仙台
Year and Date
2015-07-11 – 2015-07-12
Invited
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[Presentation] Tracing the “fate” of siRNA2015
Author(s)
Yukiko Kamiya, Anna Ito, and Hiroyuki Asanuma
Organizer
The 3rd China-Japan Symposium on Nanomedicine
Place of Presentation
Beijing
Year and Date
2015-06-19 – 2015-06-20
Int'l Joint Research / Invited
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