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2015 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質膜透過・膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIaseの構造と機能

Research Project

Project/Area Number 25291009
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Keywordsタンパク質膜挿入 / 糖脂質酵素 / MPIase / CdsA / リン脂質生合成
Outline of Annual Research Achievements

膜タンパク質はその生合成に共役し多くの因子の協調的な作用により膜挿入する。我々はタンパク質膜挿入の再構成系を構築し、膜挿入に必須の因子MPIaseを同定した。MPIaseはその酵素的な作用にもかかわらず糖脂質であったことから、「糖脂質酵素(Glycolipoz
yme)」という概念を提唱した。MPIaseの構造を決定したところ、新規化合物であったため、生合成経路を予測し、関与する遺伝子を検索した。その結果、前年度までにcdsA遺伝子ynbB遺伝子を同定した。これらの遺伝子を欠失させるとMPIaseの発現量が激減し、さらに膜タンパク質や分泌タンパク質の前駆体が蓄積することを見出した。すなわち、in vitro実験系で同定したMPIaseはin vivでも同様の機能をもつことを明らかにした。しかし、CdsAは全てのリン脂質生合成前駆体であるCDP-DAG生合成酵素として知られている因子である。cdsA遺伝子は必須遺伝子であるが、リン脂質生合成は細胞にとって必須であるため、MPIaseが菌の生育に必須かどうかは結論できなかった。Tam41は酵母ミトコンドリアのタンパク質であり、CDP-DAG生合成活性をもつことが知られている。Tam41とCdsAには全く相同性がないため、Tam41にはMPIase生合成活性はないと考えた。cdsA、ynbB遺伝子破壊株にTam41を導入した株を構築し、その生育やタンパク質膜挿入反応、リン脂質生合成活性について調べた。その結果、Tam41を発現させることによりリン脂質生合成は正常になったが、MPIase生合成は阻害されたままであった。このとき、タンパク質膜挿入は阻害されたままであり、生育も回復しなかった。これらの結果から、MPIaseは菌の生育に必須であることが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

MPIaseの生合成第一段階の遺伝子を同定したのち、MPIaseが菌の生育やタンパク質膜挿入に必須であることを証明し、現在論文投稿中である。計画書に記した以上に進展していると言えるが、まだ論文が受理されていないので、[(2)おおむね順調に進展している。」と評価した。

Strategy for Future Research Activity

MPIase生合成第一段階の酵素の同定・機能解析がほぼ終了したため、第二段階以降の酵素の同定・機能解析を進める。さらに、MPIaseと膜タンパク質の相互作用について、表面プラズモン吸収やFRET分析により詳細に調べ、MPIase依存の膜挿入反応に関して分子機構を明らかにする。

Causes of Carryover

年度末に研究補助員雇用にかかる保険料率が変更になったため、繰越金が生じた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度研究の消耗品代に組み込み、変異体解析実験を増やす。

  • Research Products

    (20 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Ohio State University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Ohio State University
  • [Journal Article] Relationship between glycolipozyme MPIase and components comprising the protein transport machinery2015

    • Author(s)
      Endo, Y., Nishiyama, K.
    • Journal Title

      Med. Res. Arch.

      Volume: 2 Pages: 1-24

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] “糖脂質酵素(Glycolipozyme)”MPIaseの構造と作用機作2015

    • Author(s)
      西山賢一、島本啓子
    • Journal Title

      酵素工学

      Volume: 74 Pages: 14-18

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 糖脂質酵素MPIase に依存するタンパク質膜挿入反応は YidC により促進される2016

    • Author(s)
      志水優子、佐々木優、Ross Dalbey、西山賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [Presentation] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIaseの構造と機能2016

    • Author(s)
      西山 賢一
    • Organizer
      第1回デザイン生命工学研究会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-08 – 2016-03-08
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIaseのin vivoにおける機能解析2016

    • Author(s)
      沢里 克宏、佐藤 諒、西山 賢一
    • Organizer
      第1回デザイン生命工学研究会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-08 – 2016-03-08
  • [Presentation] MPIase (membrane protein integrase), a glycolipozyme involved in protein integration into and protein translocation across the cytoplasmic membrane of E. coli2015

    • Author(s)
      Ken-ichi Nishiyama, Michael Moser, Shoichi Kusumoto, Keiko Shimamoto
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of biosynthetic enzymes for MPIase, a glycolipozyme essential for membrane protein integration2015

    • Author(s)
      Ryo Sato, Keiko Shimamoto, Toshiyuki Yamaguchi, Michael Moser, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Glycolipozyme MPIase functions as membrane protein integrase in vivo2015

    • Author(s)
      Katsuhiro Sawasato, Michael Moser, Ryo Sato, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reconstitution of glycolipozyme MPIase-dependent protein integration into membrane2015

    • Author(s)
      Masaru Sasaki, Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of an MPIase homologue in plants that catalyses membrane protein integration2015

    • Author(s)
      Yuta Endo, Toshiyuki Yamaguchi, Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda, Keiko Shimamoto, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIaseの植物ホモログの精製2015

    • Author(s)
      遠藤 佑太、松林 英明、山口 敏幸、車 ゆうてつ、上田 卓也、島本 啓子、西山賢一
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質酵素MPIaseのin vivoにおける機能解析2015

    • Author(s)
      沢里 克宏、Michael Moser、佐藤 諒、田村 康、遠藤 斗志也、西山 賢一
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIase の生合成因子の同定2015

    • Author(s)
      佐藤 諒、澤里 克宏、山口 敏幸、Moser Michael、島本 啓子、西山 賢一
    • Organizer
      第10回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      理化学研究所(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-10-13 – 2015-10-14
  • [Presentation] 人工細胞開発のための機能的膜タンパク質試験管内合成システムの構築2015

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      「動的・多要素な生体分子ネットワークを理解するためのの基盤構築」研究発表会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2015-10-05 – 2015-10-06
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質MPIaseと標的タンパク質との相互作用2015

    • Author(s)
      佐々木優、Michael Moser、Maria Huber、西山賢一
    • Organizer
      「天然物ケミカルバイオロジー~分子標的と活性制御~」 第8回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2015-06-08 – 2015-06-09
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須な糖脂質酵素MPIaseの生合成経路の解明2015

    • Author(s)
      佐藤 諒、山口 敏幸、Moser Michael、島本 啓子、西山 賢一
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランド ホテル・京近江(滋賀県大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Presentation] 再構成によるタンパク質膜挿入における必須因子の決定2015

    • Author(s)
      佐々木優、松林英明、車ゆうてつ、上田卓也、西山賢一
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランド ホテル・京近江(滋賀県大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Presentation] 大腸菌タンパク質膜挿入因子MPIaseのin vivo における役割2015

    • Author(s)
      沢里克宏、Michael Moser、佐藤諒、田村康、遠藤斗志也、西山賢一
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランド ホテル・京近江(滋賀県大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Remarks] 西山研究室 研究内容

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/research.html

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-27  

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