2014 Fiscal Year Annual Research Report
森林資源保全のための樹木DNAバーコードの充実と精度の向上に関する研究
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25292098
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| Research Institution | Forestry and Forest Products Research Institute |
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Principal Investigator |
吉村 研介 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, チーム長 (30353915)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
勝木 俊雄 独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 主任研究員 (10353640)
吉丸 博志 独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 園長 (20353914)
能城 修一 独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, チーム長 (30343792)
山本 節子(鈴木節子) 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員 (70456622)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 分類形質 / 遺伝育種 / DNAバーコード / 日本産樹木 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
DNA バーコードとは、短いDNA 配列情報で、種の同定を行う手法であり、樹木のいかなる部位（葉、材、根、花粉など）からでもDNA が抽出できて、樹種の特定が出来るDNA バーコード情報の構築を目指している。これまで、森林総研と東北大学との共同による木材標本、さく葉標本、さらに大学演習林などに協力して収集した標本等、7000個体、1039種のさく葉標本とそのDNA を収集している。
ユニバーサルなプライマーが無く、解析が困難な葉緑体DNA のmatK 部分遺伝子領域を、累計で747種3500サンプル明らかにした。しかしながら実験に困難を伴うため、新たなプライマーを開発してテスト中である。DNA バーコードの種の識別能力は、rbcL部分配列では45.1%、trnH-psbA で68.8%、matK で65.7% であった。3領域を併せると、日本産樹木では77%程度の種識別が出来る。その結果、ブナ科、クスノキ科などでは、属を識別するのも困難な分類群が存在することが明らかとなった。
標本の個体情報および塩基配列情報は、JBOLI（Japanese Barcode of Life Initiative）が一員であるCBOL（Consortium for the Barcodeof Life）が運営する国際的なデータベースシステムBOLD（Barcode of Life Data Systems）に入力されており、一部の情報は、DNAバーコードデータベース (JBOL-DB)によって公開されている。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] DNA barcoding on Japanese woody plants2014
Author(s)
Kensuke Yoshimura, Suzuki Setsuko, Toshio Katsuki, Shuichi Noshiro, Hiroshi Yoshimaru
Organizer
Center for Environmental Biology and Ecosystem Studies, National Institute for Environmental Studies Symposium
Place of Presentation
国立環境研究所
Year and Date
2014-09-19
