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2014 Fiscal Year Annual Research Report

PPRコードを利用した細胞質雄性不稔の稔性回復因子の同定と創成

Research Project

Project/Area Number 25292219
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

中村 崇裕  九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (10464398)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
KeywordsPPR / ミトコンドリア / 細胞質雄性不稔 / 植物
Outline of Annual Research Achievements

(1) Rfとして働く天然型PPR蛋白質の予測と同定
(a) 様々なアミノ酸多型を持つRf様遺伝子の機能検定  H25年度に予測した様々なダイコン品種、数十種、の実際の遺伝子機能の判定を行い、予測との比較を行った。
(b) 未同定Rf遺伝子の同定  H25年度に予測したorf352に作用する候補PPR遺伝子を順次HL-CMSイネに導入し、予測の結果を検証について実験的な検証を行った。
(2) PPR蛋白質の改変によるカスタムRfの創出
本年度は、昨年度の結果を踏まえて、構築したカスタムPPRタンパク質の機能性を動物培養細胞で検証する実験系を確立した。また、新たな生化学的な実験系として、alpha screen法によってタンパク質とRNAとの結合を解析する実験系を確立した。これら実験系を基に、いくつかの人工PPRタンパク質を構築、検証したところ、予想したRNA配列との特異的な結合を得ることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1) Rfとして働く天然型PPR蛋白質の予測と同定、に関して、目的とした課題を達成しつつある。
(2) PPR蛋白質の改変によるカスタムRfの創出、に関して、モデルアッセイ系を構築することができ、カスタムRf分子の設計が完了しつつある。

Strategy for Future Research Activity

計画通りに研究を進める。

Causes of Carryover

年度末時に予定していた研究が次年度に若干ずれこんだため

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度使用額77502円は研究試薬費として使用する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The potential for manipulating RNA with pentatricopeptide repeat proteins2014

    • Author(s)
      Yagi Y, Nakamura T, Small I.
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: 78 Pages: 772-782

    • DOI

      10.1111/tpj.12687

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Pentatricopeptide repeat motifs in the processing enzyme PRORP1 in Arabidopsis thaliana play a crucial role in recognition of nucleotide bases at TψC loop in precursor tRNAs.2014

    • Author(s)
      Imai T, Nakamura T, Maeda T, Nakayama K, Gao X, Nakashima T, Kakuta Y, Kimura M.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 450 Pages: 1541-1546

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.07.030

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantitative analysis of motifs contributing to the interaction between PLS-subfamily members and their target RNA sequences in plastid RNA editing.2014

    • Author(s)
      Okuda K, Shoki H, Arai M, Shikanai T, Small I, Nakamura T.
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: 80 Pages: 870-882

    • DOI

      10.1111/tpj.12377

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] PPR Motifs and Their Engineering2015

    • Author(s)
      Takahiro Nakamura
    • Organizer
      Gordon Research Conference "Chloroplast Biotechnology"
    • Place of Presentation
      Ventura, CA
    • Year and Date
      2015-01-18 – 2015-01-23
    • Invited
  • [Presentation] PPR motif as a New RNA/DNA Binding Module for Genome Editing2014

    • Author(s)
      Takahiro Nakamura
    • Organizer
      JAACT2014
    • Place of Presentation
      kitakyushu
    • Year and Date
      2014-11-11 – 2014-11-14
    • Invited
  • [Presentation] PPRタンパク質を用いたゲノム編集技術開発2014

    • Author(s)
      中村崇裕
    • Organizer
      植物ゲノム編集ワークショップ
    • Place of Presentation
      倉敷市
    • Year and Date
      2014-11-04 – 2014-11-04
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集と植物育種における現状2014

    • Author(s)
      中村崇裕
    • Organizer
      日本作物学会九州支部第91回講演会
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      2014-09-20 – 2014-09-21
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集の新しいDNA/RNA結合モジュール、PPRモチーフ2014

    • Author(s)
      中村崇裕
    • Organizer
      動物細胞工学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-06-20 – 2014-06-20
    • Invited
  • [Remarks] 九州大学 農学研究院 植物分子機能学

    • URL

      http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/lab/plantmb/index.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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