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2014 Fiscal Year Annual Research Report

光合成による光エネルギー変換:光駆動電子移動の分子制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 25291033
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

野口 巧  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60241246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 千尋  神奈川県産業技術センター, 化学技術部, 専門研究員 (50233804)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords光合成 / 赤外分光法 / 電子移動 / 光化学系Ⅱ / 水分解
Outline of Annual Research Achievements

1.チロシンYZの水素結合構造とプロトン放出機構:光化学系Ⅱの水分解マンガンクラスターへの直接的電子供与体として働くチロシンYZについて、フーリエ変換赤外分光法(FTIR)と量子化学計算を用いてその水素結合構造を調べた。その結果、YZの光酸化によって近傍の水分子が移動し、水素結合ネットワークの再構築が起こることが明らかとなった。この結果から、水分解反応におけるYZを経由する新規なプロトン移動機構を提唱した。
2.マンガンクラスターと非ヘム鉄中心との長距離相互作用: FTIR電気化学計測法を用い、マンガンクラスターの除去が電子受容体として働く非ヘム鉄-キノン中心の構造および酸化還元電位に与える影響を調べた。その結果、非ヘム鉄の近傍に存在するアミノ酸残基への構造変化と+18 mVの酸化還元電位の変動が認められた。この結果によって、光化学系Ⅱにおける酸化側と還元側の間の長距離相互作用による電子移動制御機構の存在が明確に示された。
3.クロロフィルdを持つシアノバクテリアにおける電子受容体の構造:近赤外光を吸収するクロロフィルdを持つシアノバクテリアAcaryochloris marinaにおけるフェオフィチンおよび第一キノン電子受容体の分子相互作用をFTIR法を用いて調べた。その結果、これらの電子受容体はクロロフィルaを持つ通常のシアノバクテリアとは異なる水素結合相互作用を持つことが示された。A. marinaは、この相互作用変化によって酸化還元電位を上昇させ、通常よりも小さなエネルギーで光合成を行うことを可能にしていると考えられる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでの研究によって、光化学系ⅡにおけるYZやキノン、フェオフィチンなどの酸化還元コファクターについて、それらが関与する電子移動および水分解反応の制御機構が着実に明らかとなってきている。

Strategy for Future Research Activity

これまでの研究をさらに推進するため、まず、これまで実測例がない第二キノン電子受容体QBの酸化還元電位をFTIR電気化学計測によって測定する。さらに、QAとQB間の電子移動平衡のpH依存性を測定し、光化学系Ⅱにおける電子受容体側の制御機構を明らかにする。また、水の酸化を可能にするクロロフィル二量体P680の高い酸化還元電位の原因を明らかにするため、P680近傍のアミノ酸残基を改変した部位特異的変異体を作成し、FTIR法によってそのカチオン状態の電子状態を解析する。

Causes of Carryover

常に消耗品費を必要とする研究であるため、年度初めにも継続的に研究を遂行できるようにするため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

物品費は基本的に消耗品として用いる。また、不定期に起こる装置の修理に対応するため、その他の項目として100万円を計上している。旅費(60万円)は、数回の国内学会参加(本人、学生を含めて)のための交通費、宿泊費等に当てる。

  • Research Products

    (32 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (26 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Modified molecular interactions of the pheophytin and plastoquinone electron acceptors in photosystem II of chlorophyll d-containing Acaryochloris marina as revealed by FTIR spectroscopy2015

    • Author(s)
      Y. Sano, K. Endo, T. Tomo, T. Noguchi
    • Journal Title

      Photosynth. Res.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1007/s11120-014-0073-x

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Fourier transform infrared difference and time-resolved infrared detection of the electron and proton transfer dynamics in photosynthetic water oxidation2015

    • Author(s)
      T. Noguchi
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1847 Pages: 35-45

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2014.06.009

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Effects of extrinsic proteins on the protein conformation of the oxygen-evolving center in cyanobacterial photosystem II as revealed by Fourier transform infrared spectroscopy2015

    • Author(s)
      R. Nagao, T. Tomo, T. Noguchi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 54 Pages: 2022-2031

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b00053

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Fourier transform infrared detection of a polarizable proton trapped between photooxidized tyrosine YZ and a coupled histidine in photosystem II: Relevance to the proton transfer mechanism of water oxidation2014

    • Author(s)
      S. Nakamura, R. Nagao, R. Takahashi, T. Noguchi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 53 Pages: 3131-3144

    • DOI

      10.1021/bi500237y

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Long-range interaction between the Mn4CaO5 cluster and the non-heme iron center in photosystem II as revealed by FTIR spectroelectrochemistry2014

    • Author(s)
      Y. Kato, T. Noguchi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 53 Pages: 4914-4923

    • DOI

      10.1021/bi500549b

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 光合成光化学系II第二キノンQBの酸化還元電位測定 −FTIR分光電気化学法によるアプローチ2015

    • Author(s)
      加藤祐樹、長尾遼、野口巧
    • Organizer
      日本化学会年会
    • Place of Presentation
      日本大学
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] FTIR and QM/MM study of the proton transfer mechanism via redox active tyrosine YZ in photosystem II2015

    • Author(s)
      Shin Nakamura, Ryo Nagao, Takumi Noguchi
    • Organizer
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2015
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-27
  • [Presentation] Development of an artificial photosynthetic nano-device utilizing photosynthetic proteins and metal nanoparticles for light-driven water splitting2015

    • Author(s)
      Kazuki Tahara, Kousuke Kawahara, Ryo Nagao, Yuki Kato, Takumi Noguchi
    • Organizer
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2015
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-27
  • [Presentation] Proton-coupled electron transfer in the S2-to-S3 transition of photosynthetic water oxidation as revealed by time-resolved infrared spectroscopy2015

    • Author(s)
      Hiroki Sakamoto, Ryo Nagao, Takumi Noguchi
    • Organizer
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2015
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-27
  • [Presentation] Modified electronic structure of the chlorophyll dimer P680 by site-directed mutation of a nearby amino acid residue in photosystem II2015

    • Author(s)
      Motoki Yamaguchi, Ryo Nagao, Takumi Noguchi
    • Organizer
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2015
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-27
  • [Presentation] 光合成における光化学系II第二キノン電子受容体QBの酸化還元電位計測2015

    • Author(s)
      加藤祐樹、長尾遼、野口巧
    • Organizer
      日本物理学会
    • Place of Presentation
      早稲田大学
    • Year and Date
      2015-03-21 – 2015-03-24
  • [Presentation] FTIR分光電気化学法による光化学系II第二キノンQBの酸化還元電位計測 −QA・QB間の電位制御と光防御機構2015

    • Author(s)
      加藤祐樹、長尾遼、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] PsbPのN末端ペプチド断片が光化学系IIの水分解酸素発生反応に及ぼす影響2015

    • Author(s)
      西村太志、長尾遼、冨田めぐみ、野口巧、佐藤文彦、伊福健太郎
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 光合成水分解反応におけるチロシンYZを経由する新規なプロトン移動機構2015

    • Author(s)
      中村伸、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 光化学系IIタンパク質への部位特異的変異導入による水分解反応機構の解析2015

    • Author(s)
      長尾遼、中西華代、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 光化学系IIにおける第二キノン電子受容体QBの首振り機構による電子・プロトン伝達2015

    • Author(s)
      嘉手川千央、加藤祐樹、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 光合成水分解反応におけるチロシンYZを経由するプロトン移動機構:FTIR法及び量子化学計算による解析2015

    • Author(s)
      中村伸、長尾遼、野口巧
    • Organizer
      生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2015-03-10
  • [Presentation] 光合成による水分解・酸素発生反応の赤外分光解析2014

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      日本分光学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      分子研
    • Year and Date
      2014-12-24
    • Invited
  • [Presentation] The mechanism of photosynthetic water oxidation in photosystem II and the application to artificial photosynthesis2014

