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2013 Fiscal Year Annual Research Report

RNA結合タンパク質がファインチューニングする翻訳開始制御機構

Research Project

Project/Area Number 25291007
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

藤原 俊伸  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (80362804)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 泊 幸秀  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90447368)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords翻訳 / RNA
Research Abstract

luciferase mRNAにmiRNAの標的配列を付加したレポーターRNAを用いて、miRNAの存在下および非存在下でのレポーターの発現をHEK293細胞の抽出液を用いたin vitro翻訳系で検証することに成功した。そこで、このin vitro解析系を利用し、RNA結合蛋白質HuDによる翻訳活性化とmiRNAによる翻訳抑制との関係を検証した。その結果、HUDはmiRNAによる翻訳抑制に対し阻害的に働くことを明らかにした。次にどの過程・因子がmiRNAマシナリーの標的となっているかという命題を解決するため、mRNA pull-down法によりmiRNAマシナリーに関わる因子を同定することを試みた。その結果、ある翻訳開始因子が重要な役割を果たすことを明らかに、これらの内容は現在Molecular Cell誌に投稿中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当所、因子の同定には困難が予想されたが、in vitro系の改良により飛躍的に研究が進んだ。また、HuDを恒常的に発現するHeLA細胞の構築により、これまでtransfectionに頼っていたHuDタンパク質の発現を安定的に制御でき、miRNAによる翻訳抑制との拮抗を詳細に検証できた。

Strategy for Future Research Activity

現在、in vitro系で行っている実験を in cellで検証する系を構築し、細胞内で行われている素過程であることを証明する。また、同定したmicroRNAによる翻訳抑制に重要な役割を果たす因子のknock out細胞を構築し、これらの現象を詳細に解析する。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

藤原は平成25年4月1日に名古屋市立大学薬学部の教授として新たに赴任した。平成25年度は研究室の立ち上げを行い、何が必要で何が必要でないかを吟味した。そして、翌平成26年度より体制を整え研究を実施するために当該研究費で研究員を雇用することを考え次年度へと繰り越した。
次年度使用額が生じた理由にも記したが、平成26年度より研究を推進する目的で当該研究費により研究員を名古屋市立大学薬学部特任助教として雇用する。

  • Research Products

    (16 results)

All 2014 2013

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Structural insights into the recruitment of SMRT by the corepressor SHARP under phosphorylative regulation.2014

    • Author(s)
      Mikami S, Kanaba T., Takizawa N., Kobayshi A., Maesaki R., Fujiwara T., Ito Y., and Mishima M.
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 22 Pages: 35-46

    • DOI

      10.1016/j.str.2013.10.007.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Microbial fluorescence sensing for human neurotensin receptor type 1 using Gα-engineered yeast cells.2014

    • Author(s)
      Ishii J, Oda A, Togawa S, Fukao A, Fujiwara T, Ogino C, Kondo A*.
    • Journal Title

      Anal Biochem

      Volume: 446 Pages: 37-43

    • DOI

      10.1016/j.ab.2013.10.016.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The essential role for the RNA triphosphatase Cet1p in nuclear import of the mRNA capping enzyme Cet1p-Ceg1p complex of Saccharomyces cerevisiae.2013

    • Author(s)
      Takizawa N, Fujiwara T, Yamasaki M, Saito A, Fukao A, Nomoto A, Mizumoto K.
    • Journal Title

      PLoS One.

      Volume: 8 Pages: e78000

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0078000.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeting cancer cell-specific RNA interference by siRNA delivery using a complex carrier of affibody-displaying bio-nanocapsules and liposomes.2013

    • Author(s)
      Nishimura Y, Mieda H, Ishii J, Ogino C, Fujiwara T, Kondo A.
    • Journal Title

      J Nanobiotechnology.

      Volume: 11 Pages: 19

    • DOI

      10.1186/1477-3155-11-19.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of the second RRM domain of Nrd1, a fission yeast MAPK target RNA binding protein, and implication for its RNA recognition and regulation.2013

    • Author(s)
      Kobayashi A, Kanaba T, Satoh R, Fujiwara T, Ito Y, Sugiura R, Mishima M.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 437 Pages: 12-17

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2013.06.008.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Staphylococcal superantigen-like protein 10 (SSL10) inhibits blood coagulation by binding to prothrombin and factor Xa via their γ-carboxyglutamic acid (Gla) domain.2013

    • Author(s)
      Itoh S, Yokoyama R, Kamoshida G, Fujiwara T, Okada H, Takii T, Tsuji T, Fujii S, Hashizume H, Onozaki K.
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 288 Pages: 21569-21580

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.451419

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Analyses of cell type specific translation from the IRES mRNA derived from two different Poliovirus strains2014

    • Author(s)
      貞廣暁利、藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] Translational regulation by HuD through the interaction with eIF32014

    • Author(s)
      高辻良文、藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] Effect of eIF4B phosphorylation by active Akt1 recruited into cap binding complex by HuD on translation2014

    • Author(s)
      矢野雄暉、藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] 矢野雄暉、藤原俊伸 Functional relationship between HuD and Paip2 in differentiation of PC12 cells2014

    • Author(s)
      大塚衆志、藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] Dissecting roles of Paip1 in HuD mediated translation activation2014

    • Author(s)
      青山智彦、藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] Novel cell free translation system using human cultured cell line2014

    • Author(s)
      深尾亜喜良、藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] High-throughput screening approach combining siRNA reverse-transfection and reporter mRNA transfection2014

    • Author(s)
      藤原俊伸
    • Organizer
      第 8 回 「 長野ミーティング :生物資源の有効利用を目指して」
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      20140302-20140304
  • [Presentation] The RNA-binding protein HuD regulates cap-dependent translation by binding to the mRNA nuclear export receptor TAP/NXF12013

    • Author(s)
      Ryosuke Satoh, Akira Fukao, Akio Nomoto and Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] HuD accelerates cap-dependent translation through eIF4B phosphorylation by active Akt12013

    • Author(s)
      Yuki Yano, Akira Fukao and Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] The mechanism of translational control which targets a translation initiation complex2013

    • Author(s)
      Akira Fukao, Nahum Sonenberg, Christian Thoma and Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      2013 RiboClub Annual Meeting
    • Place of Presentation
      ケベック
    • Year and Date
      20130923-20130925

URL: 

Published: 2015-05-28  

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