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2015 Fiscal Year Annual Research Report

水稲根圏におけるメタンの動態に関わる微生物食物連鎖の構造と機能の解析

Research Project

Project/Area Number 25292207
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

村瀬 潤  名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (30285241)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 浅川 晋  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (50335014)
渡邉 健史  名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (60547016)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords水稲 / メタン酸化 / 根圏 / 微生物食物連鎖 / 原生生物 / メタン酸化細菌
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、水田におけるメタン動態のホットスポットである水稲根圏に焦点をあて、野外調査、室内実験によってメタンの動態に関わる微生物食物連鎖の構造を解析する。また、微生物食物網が水稲根圏におけるメタン生成古細菌、メタン酸化細菌群集の構造と機能に及ぼす影響を明らかにすることを目的としている。
本年度は、水稲根圏におけるメタン酸化菌とメタン酸化が駆動する微生物群集のはたらきを解析した。つくばFACE(Free Air CO2 Enrichment)実験圃場から幼穂形成期の水稲を採取し、根圏試料(根+根圏土壌)を13Cで標識したメタン雰囲気下で培養し、メタン由来の炭素を取り込んだ微生物群集を解析した。根圏土壌は遅滞期をともなわない速やかなメタン酸化活性を示し、培養後の土壌DNAを解析した結果、真正細菌、真核生物ともメタン由来の炭素を取り込んでいることが明らかとなり、根圏におけるメタン酸化微生物食物連鎖の存在が示された。根圏試料でメタン由来の炭素の取り込みに関わる真核微生物群集は、非根圏試料のそれとは大きく異なっており、根圏特有の微生物食物連鎖構造があることが示唆された。一方T4型ファージのカプシド遺伝子を対象とした解析では、バクテリオファージへのメタン由来炭素の取り込みは確認できなかった。
水稲の根からメタンを加えて無機塩培地によってメタン酸化細菌を集積培養し1株を分離した。分子生物学的、生化学的、形態学的解析の結果、分離株が新規のメタン酸化細菌であることが明らかとなり、本株を新属新種のメタン酸化細菌Methylomagnum ishizawaiとして提案した。
。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2015

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Methylomagnum ishizawai gen. nov., sp. nov., a mesophilic type I methanotroph isolated from rice rhizosphere2015

    • Author(s)
      Ashraf Khalifa, Chol Gyu Lee, Takuya Ogiso, Chihoko Ueno, Dayeri Dianou, Toyoko Demachi, Arata Katayama, Susumu Asakawa
    • Journal Title

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol.

      Volume: 61 Pages: 3527-3534

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.000451

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Community structure of microeukariotes in a rice rhizosphere revealed by DNA-based PCR-DGGE2015

    • Author(s)
      Rasit Asiloglu, Hiroki Honjo, Norikuni Saka, Susumu Asakawa, Jun Murase
    • Journal Title

      Soil Sci. Plant Nutr.

      Volume: 61 Pages: 761-768

    • DOI

      10.1080/00380768.2015.1049931

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Impact of long-term fertilizer treatment on the microeukaryotic community structure of a rice field soil.2015

    • Author(s)
      Jun Murase, Azusa Hida, Kaori Ogawa, Toshihiro Nonoyama, Nanako Yoshikawa, Katsuhiko Imai
    • Journal Title

      Soil Biol. Biochem.

      Volume: 80 Pages: 237-243

    • DOI

      10.1016/j.soilbio.2014.10.015

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 水田生態系に生息する新規typeIメタン酸化細菌の分離と同定2015

    • Author(s)
      浅川晋
    • Organizer
      日本微生物生態学会第30回大会
    • Place of Presentation
      土浦
    • Year and Date
      2015-10-17 – 2015-10-20
  • [Presentation] Spatial distribution and community structure of soil protists in the rice rhizosphere revealed by a "mini-rhizobox experiment"2015

    • Author(s)
      Rasit Asiloglu , Jun Murase
    • Organizer
      The 7th Japan-Taiwan-Korea (JTK) International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      土浦
    • Year and Date
      2015-10-17 – 2015-10-19
  • [Presentation] Methane-driven microbial food web in a rice field soil2015

    • Author(s)
      Jun Murase
    • Organizer
      International Synposiumm "From classic to Frontiers: Methanotrophy and Meta-omics"
    • Place of Presentation
      南京
    • Year and Date
      2015-09-21 – 2015-09-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Diversity and ecology of microeukaryotic community in a paddy soil2015

    • Author(s)
      Jun Murase
    • Organizer
      12th International Conference of East and Southeast Asia Federation of Soil Science Society
    • Place of Presentation
      南京
    • Year and Date
      2015-09-18 – 2015-09-21
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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