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2015 Fiscal Year Annual Research Report

時計タンパク質の固有周波数の分子科学的解明

Research Project

Project/Area Number 25291039
Research InstitutionInstitute for Molecular Science

Principal Investigator

秋山 修志  分子科学研究所, 協奏分子システム研究センター, 教授 (50391842)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords生物時計
Outline of Annual Research Achievements

KaiC単独(KaiAやKaiBが無い状態)であっても,KaiCのATPase活性が減衰振動を示すことを見出した.観察された減衰型の緩和曲線を2次の伝達関数を用いて解析したところ,減衰振動成分の固有振動数は野生型で0.91/日と見積もられた.我々は周期の異なるKaiC変異体(株)についても同様の実験を行った.KaiC単独(野生型や変異体)の固有振動数が,KaiAやKaiBが共存する分子システムとしてのリズム(リン酸化リズムや転写翻訳リズム)の振動数と1対1対応していることを発見した.さらに,固有振動数がKaiCのATPase活性,とくにKaiCのN末端ドメインにあるATPase活性によって規定(ATPase活性が高い → 固有振動数が大きい)されることを証明した.
周期長を決めるATPase活性の制御機構を詳しく調べるため,KaiCのN末端ドメインの高分解能構造解析(最高1.76Å)を行い,野生型と周期変異体を含めて計9個の構造をデータベースに登録した.従来の構造解析では分解能が十分でなかった為に見落とされてきたが,我々が公開した新しい原子座標には機能を表出せしめている構造部位が鮮明に映し出されており,「遅さの根源となる不安定な局所構造」や「温度補償を実現する分子構造の対称性破れ」などを発見することができた.なかでもATPのリン酸基を求核攻撃する加水分解水は,高いATPase活性を示す他の酵素(ミオシンやキネシンなど)に比べて遠く離れた位置に隔離されており,絶対的な反応の遅さを生み出している構造要因の一つであることが示された.

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] PSL Research Univ., Chimie ParisTech(France)

    • Country Name
      France
    • Counterpart Institution
      PSL Research Univ., Chimie ParisTech
  • [Journal Article] Absolute slowness encoded in the circadian clock protein KaiC2016

    • Author(s)
      Abe J, Mukaiyama A, Akiyama S
    • Journal Title

      SPring-8 Research Frontiers 2015

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Open Access
  • [Journal Article] 時間生物学と放射光科学の接点2016

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Journal Title

      放射光

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 時計タンパク質KaiCの「遅さ」が刻み込まれた原子構造2016

    • Author(s)
      阿部 淳,向山 厚,秋山 修志
    • Journal Title

      SPring-8/SACLA利用者情報

      Volume: 21 Pages: 2-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Atomic-scale Origins of Slowness in the Cyanobacterial Circadian Clock2015

    • Author(s)
      Abe J, Hiyama T B, Mukaiyama A, Son S, Mori T, Saito S, Osako M, Wolanin J, Yamashita E, Kondo T, and Akiyama S
    • Journal Title

      Science

      Volume: 349 Pages: 312-316

    • DOI

      10.1126/science.1261040

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] タンパク質の化学反応が細胞内の時を計る2015

    • Author(s)
      向山 厚,阿部 淳,孫 世永,秋山 修志
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 33 Pages: 3119-3122

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] X-ray Solution Scattering as Research Tools for Bio-molecular Systems2016

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      Winter School of ASIA CORE Program
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2016-02-26 – 2016-02-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Circadian periodicity encoded in KaiC ATPase2016

    • Author(s)
      Mukaiyama A, Abe J, and Akiyama S
    • Organizer
      Winter School of ASIA CORE Program
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2016-02-26 – 2016-02-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Atomic-scale origins of slowness in the cyanobacterial circadian clock2016

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      8th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-02-16 – 2016-02-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 時計タンパク質 KaiC に書き込まれた生物時計の発振周期2015

    • Author(s)
      向山 厚, 阿部 淳, 檜山 卓也, 孫 世永, Wolanin Julie , 山下 栄樹, 近藤 孝男, 秋山 修志
    • Organizer
      第22回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-11-21 – 2015-11-21
  • [Presentation] 藍藻の時計タンパク質に内包された概日周期と遅さの根源2015

    • Author(s)
      秋山 修志
    • Organizer
      藍藻の分子生物学2015
    • Place of Presentation
      かずさアカデミアホール(千葉県木更津市)
    • Year and Date
      2015-11-16 – 2015-11-16
  • [Presentation] KaiC as Circadian Pacemaker of Cyanobacterial Circadian Clock2015

    • Author(s)
      Akiyama S
    • Organizer
      European Biological Rhythms Society (EBRS)/World Congress of Chronobiology (WCC) meeting
    • Place of Presentation
      Manchester, UK
    • Year and Date
      2015-08-06 – 2015-08-06
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 蛍光プローブの挿入による時計タンパク質KaiCの周期的構造変化の計測2015

    • Author(s)
      向山 厚,秋山 修志
    • Organizer
      第42回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      高崎シティーギャラリー(群馬県高松市)
    • Year and Date
      2015-06-13 – 2015-06-13

URL: 

Published: 2017-01-06  

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