2014 Fiscal Year Annual Research Report
オセアニア集団における肥満・脂質代謝・糖代謝関連変異の探索と進化遺伝学的解析
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25291103
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
大橋 順 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (80301141)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
古澤 拓郎 京都大学, アジア・アフリカ地域研究研究科, 准教授 (50422457)
西田 奈央 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 肝炎・免疫研究センター, 上級研究員 (50456109)
中山 一大 自治医科大学, 医学部, 講師 (90433581)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | オセアニア / 肥満 / 脂質代謝 / 多様性 / 進化 / 自然選択 / 多型 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array Set（Affymetrix社製）を用いたゲノムワイドSNP解析をMundaに居住するソロモン人25検体、Kusageに居住するソロモン人25検体、Rawakiに居住するソロモン人25検体について行い、以前我々が解析したギデラ族25検体とトンガ人25検体のSNPデータ、HapMapデータベースのYRI集団、CEU集団、CHB集団、JPT集団とを併せたデータセットを作成した。次に、Human Genome Diversity Panelの53集団1043検体の660918個のSNP遺伝子型データと共通する19934個のSNPに対するデータセットを作成した。このデータセットに対して主成分分析を行い、(1)本研究の対象である全てのオセアニア集団はHapMapの東アジア集団と遺伝的に近いが、その多様性は高く、同じソロモン人であっても中国人と日本人との遺伝的差異以上の違いがあること、(2)ギデラ族はアジア系集団とは最も遺伝的に離れており、ギデラ族が初期のオセアニア移住者の子孫でること、(3)トンガ人は遺伝的に東南アジア集団（フィリピンやインドネシア）に近く、東南アジア起源であること、(4)ギデラ族とトンガ人との中間にソロモンのメラネシア人集団が位置することなどが確認された。これらの結果から、ポリネシア集団の祖先は、東南アジア起源であり、メラネシアで原住民と混血し、その後ポリネシア地域に拡散したことが示唆された。
オセアニア集団において、脂肪酸アミド加水分解酵素をコードするFAAH遺伝子上の非同義置換一塩基多型とBMIとが有意に関連することを見いだした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
オセアニア集団の遺伝構造の解析が終了し、肥満・脂質代謝関連変異の探索も順調に進展しているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
オセアニア人集団において、肥満・脂質代謝・糖代謝と正の関連をもつアリルに正の自然選択が作用したとすれば（すなわち倹約遺伝子仮説が正しければ）、当該アリルの頻度は急速に増加したと考えられ、その連鎖不平衡は遠方にまでおよぶと期待される。そこで、ゲノムワイドSNPデータをもとに、当該アリルを含むハプロタイプのホモ接合度を集団間で比較する統計手法、およびEHHを指標とするiHSテストによって、自然選択の痕跡を検出する。
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[Journal Article] IL28B polymorphisms and clinical implications for hepatitis C virus infection in Uzbekistan.2014
Author(s)
Khudayberganova D, Sugiyama M, Masaki N, Nishida N, Mukaide M, Sekler D, Latipov R, Nataliya K, Dildora S, Sharapov S, Usmanova G, Raxmanov M, Musabaev E, Mizokami M
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Journal Title
PLoS One
Volume: 9
Pages: e93011
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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