ポリグルタミン病における長鎖ncRNA異常の解析

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 25253066
• Research Institution: Doshisha University
• Principal Investigator: 貫名 信行 同志社大学, 脳科学研究科, 教授 (10134595)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 宮崎 晴子 独立行政法人理化学研究所, 視床発生研究チーム, 研究員 (80525890)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: 非コードRNA / ポリグルタミン病 / 中型有棘神経細胞

Outline of Annual Research Achievements

ポリグルタミン病モデルマウスの線条体有棘神経細胞(MSN)をセルソーターで分離し、その遺伝子発現をマイクロアレーによって解析した。長鎖nc(非コード）RNAを含む多くの遺伝子発現の異常を認めた。MSNの遺伝子発現についてはこれまで線条体全体の遺伝子発現解析では知られていない遺伝子が多く認められたため、その妥当性が、非コードRNAの発現異常の妥当性を保証するものと考え、コードRNAについてRT-PCR, Allen Brain Atlasのin situ等を用いて検討した。一方非コードRNAに関しては発現の高い遺伝子に関してはアレーの結果はRT-PCRによって確認できることが分かった。しかし、非コードRNAではその発現が低い遺伝子が多く、この確認がなかなか困難であった。ある程度発現するものに関してはRT-PCRにおいても確認されること、発現の低いものに関してはall or noneのパターンであることが分かってきた。in situに関してはAllen Brain Atlasにも報告されておらず、通常の方法での確認が困難になっている。現在一分子レベルの発現がみられるというin situの方法の導入を考えている。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

順天堂大学から同志社大学への施設の移動、及びメンバーの異動があって実験に関してブランクが生じた。さらに非コードRNAの発現量が少ないという問題点のため、線条体特異発現の検証が発現量の低いものに関して滞っている。

Strategy for Future Research Activity

一分子レベルの発現が検討できるin situの導入によって問題が解決できるばそれをまとめて全体として報告する。できない場合はRT-PCRレベルの検証で報告する。

Research Products

• [Journal Article] Splicing misregulation of SCN5A contributes to cardiac-conduction delay and heart arrhythmia in myotonic dystrophy. (2016)
  • Author(s): Freyermuth F, Rau F, Kokunai Y, Linke T, Sellier C, Nakamori M, Kino Y, Arandel L, Jollet A, Thibault C, Philipps M, Vicaire S, Jost B, Udd B, Day JW, Duboc D, Wahbi K, Matsumura T, Fujimura H, Mochizuki H, Deryckere F, Kimura T, Nukina N, et al.
  • Journal Title: Nat Commun Volume: 7 Pages: 11067
  • DOI: 10.1038/ncomms11067.
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Genome-wide analyses in neuronal cells reveal that upstream transcription factors regulate lysosomal gene expression. (2016)
  • Author(s): Yamanaka T, Tosaki A, Kurosawa M, Shimogori T, Hattori N, Nukina N.
  • Journal Title: FEBS J. Volume: 283 Pages: 1077-87
  • DOI: 10.1111/febs.13650.
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Serine 403-phosphorylated p62/SQSTM1 immunoreactivity in inclusions of neurodegenerative diseases. (2016)
  • Author(s): Kurosawa M, Matsumoto G, Sumikura H, Hatsuta H, Murayama S, Sakurai T, Shimogori T, Hattori N, Nukina N.
  • Journal Title: Neurosci Res Volume: 103 Pages: 64-70
  • DOI: 10.1016/j.neures.2015.08.002.
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] TBK1 controls autophagosomal engulfment of polyubiquitinated mitochondria through p62/SQSTM1 phosphorylation. (2015)
  • Author(s): Matsumoto G, Shimogori T, Hattori N, Nukina N.
  • Journal Title: Hum Mol Genet. Volume: 24 Pages: 4429-42
  • DOI: 10.1093/hmg/ddv179.
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] FUS/TLS deficiency causes behavioral and pathological abnormalities distinct from amyotrophic lateral sclerosis. (2015)
  • Author(s): Kino Y, Washizu C, Kurosawa M, Yamada M, Miyazaki H, Akagi T, Hashikawa T, Doi H, Takumi T, Hicks GG, Hattori N, Shimogori T, Nukina N.
  • Journal Title: Acta Neuropathol Commun Volume: 3 Pages: 24
  • DOI: 10.1186/s40478-015-0202-6.
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant