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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Establishment of chemical RNA editing method for genetic code resoration therapy

Research Project

Project/Area Number 25290072
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

塚原 俊文  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (60207339)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 仁  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (00447690) [Withdrawn]
藤本 健造  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (90293894)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Keywords疾患治療 / 点変異 / RNA editing / 脱アミノ化 / 蛍光タンパク質 / 遺伝コード修復 / RFLP / 恒常的発言細胞株
Outline of Annual Research Achievements

RNA editing機構を化学的に模倣して部位特異的に塩基を脱アミノ化することで遺伝コードを修復することを目指して研究を行った。GFP 遺伝子の199T>C 変異体は青色蛍光を発しBFP となることに注目して、BFP-mRNAに化学的に199C>U 変異を誘起してGFP とする方法を研究した。In vitro転写によって調製したBFP-mRNAとCVU含有ODNを混合後、光照射による結合、熱処理による脱アミノ化、別波長の光照射による解離による部位特異的脱アミノ化処理を行った。光化学的RNA editingは、RT-PCR-RFLPで確認しただけでなく、in vitro翻訳したタンパク質の蛍光を確認して実証した。GFPに特異的な蛍光が検出され、mRNAの一部がGFP-mRNAとなっていることが確認された。また、光化学的RNA editingした当該mRNAの全長をシークエンスし、他の箇所に変異が生じていないことを確認した。この結果は光化学的RNA editing法が疾患治療法として適用可能であることを示唆している。
本研究によって、全長のBFP-mRNAを標的分子とした光化学的RNA editing(部位特異的脱アミノ化)が可能であること、さらには光化学的RNA editingを受けたmRNAから機能を有するタンパク質が合成されることが明らかとなった。これは、人為的なRNA editingによって、変異したmRNAを人為的に修復できること、即ち本法が疾患治療法として適用可能であることを示している。また、より効率的な脱アミノ化を誘起するODNデザインについても検討した。ODNはBFP-mRNAに相補的な配列と、CVU官能基およびヘアピン構造で構成されるが、BFPをターゲットとした場合は、相補的配列長が14塩基、ヘアピン長が9塩基のODNが最も効率的であることも判明した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Neuron-specific splicing: a review2017

    • Author(s)
      Nor Hakimah Ab Hakim, Burhanuddin Yeop Majlis, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara,
    • Journal Title

      Bioscience Trends

      Volume: 11 Pages: 16-22

    • DOI

      10.5582/bst.2016.01169

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] C-to-U Editing and Site-Directed RNA Editing for Correction of Genetic Mutations.2017

    • Author(s)
      Vu Thi Luyen and Toshifumi Tsukahara
    • Journal Title

      Bioscience Trends, inpress.

      Volume: 11 Pages: in press

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chemical RNA Editing for Genetic Restoration: The Relationship between the Structure and Deamination Efficiency of Carboxyvinyldeoxyuridine Oligodeoxynucleotides2016

    • Author(s)
      Vu Thi Luyen, Nguyen Thi Kim Thanh, Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara
    • Journal Title

      Chem Biol Drug Des

      Volume: 87 Pages: 583-593

    • DOI

      10.1111/cbdd.12693.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Endogenous Multiple Exon Skipping and Back-Splicing at the DMD Mutation Hotspot2016

    • Author(s)
      Hitoshi Suzuki, Yoshitsugu Aoki, Toshiki Kameyama, Takashi Saito, Satoru Masuda, Jun Tanihata, Tetsuya Nagata, Akila Mayeda, Shin’ichi Takeda, Toshifumi Tsukahara
    • Journal Title

      Int. J. Mol. Sci.

      Volume: 17 Pages: 1722

    • DOI

      10.3390/ijms17101722

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Expression Analysis of Fox-2 Alternative Isoforms during Neuronal Differentiation2016

    • Author(s)
      Nor Hakimah Ab Hakim, Burhanuddin Yeop Majlis, Hitoshi Suzuki and Toshifumi Tsukahara
    • Journal Title

      Int’l Journal of Advances in Chemical Engg., & Biological Sciences

      Volume: 3 Pages: 102-104

    • DOI

      10.15242/IJACEBS.IAE0516407

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Study of adenosine deaminase acting on RNA (ADAR) isoforms towards genetic code restoration2016

    • Author(s)
      Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara
    • Organizer
      アメリカ細胞生物学会年会
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ(アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2016-12-03 – 2016-12-07
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Site-directed RNA editing approach by MS2 and adenosine deaminase acting on RNA (ADAR)2016

    • Author(s)
      Md Thoufic Anam Azad, Hitoshi Suzuki, Toshifumi Tsukahara
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02

URL: 

Published: 2018-01-16  

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