    • Author(s)
      Takumi Noguchi
    • Organizer
      2014 International Conference on Artificial Photosynthesis
    • Place of Presentation
      Awaji City, Hyogo, Japan
    • Year and Date
      2014-11-24 – 2014-11-28
    • Invited
  • [Presentation] 光合成光化学系IIにおけるMnクラスターの損傷が電子受容側機能分子の酸化還元電位に及ぼす影響2014

    • Author(s)
      加藤祐樹、野口巧
    • Organizer
      電気化学秋季大会
    • Place of Presentation
      北大
    • Year and Date
      2014-09-27 – 2014-09-28
  • [Presentation] Target analysis of the photosystem II-enriched membrane: The effect of oxidizing agent on fluorescence quenching in PSII2014

    • Author(s)
      Ahmed Ali, Ryo Nagao, Takumi Noguchi, Hiroshi Fukumura, Yutaka Shibata,
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] Site-directed mutagenesis study of amino acid resides relevant to photosynthetic water oxidation in photosystem II2014

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Hanayo Ueoka-Nakanishi, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] Development of an artificial light-driven water splitting nano-device using photosynthetic proteins and metal nanoparticles2014

    • Author(s)
      Kazuki Tahara, Kousuke Kawahara, Keisuke Namie, Natsuko Inoue, Ryo Nagao, Yuki Kato, Tatsuya Tomo, Yutaka Shibata, Hiroshi Fukumura, Yasuhiro Kashino, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] Proton-coupled electron transfer mechanism in the S2-to-S3 transition of photosynthetic water oxidation as revealed by time-resolved infrared spectroscopy2014

    • Author(s)
      Hiroki Sakamoto, Ryo Nagao, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] Effect of the extrinsic proteins on the Cl− binding sites of the oxygen evolving center in photosystem II: Analysis by FTIR spectroscopy2014

    • Author(s)
      Junpei Kondo, Shin Nakamura, Ryo Nagao, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] Electron and proton transfer mechanism of the secondary quinone electron acceptor QB in photosystem II2014

    • Author(s)
      Yukihiro Kadekawa, Yuki Kato, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [Presentation] Molecular mechanism of photosynthetic water oxidation revealed by infrared spectroscopy with quantum chemical calculations2014

    • Author(s)
      Takumi Noguchi, Shin Nakamura
    • Organizer
      International Conference "Photosynthesis Research for Sustainability
    • Place of Presentation
      Pushchino, Russia
    • Year and Date
      2014-06-02 – 2014-06-07
    • Invited
  • [Presentation] FTIR spectroelectrochemical study on the influence of Mn-depletion on the redox potential of the non-heme iron and its surrounding structure in photosystem II2014

    • Author(s)
      Yuki Kato, Takumi Noguchi
    • Organizer
      International Conference "Photosynthesis Research for Sustainability"
    • Place of Presentation
      Pushchino, Russia
    • Year and Date
      2014-06-02 – 2014-06-07
    • Invited
  • [Presentation] Vibrational analyses of the water oxidizing center in photosystem II using QM/MM calculations2014

    • Author(s)
      Shin Nakamura, Takumi Noguchi
    • Organizer
      International Conference "Photosynthesis Research for Sustainability"
    • Place of Presentation
      Pushchino, Russia
    • Year and Date
      2014-06-02 – 2014-06-07
  • [Presentation] 時間分解赤外分光法による光合成水分解反応の解析2014

    • Author(s)
      坂本広樹、長尾遼、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Year and Date
      2014-05-30 – 2014-05-31
  • [Presentation] 光合成タンパク質と金属ナノ粒子による水素発生人工光合成ナノデバイスの開発2014

    • Author(s)
      田原一輝、河原弘典、浪江慶祐、井上名津子、長尾遼、加藤祐樹、鞆達也、柴田穣、福村裕史、菓子野康浩、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      近畿大学
    • Year and Date
      2014-05-30 – 2014-05-31
  • [Remarks] 名古屋大学理学研究科光生体エネルギー研究室ホームページ

    • URL

      http://www.glab.phys.nagoya-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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