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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Structure and function of glycolipozyme MPIase, involved in protein translocation across and integration into membranes

Research Project

Project/Area Number 25291009
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Keywordsタンパク質膜挿入糖 / 糖脂質酵素MPIase / MPIase / CdsA / YidC
Outline of Annual Research Achievements

我々は大腸菌におけるタンパク質膜挿入の再構成系を構築し、膜挿入反応に必須の因子MPIaseを同定した。MPIaseはその酵素的な作用にもかかわらず糖脂質であったことから、「糖脂質酵素(Glycolipozyme)」という概念を提唱している。MPIaseの生合成遺伝子を検索し、cdsA遺伝子を同定している。cdsA遺伝子を欠失させるとMPIaseの発現量が激減し、膜タンパク質の前駆体が蓄積することを見出した。すなわち、in vitro実験系で同定したMPIaseはin vivoでも同様の機能をもつことを明らかにした。しかし、CdsAは全てのリン脂質生合成前駆体であるCDP-DAG生合成酵素として知られている。Tam41は酵母ミトコンドリアのタンパク質であり、CDP-DAG生合成活性をもつがMPIase生合成活性はなかったため、MPIaseは菌の生育に必須であることが明らかとなった。
当初、MPIase生合成はUDP-GlcNAcからGlcNAcリン酸部分がフォスファチジン酸に転移する反応であると予測したが、糖供与体としてCDP-GlcNAcが利用されていることが判明した。
再構成系においては、MPIaseがYidCと機能的相互作用するという結果が得られた。F0F1-ATPaseのcサブユニット(F0-c)は、YidCに依存して膜挿入すると報告されている一方、自発的膜挿入が抑制されているリポソームにも膜挿入するという報告もある。F0-cは酸性リン脂質と相互作用するとプロテアーゼ耐性の構造を獲得し、この性質が膜挿入活性の評価を複雑で困難にしていることを明らかにした。この構造は界面活性剤存在下でも安定であることを突き止め、膜挿入活性と構造変化の区別を付けられるように工夫した。その結果、F0-cの膜挿入反応はMPIaseに依存し、YidCにより促進されることが明らかとなった。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (26 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (21 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Membrane insertion of F0 c subunit of F0F1 ATPase depends on glycolipozyme MPIase and is stimulated by YidC2017

    • Author(s)
      Nishikawa, H., Sasaki, M., Nishiyama, K.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 487 Pages: 477-482

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2017.04.095

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Novel translocation intermediate allows re-evaluation of roles of ATP, proton motive force and SecG at the late stage of preprotein translocation2016

    • Author(s)
      Nishiyama, K. and Tokuda, H.
    • Journal Title

      Gene. Cells

      Volume: 21 Pages: 1353-1364

    • DOI

      10.1111/gtc.12447

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する多機能性糖脂質MPIase2016

    • Author(s)
      西山賢一
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 88 Pages: 744-747

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2016.880744

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] F0F1-ATPase cサブユニット(F0-c)の膜挿入の再構成2017

    • Author(s)
      西川華子、佐々木優、西山賢一
    • Organizer
      デザイン生命工学研究会第2回大会
    • Place of Presentation
      神戸大学統合研究拠点(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2017-03-21 – 2017-03-21
  • [Presentation] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIase (Membrane Protein Integrase) の生物種間における普遍性の検証2017

    • Author(s)
      沢里克宏、飯村直紀、田村康、西山賢一
    • Organizer
      デザイン生命工学研究会第2回大会
    • Place of Presentation
      神戸大学統合研究拠点(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2017-03-21 – 2017-03-21
  • [Presentation] 大腸菌膜タンパク質の膜挿入機構解明に向けた糖脂質MPIase部分構造の合成2017

    • Author(s)
      藤川紘樹、西山賢一、島本啓子
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-18 – 2017-03-20
  • [Presentation] 化学合成標品を用いたタンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIaseの構造と機能の解析2017

    • Author(s)
      池田汐里、藤川紘樹、島本啓子、西山賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-18 – 2017-03-20
  • [Presentation] Ochrobactrum sp. AIU 033由来アルコール酸化酵素の高機能化2017

    • Author(s)
      松村健児、山田美和、西山賢一、下飯仁、礒部公安
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-18 – 2017-03-20
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIaseの低温センシングによる発現誘導機構2017

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      新学術領域研究「温度生物学」第3回領域会議
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県・岡崎市)
    • Year and Date
      2017-01-19 – 2017-01-20
  • [Presentation] 低温センシングによるタンパク質膜挿入・透過反応関与する糖脂質酵素 MPIase の発現誘導機構解明2017

    • Author(s)
      沢里克宏、鈴木苑実、西山賢一
    • Organizer
      第2回温度生物学若手の会
    • Place of Presentation
      ホテル東海園(愛知県・蒲郡市)
    • Year and Date
      2017-01-18 – 2017-01-19
  • [Presentation] タンパク質膜挿入反応に必須の糖脂質酵素MPIase(Membrane Protein Integrase)発現誘導機構の解析2017

    • Author(s)
      鈴木苑実、西山賢一
    • Organizer
      第2回温度生物学若手の会
    • Place of Presentation
      ホテル東海園(愛知県・蒲郡市)
    • Year and Date
      2017-01-18 – 2017-01-19
  • [Presentation] in vivo analysis of MPIase (Membrane Protein Integrase) involved in protein integration and translocation2016

    • Author(s)
      Katsuhiro Sawasato, Ryo Sato, Michael Moser, Yasushi Tamura, Tshiya Endo, and Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      Conference on Protein Secretion in Bacteria, Zing Conferences
    • Place of Presentation
      Florida (USA)
    • Year and Date
      2016-11-09 – 2016-11-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] F0F1-ATPase c サブユニット(F0-c)の膜挿入の再構成2016

    • Author(s)
      西川 華子、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIase 生合成に関する研究2016

    • Author(s)
      佐藤 諒、 澤里 克宏、 藤川 紘樹、山口 敏幸、 Moser Michael、 島本 啓子、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] 再構成系を用いたタンパク質膜挿入機構の解明2016

    • Author(s)
      佐々木 優、松林 英明、車 兪澈、上田 卓也、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] タンパク膜挿入反応・膜透過反応に関与する糖脂質MPIase (Membrane Protein Integrase) のin vivoにおける機能解析2016

    • Author(s)
      沢里 克宏、佐藤 諒、Michael Moser、田村 康、遠藤 斗志也、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] 生体膜における自発的タンパク質膜挿入抑制機構の解明2016

    • Author(s)
      中村 匠汰、斎藤 大明、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質酵素MPIase発現誘導機構の解析2016

    • Author(s)
      鈴木 苑実、沢里 克宏、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] 無細胞系を基盤とした人工細胞構築のための脂質合成代謝系の実装2016

    • Author(s)
      車 兪澈、藤見 麻衣、笠間 健嗣、松林 英明、上田 卓也、西山賢一
    • Organizer
      第11回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      ゆこたんの森(岩手県・雫石町)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-07
  • [Presentation] タンパク質膜挿入阻害による糖脂質酵素MPIase発現誘導機構の解析2016

    • Author(s)
      鈴木苑実、沢里克宏、西山賢一
    • Organizer
      第89回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] 低温センシングによるタンパク質膜挿入反応に必須な糖脂質酵素MPIase (Membrane Protein Integrase) の発現誘導機構の解析2016

    • Author(s)
      沢里克宏、鈴木苑実、西山賢一
    • Organizer
      平成28年度 新学術領域研究「温度生物学」第1回若手の会
    • Place of Presentation
      北海道大学薬学部(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-06-29 – 2016-06-30
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIaseの低温センシングによる発現誘導機構2016

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      平成28年度 文部科学省 新学術領域研究 「温度生物学」第2回領域会議
    • Place of Presentation
      札幌市教育文化会館(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-06-29
  • [Presentation] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIase (Membrane Protein Integrase) のin vivoにおける機能解析2016

    • Author(s)
      沢里克宏、Michael Moser、佐藤 諒、田村 康、遠藤斗志也、西山賢一
    • Organizer
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県・南阿蘇村)
    • Year and Date
      2016-06-02 – 2016-06-03
  • [Presentation] F0F1-ATPase c サブユニット(F0-c)の膜挿入機構の解明2016

    • Author(s)
      西川華子、西山賢一
    • Organizer
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      グリーンピア南阿蘇(熊本県・南阿蘇村)
    • Year and Date
      2016-06-02 – 2016-06-03
  • [Remarks] Welcome to Nishiyama Lab!

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

  • [Remarks] 研究室紹介 分子生物学研究室

    • URL

      http://www.agr.iwate-u.ac.jp/lab/%e5%88%86%e5%ad%90%e7%94%9f%e7%89%a9%e5%ad%a6%e7%a0%94%e7%a9%b6%e5%ae%a4/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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