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2015 Fiscal Year Annual Research Report

エピゲノムの維持と破綻のメカニズム

Research Project

Project/Area Number 25291078
Research InstitutionKinki University

Principal Investigator

佐渡 敬  近畿大学, 農学部, 教授 (70321601)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsエピジェネティクス / クロマチン
Outline of Annual Research Achievements

SmcHD1の機能欠損胚のメスでは,不活性X染色体の再活性化が起こり,胎生14日前後で致死となる.しかし,Smchd1欠損胚から調整した胚線維芽細胞(MEF)を用いて,不活性X染色体に集積することが知られるヒストン修飾を免疫染色で観察すると,正常胚の不活性X染色体と区別がつかない.ヘテロクロマチン状態は維持されているかに見える,このようなSmcHD1欠損胚における再活性化したX染色体のクロマチン状態を理解するために,ヒストンH3K27me3,H9K9me3,SmcHD1およびその相互作用因子であるHbix1に対する特異抗体を用いてChIP-seqを行った.その結果,免疫染色では区別できないような局所的な差異が一部に見出された.また,不活性X染色体の再活性化がどの程度の規模で起きているか知るために,RNA-seqも行った.この場合は,亜種間マウスの交配によるハイブリッドの胎仔より調製したMEFを用いたので,活性X染色体と不活性X染色体それぞれに由来する転写産物を塩基多型で区別することができるようにした.その結果,従来考えられていたよりも多くの遺伝子が不活性X染色体から発現していることがわかってきた.これはアレル特異的に遺伝子発現を解析することによって,以前行われたマイクロアレイを用いた解析に比べより高い解像度で解析することができたためと考えられる.さらに不活性X染色体の維持におけるSmcHD1の重要性を評価するため,CRISPR-Cas9によりMEFでSmcHD1の機能を阻害しその影響を調べた.こうした解析から得られた結果を基に,現在成果発表の準備を進めている.

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2015

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] A new Xist allele driven by a constitutively active promoter is dominated by Xist locus environment and exhibits the parent-of-origin effects.2015

    • Author(s)
      Amakawa, Y., Sakata, Y., Hoki, Y., Arata, S., Shioda, S., Fukagawa, T., Sasaki, H., and *Sado, T.
    • Journal Title

      Development

      Volume: 142 Pages: 4299-4308

    • DOI

      doi:10.1242/dev.128819

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] An Xist Activating Antisense RNA Required for X-chromosome Inactivation.2015

    • Author(s)
      Sarkar, M., Gayen, S., Kumar, S., Maclary, E., Buttigieg, E., Hinten, M., Kumari, A., Harris, C., Sado, T., and *Kalantry, S.
    • Journal Title

      Nature comm.

      Volume: 6 Pages: 8564

    • DOI

      doi: 10.1038/ncomms9564

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 哺乳類X染色体のエピジェネティクス2015

    • Author(s)
      佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] SmcHD1機能欠損マウス胚におけるX染色体不活性化2015

    • Author(s)
      榊原 祐樹,佐々木 裕之,Blewitt Marnie,佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] Xist RNAの核内係留因子を探索する系の確立2015

    • Author(s)
      千木 雄太,佐々木 裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

    • Author(s)
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] アリル特異的ChIP-seq法によるマウス不活性化X染色体のクロマチン動態の解析2015

    • Author(s)
      長尾 恒治,榊原 祐樹,柴田 幸子,野澤 竜介,坂口 武久,木村 宏,佐渡 敬,小布施 力史
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] 胚性幹細胞における単アレル性発現遺伝子の由来とその転写制御2015

    • Author(s)
      大石 裕晃,鵜木 元香,福田 渓,堀 恭平,前之原 章司,千葉 初音,佐渡 敬,佐々木 裕之
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] SmcHD1機能欠損マウス胚における X染色体不活性化2015

    • Author(s)
      榊原祐樹,Blewitt Marnie,佐々 木裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市(東北大学)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] 部分的機能欠損Xist アレルによるX染 色体不活性化の異常2015

    • Author(s)
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市(東北大学)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] マウス着床前胚におけるXist の差次的発現2015

    • Author(s)
      佐渡 敬,酒田祐佳,尼川裕 子,保木裕子,深川竜郎,佐々 木裕之
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市(東北大学)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] 部分的機能欠損Xistアレルからの発現様式の組織差2015

    • Author(s)
      中島達郎,保木裕子,佐々木裕之,佐渡 敬
    • Organizer
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • Place of Presentation
      東京都千代田区(学術総合センター)
    • Year and Date
      2015-05-25 – 2015-05-26
  • [Presentation] 機能欠損型Xist RNAによって構築される偽ヘテロクロマチン2015

    • Author(s)
      佐渡 敬
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学大会 合同年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市(神戸ポートアイランド)
    • Year and Date
      2015-04-01 – 2015-12-04
    • Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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