2015 Fiscal Year Annual Research Report
バーチャルメタボリズム：代謝システムの標準ダイナミックモデル開発
| Project/Area Number |
25280107
|
|---|
| Research Institution | Kyushu Institute of Technology |
|---|
Principal Investigator |
倉田 博之 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (90251371)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
|
| Keywords | システム生物学 / 合成生物学 / 代謝 / ネットワーク / 物質生産 / ダイナミクス / 数学モデル |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
解糖系、TCA回路、ペントースリン酸回路、補充経路のサブシステムから成る中央代謝システムに、酵素遺伝子発現調節ネットワークを統合して、世界最大規模の中央代謝モデルであるバーチャルメタボリズムを開発した。そのために、各サブシステムの最適化と全体システムの最適化を繰り返すサブ全体反復最適化法、定性的実験データを数値化して最適化のための目的関数を作成する新規方法を開発した。また、増殖速度を代謝流束の線形結合によって数学モデル化する技術を提案した。標準ダイナミックモデルの既存モデルに対する優位性を証明して、有用物質生産を目指して人工的遺伝子回路の設計を行った。ヒトの代謝モデルへの応用、増殖適応メカニズムの解明などに応用した。
|
| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Causes of Carryover |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
