2013 Fiscal Year Annual Research Report
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25251042
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| Research Institution | University of the Ryukyus |
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Principal Investigator |
石田 肇 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (70145225)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
木村 亮介 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (00453712)
村山 貞之 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60239548)
山口 徹太郎 昭和大学, 歯学部, 准教授 (40384193)
鈴木 宏正 東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (40187761)
道川 隆士 大阪大学, 学内共同利用施設等, 助教 (60435683)
斎藤 成也 国立遺伝学研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 教授 (30192587)
弦本 敏行 長崎大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (60304937)
深瀬 均 北海道大学, 医学(系)研究科(研究院), その他 (00582115)
荻原 直道 慶應義塾大学, 理工学部, 准教授 (70324605)
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| Project Period (FY) |
2013-10-21 – 2016-03-31
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| Keywords | 解剖学 / ゲノム / 医用画像 / 形状解析 / 関連解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
琉球大学医学部附属病院にて、CTならびにPET-CT画像を２８４症例取得し、その内、２１４例については唾液試料を収集した。昭和大学歯学部附属病院では、側面頭部エックス線規格写真と検体（唾液）を有する５００症例の収集を完了した。これとは別に歯・顎顔面用コーンビームCTデータと検体（唾液）を有する１００人の収集を完了した。長崎大学医学部では献体、８８体のご遺体からCT画像の取得を終えている。現在、これらの画像データを本研究目的で利用できるよう、同倫理委員会での審議を予定している。
研究手法としては、東京大学を中心に、ヒト頭部のMRI画像から，咽喉部のポリゴン形状を自動的に抽出する手法を開発した。提案手法は，咽喉部の自動抽出と抽出結果を用いた部分ポリゴン化からなる。咽喉部の自動抽出では，明確な境界が存在しない空洞部から咽頭部分を自動的に抽出するアルゴリズムを開発した。
また、鼻腔形態の生態地理学的意義を探るため、人骨標本を用いた鼻腔形態の集団間比較を行った。まずは、近現代の本州と沖縄の人々の頭骨標本を用いて、比較を行った。その結果、本州の人々は、沖縄の人々よりも、鼻腔が、相対的に高く狭いことがわかった。日本列島人の多様性を詳細に調べるため、すでにDNAサンプルの提供を受けた島根県出雲地方出身者２１名の全ゲノムSNPタイピングをおこなった。それらの新データと既存データについて、主成分分析などを行なった。その結果、地理的には朝鮮半島に近いが、むしろ東京周辺の日本列島人のほうが韓国人・中国人に近いことがわかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
医用画像データがすでに、８８４例収集でき、さらに、解剖体から８８画像が集まっていて、当初想定した５００例を上回っている。しかし、羽地歯科口腔外科医院でのデータ収集が不調に終わったことにより、１０００例には達しなかった。研究手法としては、既存のソフトで解析を進めながら、東京大学を中心として、新しいソフトが開発され、軟部組織のポリゴン抽出が成功し、今後の応用に期待できる。また、別の形態解析やベースとなるゲノム解析も進んでいる。
しかし、PET-CTでは、スライスが２ミリであり、頭蓋形態小変異の確認が出来にくいことが分かった。
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| Strategy for Future Research Activity |
琉球大学医学部ならびに昭和大学歯学部にて、さらに症例を追加し、１０００検体の医用画像、遺伝子試料を収集する。羽地歯科口腔外科医院での収集が困難になったため、琉球大学医学部の歯科口腔外科のコンビームCT画像の取得に努め、さらに、症例を増やす。
既存のソフトで、形態解析を進める。また、組織の領域抽出法、特徴点取得の自動化、相同モデリングによる形状解析に着いて検討する。
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[Journal Article] Dysbiosis of salivary microbiota in inflammatory bowel disease and its association with oral immunological biomarkers.2014
Author(s)
Said HS, Suda W, Nakagome S, Chinen H, Oshima K, Kim S, Kimura R, Iraha A, Ishida H, Fujita J, Mano S, Morita H, Dohi T, Oota H, Hattori M.
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Journal Title
DNA Research
Volume: 21
Pages: 15-25
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genome-wide association study of degenerative bony changes of temporomandibular joint in East Asian populations2014
Author(s)
Yamaguchi T, Nakaoka H, Yamamoto K, Fujikawa T, Kim YI, Yano K, Haga S, Katayama K, Shibusawa T, Park SB, Maki K, Kimura R, Inoue I
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Journal Title
Oral Dis
Volume: 20
Pages: 409-15
DOI
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[Journal Article] A genome-wide association study of third molar agenesis in Japanese and Korean populations.2013
Author(s)
Haga S, Nakaoka H, Yamaguchi T, Yamamoto K, Kim YI, Samoto H, Ohno T, Katayama K, Ishida H, Park SB, Kimura R, Maki K, Inoue I.
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Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: 58
Pages: 799-803
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 理学療法と解剖学2013
Author(s)
石田 肇
Organizer
第１５回沖縄県理学療法学術大会基調講演
Place of Presentation
琉球リハビリテーション学院、金武
Year and Date
2013-11-10
Invited
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