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2013 Fiscal Year Annual Research Report

無細胞翻訳系を用いた膜タンパク質進化分子工学的手法の開発と応用

Research Project

Project/Area Number 25282239
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

松浦 友亮  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (50362653)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords進化分子工学 / 無細胞翻訳系 / 膜蛋白質
Research Abstract

<研究成果の内容・意義・重要性>
本研究では、in vitroで膜蛋白質をスクリーニング可能な技術Liposome display法を確立し、これを利用した膜蛋白質の実験室内機能進化を行うことを目的とする。Liposome display法には大きくわけて2つの方法、(1)FACS-base法と(2)panning-based法が考えられる。その違いは、膜タンパク質の機能評価を行う方法に依る。FACS-based法では、膜タンパク質の機能評価を蛍光セルソーター(FACS)により行うのに対して、panning-based法では、膜タンパク質が特定のリガンドに結合する能力を指標としてスクリーニングを行う。2013年度は、Pannig-based法の確立を目指した。
大腸菌由来多剤排出トランスポーターの1つであるEmrEをモデル膜タンパク質として用いた。EmrEのC末端にmyc-tag、FLAG-tagを融合させたEmrE-myc、EmrE-FLAGの2種類をそれぞれを表面に呈示するリポソームを調製し、その後、anti-myc抗体へ結合するリポソームを回収し、EmrE-myc遺伝子の回収率を調べたところ、EmrE-FLAGのそれよりも1000倍高いことがわかった。このように、目的の膜蛋白質遺伝子を特異的に選択できる条件を見出した。
2013年度のもう一つの目標は、リポソーム内膜蛋白質合成系へのトランスロコンの導入である。我々は、細胞サイズのリポソーム内で無細胞翻訳系を用いて膜蛋白質を合成し、これを効率よく膜挿入させるためにリポソーム内に膜蛋白質を膜へ輸送するシステムであるトランスロコンを導入することにも成功した。具体的には、大腸菌のsec輸送系をリポソーム内に導入したところ、EmrEの膜への呈示率が10倍向上した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Panning-base法の確立とトランスロコンの導入の2つを実施することを目指し、共に達成できた。よって、当初の予定通り達成できているため、順調に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

<2014年度>
Panning-based法については、抗体を用いたモデル選択実験が達成できたので、次にトランスポーターであるEmrEの基質の一つであるEtBrに対する結合能で特異的な選択が行えるのかを確認する。また、初年度の購入したリポソームの分析用のフローサイトメーターを用いてFACS-based法を確立する。
<2015年度>
2014年度までで構築した手法を用いて高機能EmrE変異体を創出する。liposome display法を用いてEmrEの高機能変異体を創成し、その配列・機能相関などからEmrEの基質認識メカニズムに関する新たな知見を得る。

  • Research Products

    (12 results)

All 2014 2013

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Kinetic model of double-stranded RNA formation during long RNA replication by Qbeta replicase.2013

    • Author(s)
      Usui, K., Ichihashi, N., Kazuta, Y., Matsuura, T. and Yomo, T.
    • Journal Title

      FEBS letters

      Volume: 587 Pages: 2565-2571

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.06.033

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vitro evolution of alpha-hemolysin using a liposome display.2013

    • Author(s)
      Fujii, S., Matsuura, T., Sunami, T., Kazuta, Y. and Yomo, T.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A

      Volume: 110 Pages: 16796-16801.

    • DOI

      10.1021/sb400094c

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Darwinian evolution in a translation-coupled RNA replication system within a cell-like compartment2013

    • Author(s)
      Ichihashi, N. Usui, K. Kazuta, Y. Sunami, T. Matsuura, T. Yomo, T.
    • Journal Title

      Nature communications

      Volume: 4 Pages: 2494

    • DOI

      10.1038/ncomms3494

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Chemistry of “Origins of life”2014

    • Author(s)
      松浦友亮
    • Organizer
      JFFos Symposium
    • Place of Presentation
      Metz,France
    • Year and Date
      20140124-20140124
    • Invited
  • [Presentation] In vitro evolution and selection of membrane proteins with liposome display technology2014

    • Author(s)
      松浦友亮
    • Organizer
      Korea-Japan Smart Biodesign Workshop: Technology exchange for green biotechnology
    • Place of Presentation
      Aobayama Memorial Hall, Tohoku University
    • Year and Date
      20140121-20140121
    • Invited
  • [Presentation] 無細胞系を用いたタンパク質エンジニアリングの新技術2014

    • Author(s)
      松浦友亮
    • Organizer
      2013年度日本生物工学会技術セミナー
    • Place of Presentation
      神戸大学瀧川記念学術交流会館
    • Year and Date
      20140115-20140115
    • Invited
  • [Presentation] 無細胞タンパク質合成系を用いた構成的アプローチ2013

    • Author(s)
      松浦友亮
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      20131203-20131206
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質合成反応シミュレーターの構築2013

    • Author(s)
      松浦友亮
    • Organizer
      第8回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学
    • Year and Date
      20131021-20131022
  • [Presentation] リポソーム内部合成膜タンパク質はベシクルサイズ依存的に膜挿入される2013

    • Author(s)
      曽我遥 加藤泰彦 渡邉肇 松浦友亮
    • Organizer
      第8回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学
    • Year and Date
      20131021-20131022
  • [Presentation] リポソーム内無細胞膜タンパク質合成系ヘのトランスロコンの導入2013

    • Author(s)
      太田直樹 渡邉肇 松浦友亮
    • Organizer
      第8回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学
    • Year and Date
      20131021-20131022
  • [Presentation] In vitro evolution of alpha-hemolysin using a liposome display2013

    • Author(s)
      松浦友亮
    • Organizer
      第22回酵素工学国際会議
    • Place of Presentation
      富山国際会議場
    • Year and Date
      20130922-20130926
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 改良型α-ヘモリシンおよひそれを用いたナノポアシーケンサ2013

    • Inventor(s)
      四方哲也、松浦友亮、數田恭章、藤井聡志
    • Industrial Property Rights Holder
      四方哲也、松浦友亮、數田恭章、藤井聡志
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2013-157799
    • Filing Date
      2013-10-10

URL: 

Published: 2015-05-28  

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