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2013 Fiscal Year Annual Research Report

アンカー型中分子によるたんぱく質間相互作用の制御と検出

Research Project

Project/Area Number 25288076
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

大神田 淳子  京都大学, 化学研究所, 准教授 (50233052)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsたんぱく質間相互作用 / 阻害剤 / 化学プローブ / 中分子 / K-Rasたんぱく質 / フシコクシン / 14-3-3たんぱく質
Research Abstract

本研究では、中分子アンカー型たんぱく質間相互作用阻害剤ならびに検出プローブの創出を目的とする。これらの中分子サイズの合成化合物は、K-Ras変異由来難治性がんに対する薬剤開発ならびに細胞内信号伝達系の制御を司る14-3-3たんぱく質間相互作用の化学的検出法の開発に寄与すると期待する。
目標を達成するために、本年度は、まずグアニジル基含有表面モジュールと活性ポケットモジュールを改変したアンカー型化合物を種々合成し、in vitro FTase/GGTase阻害活性試験による構造活性相関を検討した。その結果、複数のグアニジル基を導入した没食子酸誘導体モジュールを、CVIMテトラペプチドの伸長配座を模倣したペプチドミメティクスに連結した化合物が、膀胱がん細胞T24中のFTase活性をnMオーダーで阻害することを見出した。このように、グアニジル基とペプチドミメティクスの応用に基づいた分子改変を通じて、中分子化合物の細胞膜透過性を顕著に改善することに成功した。
一方、PPI検出プローブの創出に向け、まず半合成的化学変換によるアミノ基含有フシコクシンJ誘導体を合成した。遺伝子改変型FC-J生産株Phomopsis amygdaliの大量培養液からFC-Jをグラムスケールで得たのち、これを出発原料として誘導体amino-FC-Jを多段階合成を経て合成した。amino-FC-Jのアミノ基にトシルエステルを含む反応性スペーサーを介して蛍光基を連結し、新規な蛍光プローブの合成に成功した。これらのプローブはリン酸化リガンド依存的に14-3-3たんぱく質を蛍光標識した。細胞実験の結果、12位水酸基を持つamino-FC-Jは無活性であった。従って、amino-FC-Jを基盤とする化学プローブは、観察対象の生細胞に影響を及ぼさない「inertな化学プローブ」となる可能性が示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

構造活性相関研究を集中的に行った成果として、当初の目的であったnMレベルの阻害活性を持つ細胞透過性中分子PPI阻害剤を得るに至った点は、今後の研究を推進する上で重要である。ただし内在性K-Rasたんぱく質を対象とした評価がまだ達成されておらず、今後の検討課題である。14-3-3プローブ開発に関しては、新規な12位水酸基含有天然物誘導体を調製できたこと、および両者を蛍光プローブへ誘導して14-3-3蛍光標識反応を確認できたので、概ね当該年度の目標は達成できた。

Strategy for Future Research Activity

PPI阻害剤に関しては、ペプチドミメティクス部位の構造改変に着手し、より阻害活性の高い化合物の探索を行う。同時にK-Ras過剰発現細胞による細胞活性評価を共同研究によって行う。従来法のWestern blotでバンドの分離の検出が困難と判断された場合には、MS/MSによるK-Rasプレニル化の検出を検討する。
PPIプローブに関しては、14-3-3蛍光標識を指標とするmode1, mode3, mode4リン酸化ペプチドライブラリスクリーニングを実施し、3者会合体形成能に及ぼす12位水酸基の効果を網羅的に検討する。また、生細胞中の14-3-3蛍光標識化を検討する。並行して蛍光偏光滴定実験で会合定数を算出し、熱力学的な考察も進める。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

研究補助1名の雇用に関し9月採用となったため。
研究補助1名を12か月間雇用するための人件費に補填する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2013 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Module assembly for designing multivalent mid-sized inhibitors of protein-protein interactions2013

    • Author(s)
      Junko Ohkanda
    • Journal Title

      The Chemical Record

      Volume: 13 Pages: 561-575

    • DOI

      10.1002/tcr.201300026

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemical ligation of epoxide-containing fusicoccins and peptide fragments guided by 14-3-3 protein2013

    • Author(s)
      Toshio Maki, Akie Kawamura, Nobuo Kato, Junko Ohkanda
    • Journal Title

      Mol. BioSyst.

      Volume: 9 Pages: 940-943

    • DOI

      10.1039/C3MB90009F

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptidomimetic modification improves cell permeation of bivalent farnesyltransferase inhibitors2013

    • Author(s)
      Shinnosuke Machida, Mai Tsubamoto, Nobuo Kato, Kazuo Harada, Junko Ohkanda
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 21 Pages: 4004-4010

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.09.061

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] たんぱく質間相互作用(PPIs)を制御・検出する中分子を創る

    • Author(s)
      大神田淳子
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Invited
  • [Presentation] Rational design of fusicoccin-based fluorescent probes for detecting 14-3-3 complexes

    • Author(s)
      Junko Ohkanda
    • Organizer
      2014 Queenstown Molecular Biology Meetings in Shanghai;Drug Discovery and International Collaboration
    • Place of Presentation
      Shanghai
    • Invited
  • [Presentation] Module Assembly for Designing Mid-sized Inhibitors of Protein-protein Interactions: Bivalent Dual Inhibitors of Protein Prenyltransferases for Selective Inactivation of K-Ras

    • Author(s)
      Junko Ohkanda
    • Organizer
      The 3nd Asian Chemical Biology Initiative
    • Place of Presentation
      Manila
    • Invited
  • [Presentation] たんぱく質間相互作用(PPIs)を標的とする薬剤設計への挑戦~モジュールアセンブリによるPPIs阻害ならびに検出~

    • Author(s)
      大神田淳子
    • Organizer
      奈良先端科学技術大学院大学光ナノサイエンス特別講義
    • Place of Presentation
      奈良先端科学技術大学院大学
    • Invited
  • [Presentation] 中分子によるたんぱく質間相互作用(PPIs)の阻害と検出~K-Ras変異がんに対する薬剤開発ならびに14-3-3標識剤への展開~

    • Author(s)
      大神田淳子
    • Organizer
      日本薬学会九州支部主催特別講演会
    • Place of Presentation
      長崎
    • Invited
  • [Remarks] The Ohkanda Research Group

    • URL

      http://www.scl.kyoto-u.ac.jp/~johkanda/

URL: 

Published: 2015-05-28  

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