2015 Fiscal Year Annual Research Report
放線菌の土壌環境適応戦略に関わる遺伝子発現制御機構の解明
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25292040
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| Research Institution | National Institute for Agro-Environmental Sciences |
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Principal Investigator |
藤井 毅 国立研究開発法人 農業環境技術研究所, その他部局等, 領域長 (00354100)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
齋藤 明広 静岡理工科大学, 理工学部, 准教授 (50375614)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 遺伝子発現制御 / 転写カスケード / キチナーゼ / 抗生物質生産 / 放線菌 / 転写因子 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
各種転写因子と相同性を有し、遺伝子破壊によりキチナーゼが大量に生産されるようになる遺伝子の破壊株（昨年度作成）について、キチン存在下増殖中の破壊株から経時的にRNAを抽出し、キチナーゼをはじめキチン代謝関連遺伝子群とdasR遺伝子の発現量を野生株と比較した結果、この遺伝子の破壊株では、dasRやキチン代謝関連遺伝子群の転写量が増大しており、この転写因子様遺伝子が、これらdasRおよびキチン代謝関連遺伝子群の発現制御に関与していることが示唆された。
一方、アフィニティーバインディングアッセイにより得られたdasRのプロモーター領域に結合するタンパク質の部分アミノ酸配列を明らかにしたところ、すでにクローニングされている放線菌Streptomyces coelicolorのアミノ酸代謝や抗生物質生産に関与することが知られている転写因子であることが明らかとなった。しかし、大腸菌で大量生産させ精製した同転写因子タンパク質のdasRプロモーターに対する結合の配列特異性は低く、電荷等の非特異的な要因によってプロモーター断片に結合する可能性が示された。更に、その転写因子の欠損変異は、グルコースやジアセチルキトビオースの存在下でのdasRの転写量にほとんど影響が無く、コロイダルキチン存在下、あるいはコロイダルキチンとグルコースの共存下でのキチナーゼ生産性は変異株と野生株とほとんど変わらなかったことから、この転写因子は、dasR遺伝子の転写やキチン代謝関連遺伝子群の発現調節には関与していないことが明らかとなった。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] Uptake of a chitin-degradation product via the constitutive N-acetylglucosamine/N,N’-diacetylchitobiose binding protein NgcESCO of an ABC transporter in Streptomyces coelicolor A3(2)2015
Author(s)
Akihiro Saito, Chibaru Iinuma, Takayuki Ohnuma, Tomonori Shinya, Yusuke Kimura, Yuzusa Aoki, Liu Feng, Yoshitake Desaki, Naoto Shibuya, Tamo Fukamizo, Akikazu Ando, Takeshi Fujii, Kiyotaka Miyashita
Organizer
日本微生物生態学会
Place of Presentation
土浦亀城プラザ
Year and Date
2015-10-19 – 2015-10-19
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